MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 1130

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017647	CCT	2	6	47603	47608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386627490
1002	NC_017647	AGG	2	6	47628	47633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386627490
1003	NC_017647	AATG	2	8	47635	47642	50 %	25 %	25 %	0 %	386627490
1004	NC_017647	A	6	6	47660	47665	100 %	0 %	0 %	0 %	386627490
1005	NC_017647	AT	3	6	47674	47679	50 %	50 %	0 %	0 %	386627490
1006	NC_017647	ATC	2	6	47735	47740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627491
1007	NC_017647	ATA	2	6	47756	47761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386627491
1008	NC_017647	GGA	2	6	47781	47786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386627491
1009	NC_017647	TCG	2	6	47810	47815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627491
1010	NC_017647	CCAC	2	8	47830	47837	25 %	0 %	0 %	75 %	386627491
1011	NC_017647	TG	3	6	47994	47999	0 %	50 %	50 %	0 %	386627491
1012	NC_017647	ATAC	2	8	48010	48017	50 %	25 %	0 %	25 %	386627491
1013	NC_017647	ATG	2	6	48156	48161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627491
1014	NC_017647	GTAA	2	8	48197	48204	50 %	25 %	25 %	0 %	386627491
1015	NC_017647	CCAC	2	8	48211	48218	25 %	0 %	0 %	75 %	386627491
1016	NC_017647	AAC	2	6	48387	48392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627491
1017	NC_017647	TCTT	2	8	48453	48460	0 %	75 %	0 %	25 %	386627491
1018	NC_017647	GAT	2	6	48502	48507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627491
1019	NC_017647	CAG	2	6	48599	48604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627491
1020	NC_017647	CAT	2	6	48608	48613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627491
1021	NC_017647	T	6	6	48613	48618	0 %	100 %	0 %	0 %	386627492
1022	NC_017647	GCG	2	6	48682	48687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627492
1023	NC_017647	GGT	2	6	48736	48741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627492
1024	NC_017647	CGC	2	6	49005	49010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017647	ACCTG	2	10	49046	49055	20 %	20 %	20 %	40 %	386627493
1026	NC_017647	GCTG	2	8	49073	49080	0 %	25 %	50 %	25 %	386627493
1027	NC_017647	TGC	2	6	49153	49158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627493
1028	NC_017647	CTG	2	6	49209	49214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627493
1029	NC_017647	GCA	2	6	49226	49231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627493
1030	NC_017647	TGA	2	6	49307	49312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627494
1031	NC_017647	TCTGG	2	10	49383	49392	0 %	40 %	40 %	20 %	386627494
1032	NC_017647	ATC	2	6	49411	49416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627494
1033	NC_017647	GAG	2	6	49502	49507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386627494
1034	NC_017647	TGGGGA	2	12	49588	49599	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386627494
1035	NC_017647	ATT	2	6	49600	49605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627494
1036	NC_017647	GGC	2	6	49674	49679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627494
1037	NC_017647	GTG	2	6	49692	49697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627494
1038	NC_017647	GTGG	2	8	49709	49716	0 %	25 %	75 %	0 %	386627494
1039	NC_017647	CAG	2	6	49721	49726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627494
1040	NC_017647	TTC	2	6	49733	49738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386627494
1041	NC_017647	GCT	2	6	49788	49793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627494
1042	NC_017647	GCT	2	6	49851	49856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627494
1043	NC_017647	CTG	2	6	49864	49869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627494
1044	NC_017647	GCG	2	6	49909	49914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627494
1045	NC_017647	T	6	6	49998	50003	0 %	100 %	0 %	0 %	386627494
1046	NC_017647	CTGATT	2	12	50073	50084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1047	NC_017647	TAA	2	6	50087	50092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017647	ACA	2	6	50093	50098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017647	CT	3	6	50135	50140	0 %	50 %	0 %	50 %	386627495
1050	NC_017647	ATT	2	6	50360	50365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627495
1051	NC_017647	G	6	6	50441	50446	0 %	0 %	100 %	0 %	386627495
1052	NC_017647	CAGC	2	8	50494	50501	25 %	0 %	25 %	50 %	386627495
1053	NC_017647	GA	3	6	50535	50540	50 %	0 %	50 %	0 %	386627495
1054	NC_017647	TGAA	2	8	50541	50548	50 %	25 %	25 %	0 %	386627495
1055	NC_017647	GA	3	6	50552	50557	50 %	0 %	50 %	0 %	386627495
1056	NC_017647	AGA	3	9	50592	50600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627495
1057	NC_017647	TTC	2	6	50666	50671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386627495
1058	NC_017647	AG	3	6	50755	50760	50 %	0 %	50 %	0 %	386627495
1059	NC_017647	CCA	2	6	50819	50824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627495
1060	NC_017647	ATG	2	6	50844	50849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627495
1061	NC_017647	T	6	6	50921	50926	0 %	100 %	0 %	0 %	386627495
1062	NC_017647	GGC	2	6	50935	50940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627495
1063	NC_017647	A	6	6	50960	50965	100 %	0 %	0 %	0 %	386627495
