MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 109086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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109002	NC_017646	CCG	3	9	5309426	5309434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627420
109003	NC_017646	GTG	2	6	5309438	5309443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627420
109004	NC_017646	ACA	2	6	5309457	5309462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627420
109005	NC_017646	TGG	2	6	5309493	5309498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627420
109006	NC_017646	TAC	2	6	5309505	5309510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627420
109007	NC_017646	CTG	2	6	5309550	5309555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627420
109008	NC_017646	GGC	2	6	5309563	5309568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627420
109009	NC_017646	ATT	2	6	5309569	5309574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386627420
109010	NC_017646	CGC	2	6	5309576	5309581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386627420
109011	NC_017646	GC	3	6	5309591	5309596	0 %	0 %	50 %	50 %	386627420
109012	NC_017646	A	7	7	5309613	5309619	100 %	0 %	0 %	0 %	386627420
109013	NC_017646	TGC	2	6	5309656	5309661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627420
109014	NC_017646	A	6	6	5309868	5309873	100 %	0 %	0 %	0 %	386627420
109015	NC_017646	GTTT	2	8	5309913	5309920	0 %	75 %	25 %	0 %	386627420
109016	NC_017646	TTC	2	6	5310006	5310011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109017	NC_017646	CTG	2	6	5310030	5310035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109018	NC_017646	C	6	6	5310066	5310071	0 %	0 %	0 %	100 %	386627421
109019	NC_017646	ACC	2	6	5310086	5310091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386627421
109020	NC_017646	TGT	2	6	5310111	5310116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627421
109021	NC_017646	GAA	2	6	5310356	5310361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627421
109022	NC_017646	TGGTG	2	10	5310514	5310523	0 %	40 %	60 %	0 %	386627421
109023	NC_017646	AACGG	2	10	5310539	5310548	40 %	0 %	40 %	20 %	386627421
109024	NC_017646	CTG	2	6	5310693	5310698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627421
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109031	NC_017646	TATT	2	8	5311150	5311157	25 %	75 %	0 %	0 %	386627421
109032	NC_017646	TGT	2	6	5311191	5311196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627421
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109034	NC_017646	GC	3	6	5311257	5311262	0 %	0 %	50 %	50 %	386627421
109035	NC_017646	TGT	2	6	5311263	5311268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386627421
109036	NC_017646	TGG	3	9	5311284	5311292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627421
109037	NC_017646	GCTG	2	8	5311294	5311301	0 %	25 %	50 %	25 %	386627421
109038	NC_017646	ATG	2	6	5311304	5311309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627421
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109040	NC_017646	T	8	8	5311443	5311450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109041	NC_017646	GGT	2	6	5311454	5311459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109042	NC_017646	TGG	2	6	5311512	5311517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627422
109043	NC_017646	GAT	2	6	5311519	5311524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627422
109044	NC_017646	CGG	2	6	5311565	5311570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627422
109045	NC_017646	CAG	2	6	5311627	5311632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627422
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109047	NC_017646	ACG	2	6	5311789	5311794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627422
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109051	NC_017646	AG	3	6	5312053	5312058	50 %	0 %	50 %	0 %	386627422
109052	NC_017646	CAT	2	6	5312097	5312102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627422
109053	NC_017646	CCTG	2	8	5312239	5312246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109054	NC_017646	ATGC	2	8	5312247	5312254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109055	NC_017646	CAA	2	6	5312327	5312332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109056	NC_017646	CAT	2	6	5312333	5312338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109057	NC_017646	AT	3	6	5312467	5312472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109058	NC_017646	TGA	2	6	5312501	5312506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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109061	NC_017646	TAA	2	6	5312546	5312551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109062	NC_017646	CAT	2	6	5312564	5312569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109063	NC_017646	TAA	2	6	5312575	5312580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109068	NC_017646	T	6	6	5312698	5312703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109069	NC_017646	TAA	2	6	5312763	5312768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109078	NC_017646	TAC	2	6	5313078	5313083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627423
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109084	NC_017646	TGC	2	6	5313472	5313477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627423
109085	NC_017646	A	7	7	5313487	5313493	100 %	0 %	0 %	0 %	386627423
109086	NC_017646	A	6	6	5313505	5313510	100 %	0 %	0 %	0 %	386627423

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.