MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009

Total Repeats: 112059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
112001	NC_013353	CTG	2	6	5446740	5446745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260847290
112002	NC_013353	TGG	2	6	5446822	5446827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260847290
112003	NC_013353	TATT	2	8	5446934	5446941	25 %	75 %	0 %	0 %	260847290
112004	NC_013353	TGT	2	6	5446975	5446980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260847290
112005	NC_013353	TGT	2	6	5446993	5446998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260847290
112006	NC_013353	GC	3	6	5447041	5447046	0 %	0 %	50 %	50 %	260847290
112007	NC_013353	TGT	2	6	5447047	5447052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260847290
112008	NC_013353	TGG	3	9	5447068	5447076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260847290
112009	NC_013353	ATG	2	6	5447088	5447093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260847290
112010	NC_013353	AAG	2	6	5447152	5447157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260847290
112011	NC_013353	T	8	8	5447227	5447234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112012	NC_013353	GGT	2	6	5447238	5447243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112013	NC_013353	CAC	2	6	5447266	5447271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260847291
112014	NC_013353	TGG	2	6	5447296	5447301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260847291
112015	NC_013353	GAT	2	6	5447303	5447308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260847291
112016	NC_013353	CGG	2	6	5447349	5447354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260847291
112017	NC_013353	CAG	2	6	5447411	5447416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260847291
112018	NC_013353	AACG	2	8	5447517	5447524	50 %	0 %	25 %	25 %	260847291
112019	NC_013353	ACG	2	6	5447573	5447578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260847291
112020	NC_013353	TTC	2	6	5447579	5447584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260847291
112021	NC_013353	CAG	2	6	5447615	5447620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260847291
112022	NC_013353	AGA	2	6	5447778	5447783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260847291
112023	NC_013353	AG	3	6	5447837	5447842	50 %	0 %	50 %	0 %	260847291
112024	NC_013353	CAT	2	6	5447881	5447886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260847291
112025	NC_013353	CCTG	2	8	5448023	5448030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112026	NC_013353	ATGC	2	8	5448031	5448038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112027	NC_013353	CAA	2	6	5448111	5448116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260847292
112028	NC_013353	CAT	2	6	5448117	5448122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260847292
112029	NC_013353	AT	3	6	5448251	5448256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112030	NC_013353	TGA	2	6	5448285	5448290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112031	NC_013353	ATC	2	6	5448292	5448297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112032	NC_013353	ATT	2	6	5448323	5448328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112033	NC_013353	TAA	2	6	5448330	5448335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112034	NC_013353	CAT	2	6	5448348	5448353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112035	NC_013353	TAA	2	6	5448359	5448364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112036	NC_013353	GTG	2	6	5448367	5448372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112037	NC_013353	ATTT	2	8	5448388	5448395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112038	NC_013353	T	6	6	5448393	5448398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112039	NC_013353	T	6	6	5448436	5448441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112040	NC_013353	T	6	6	5448482	5448487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112041	NC_013353	TAA	2	6	5448547	5448552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112042	NC_013353	AAG	2	6	5448589	5448594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112043	NC_013353	ATT	2	6	5448616	5448621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260847293
112044	NC_013353	GCG	2	6	5448658	5448663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260847293
112045	NC_013353	AGCC	2	8	5448725	5448732	25 %	0 %	25 %	50 %	260847293
112046	NC_013353	ATT	2	6	5448763	5448768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260847293
112047	NC_013353	ATA	2	6	5448770	5448775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260847293
112048	NC_013353	CCA	2	6	5448830	5448835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260847293
112049	NC_013353	GC	3	6	5448838	5448843	0 %	0 %	50 %	50 %	260847293
112050	NC_013353	TAC	2	6	5448862	5448867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260847293
112051	NC_013353	TGG	2	6	5449007	5449012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260847293
112052	NC_013353	ACA	2	6	5449080	5449085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260847293
112053	NC_013353	GAC	2	6	5449158	5449163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260847293
112054	NC_013353	TGGCAG	2	12	5449166	5449177	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260847293
112055	NC_013353	ACA	2	6	5449203	5449208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260847293
112056	NC_013353	TGC	2	6	5449256	5449261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260847293
112057	NC_013353	A	7	7	5449271	5449277	100 %	0 %	0 %	0 %	260847293
112058	NC_013353	A	6	6	5449289	5449294	100 %	0 %	0 %	0 %	260847293
112059	NC_013353	AGTA	2	8	5449301	5449308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.