1064	NC_017647	AGT	2	6	51027	51032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017647	GGA	2	6	51044	51049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017647	CAT	2	6	51154	51159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627496
1067	NC_017647	CAC	2	6	51166	51171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627496
1068	NC_017647	CCA	2	6	51173	51178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627496
1069	NC_017647	A	7	7	51241	51247	100 %	0 %	0 %	0 %	386627496
1070	NC_017647	TGG	2	6	51323	51328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627496
1071	NC_017647	ATT	2	6	51334	51339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627496
1072	NC_017647	AC	3	6	51348	51353	50 %	0 %	0 %	50 %	386627496
1073	NC_017647	A	6	6	51428	51433	100 %	0 %	0 %	0 %	386627496
1074	NC_017647	TG	3	6	51477	51482	0 %	50 %	50 %	0 %	386627496
1075	NC_017647	TGCC	2	8	51496	51503	0 %	25 %	25 %	50 %	386627496
1076	NC_017647	AGG	2	6	51543	51548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386627496
1077	NC_017647	AAG	2	6	51549	51554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627496
1078	NC_017647	CCG	2	6	51583	51588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627496
1079	NC_017647	TGA	2	6	51625	51630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627496
1080	NC_017647	A	6	6	51636	51641	100 %	0 %	0 %	0 %	386627496
1081	NC_017647	CCT	2	6	51643	51648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_017647	AGG	2	6	51658	51663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017647	CAC	2	6	51922	51927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627497
1084	NC_017647	A	6	6	52046	52051	100 %	0 %	0 %	0 %	386627497
1085	NC_017647	CTG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627498
1086	NC_017647	CAT	2	6	52156	52161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627498
1087	NC_017647	GAA	2	6	52203	52208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627498
1088	NC_017647	GTT	2	6	52272	52277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627498
1089	NC_017647	TTAC	2	8	52460	52467	25 %	50 %	0 %	25 %	386627498
1090	NC_017647	TCA	2	6	52502	52507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627498
1091	NC_017647	GTAT	2	8	52647	52654	25 %	50 %	25 %	0 %	386627498
1092	NC_017647	AC	3	6	52664	52669	50 %	0 %	0 %	50 %	386627498
1093	NC_017647	GTGG	2	8	52827	52834	0 %	25 %	75 %	0 %	386627498
1094	NC_017647	CGA	2	6	52849	52854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627498
1095	NC_017647	CTC	2	6	52877	52882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386627498
1096	NC_017647	GCAGAA	2	12	52885	52896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386627498
1097	NC_017647	TTA	2	6	52902	52907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627498
1098	NC_017647	GAT	2	6	52924	52929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627498
1099	NC_017647	CTT	2	6	53002	53007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017647	AGA	2	6	53019	53024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017647	GGAA	2	8	53070	53077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017647	G	6	6	53164	53169	0 %	0 %	100 %	0 %	386627499
1103	NC_017647	GCA	2	6	53231	53236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627499
1104	NC_017647	AGC	2	6	53298	53303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627499
1105	NC_017647	AAT	2	6	53333	53338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386627499
1106	NC_017647	T	7	7	53352	53358	0 %	100 %	0 %	0 %	386627499
1107	NC_017647	T	6	6	53406	53411	0 %	100 %	0 %	0 %	386627499
1108	NC_017647	GT	3	6	53471	53476	0 %	50 %	50 %	0 %	386627500
1109	NC_017647	AT	3	6	53544	53549	50 %	50 %	0 %	0 %	386627500
1110	NC_017647	TAT	2	6	53558	53563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627500
1111	NC_017647	TG	3	6	53585	53590	0 %	50 %	50 %	0 %	386627500
1112	NC_017647	GTT	2	6	53608	53613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627500
1113	NC_017647	GGT	2	6	53717	53722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627500
1114	NC_017647	ATG	2	6	53731	53736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627500
1115	NC_017647	GAAT	2	8	53828	53835	50 %	25 %	25 %	0 %	386627500
1116	NC_017647	CCGGG	2	10	53853	53862	0 %	0 %	60 %	40 %	386627500
1117	NC_017647	ACA	2	6	53885	53890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627500
1118	NC_017647	TGC	2	6	53900	53905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627500
1119	NC_017647	ACA	2	6	53928	53933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627500
1120	NC_017647	C	6	6	53968	53973	0 %	0 %	0 %	100 %	386627500
1121	NC_017647	TAAA	2	8	53991	53998	75 %	25 %	0 %	0 %	386627500
1122	NC_017647	TCAT	2	8	54014	54021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_017647	AAAAC	2	10	54049	54058	80 %	0 %	0 %	20 %	386627501
1124	NC_017647	TCA	2	6	54088	54093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627501
1125	NC_017647	A	6	6	54107	54112	100 %	0 %	0 %	0 %	386627501
1126	NC_017647	TTA	2	6	54136	54141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627501
1127	NC_017647	CAG	3	9	54167	54175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627501
1128	NC_017647	ACC	2	6	54176	54181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627501
1129	NC_017647	TAA	2	6	54250	54255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386627501
1130	NC_017647	TAAT	2	8	54263	54270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous 1 23Next >