MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 2586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011749	GCT	2	6	118255	118260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692934
2502	NC_011749	TA	3	6	118305	118310	50 %	50 %	0 %	0 %	218692934
2503	NC_011749	TTA	2	6	118311	118316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692934
2504	NC_011749	GC	3	6	118331	118336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_011749	TTAT	2	8	118372	118379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011749	AAAATC	2	12	118406	118417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2507	NC_011749	AAAC	2	8	118428	118435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_011749	ATC	2	6	118517	118522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_011749	GCG	2	6	118546	118551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_011749	TGT	2	6	118614	118619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011749	GCG	2	6	118641	118646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_011749	T	6	6	118670	118675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011749	TTA	2	6	118682	118687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011749	AGA	2	6	118692	118697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_011749	TTG	2	6	118702	118707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011749	ATT	2	6	118718	118723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011749	CAA	3	9	118765	118773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_011749	GAA	2	6	118950	118955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011749	G	6	6	119090	119095	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011749	ATT	2	6	119104	119109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_011749	T	6	6	119122	119127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011749	CGC	2	6	119172	119177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_011749	AATC	2	8	119249	119256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_011749	AAT	2	6	119279	119284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011749	N	53	53	119326	119378	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011749	ACCT	2	8	119388	119395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_011749	TTG	2	6	119408	119413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011749	TAT	2	6	119414	119419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011749	TGTTTT	2	12	119420	119431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_011749	ATT	2	6	119522	119527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011749	TCA	2	6	119574	119579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_011749	TCT	2	6	119584	119589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_011749	ACC	2	6	119600	119605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_011749	AC	3	6	119606	119611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_011749	A	6	6	119622	119627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_011749	T	7	7	119644	119650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_011749	ATT	3	9	119657	119665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_011749	CTG	2	6	119667	119672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_011749	CATC	2	8	119699	119706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_011749	T	8	8	119759	119766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011749	A	6	6	119885	119890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_011749	AGG	2	6	119902	119907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011749	GACA	2	8	119909	119916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_011749	ATTTTT	2	12	119940	119951	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_011749	ATCA	2	8	120009	120016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2546	NC_011749	TATT	2	8	120017	120024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_011749	ACA	2	6	120041	120046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_011749	A	6	6	120107	120112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011749	AATT	2	8	120127	120134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_011749	GAA	2	6	120151	120156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_011749	ATGGT	2	10	120274	120283	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011749	AT	3	6	120341	120346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_011749	TC	4	8	120389	120396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2554	NC_011749	GGC	2	6	120487	120492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_011749	CTG	2	6	120497	120502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_011749	AGCTG	2	10	120511	120520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2557	NC_011749	GGA	2	6	120532	120537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_011749	TC	3	6	120655	120660	0 %	50 %	0 %	50 %	218692935
2559	NC_011749	CCG	2	6	120662	120667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218692935
2560	NC_011749	CCGG	2	8	120691	120698	0 %	0 %	50 %	50 %	218692935
2561	NC_011749	GCCA	2	8	120712	120719	25 %	0 %	25 %	50 %	218692935
2562	NC_011749	CTGA	2	8	120724	120731	25 %	25 %	25 %	25 %	218692935
2563	NC_011749	GCA	2	6	120749	120754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692935
2564	NC_011749	CGG	2	6	120906	120911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218692935
2565	NC_011749	ATTAC	2	10	120992	121001	40 %	40 %	0 %	20 %	218692935
2566	NC_011749	GCCA	2	8	121016	121023	25 %	0 %	25 %	50 %	218692935
2567	NC_011749	TTAT	2	8	121126	121133	25 %	75 %	0 %	0 %	218692935
2568	NC_011749	ACTG	2	8	121189	121196	25 %	25 %	25 %	25 %	218692935
2569	NC_011749	GGCA	2	8	121244	121251	25 %	0 %	50 %	25 %	218692936
2570	NC_011749	TCCTT	2	10	121267	121276	0 %	60 %	0 %	40 %	218692936
2571	NC_011749	GCA	2	6	121399	121404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692936
2572	NC_011749	TCA	2	6	121412	121417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692936
2573	NC_011749	CGAC	2	8	121435	121442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_011749	TCC	2	6	121508	121513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_011749	GCA	2	6	121515	121520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_011749	TCA	2	6	121614	121619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_011749	AGAC	2	8	121872	121879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_011749	A	6	6	121885	121890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_011749	CGC	2	6	121898	121903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_011749	AT	3	6	121948	121953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_011749	TGT	2	6	122006	122011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011749	ATGA	2	8	122066	122073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_011749	CAA	2	6	122075	122080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_011749	AAGT	2	8	122217	122224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_011749	GTT	2	6	122260	122265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_011749	TCAG	2	8	122289	122296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.