MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 3605

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 4 5 6 78Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009837	TTC	2	6	168505	168510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418279
3502	NC_009837	GAA	2	6	168519	168524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418279
3503	NC_009837	CAG	2	6	168547	168552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418279
3504	NC_009837	CTGC	2	8	168609	168616	0 %	25 %	25 %	50 %	157418279
3505	NC_009837	CCG	2	6	168640	168645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418279
3506	NC_009837	CAC	2	6	168679	168684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418279
3507	NC_009837	GCG	2	6	168694	168699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418279
3508	NC_009837	ATGA	2	8	168739	168746	50 %	25 %	25 %	0 %	157418279
3509	NC_009837	GGA	2	6	168773	168778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009837	T	6	6	168822	168827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009837	CAA	2	6	168957	168962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009837	ATT	2	6	168978	168983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009837	CAA	2	6	168986	168991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_009837	GTT	2	6	169069	169074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009837	TTC	2	6	169106	169111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_009837	TAA	2	6	169138	169143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009837	TGT	2	6	169164	169169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009837	CT	3	6	169248	169253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_009837	CCAT	2	8	169284	169291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_009837	AG	3	6	169375	169380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009837	AATT	2	8	169388	169395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009837	AAAT	2	8	169516	169523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_009837	AAT	3	9	169521	169529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_009837	TGATTA	2	12	169532	169543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009837	AT	3	6	169645	169650	50 %	50 %	0 %	0 %	157418280
3526	NC_009837	CAT	2	6	169663	169668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418280
3527	NC_009837	ATT	2	6	169691	169696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418280
3528	NC_009837	AT	3	6	169741	169746	50 %	50 %	0 %	0 %	157418280
3529	NC_009837	TTCTG	2	10	169780	169789	0 %	60 %	20 %	20 %	157418280
3530	NC_009837	GAC	2	6	169913	169918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418280
3531	NC_009837	ATGG	2	8	170204	170211	25 %	25 %	50 %	0 %	157418280
3532	NC_009837	CAA	2	6	170271	170276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418280
3533	NC_009837	TTA	2	6	170277	170282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418280
3534	NC_009837	CTCG	2	8	170285	170292	0 %	25 %	25 %	50 %	157418280
3535	NC_009837	TCT	2	6	170376	170381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418280
3536	NC_009837	CT	3	6	170455	170460	0 %	50 %	0 %	50 %	157418280
3537	NC_009837	TTA	2	6	170509	170514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418280
3538	NC_009837	TGA	2	6	170590	170595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418280
3539	NC_009837	CTG	2	6	170609	170614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418280
3540	NC_009837	GAA	3	9	170647	170655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418280
3541	NC_009837	GCA	2	6	170672	170677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418280
3542	NC_009837	AAGA	2	8	170789	170796	75 %	0 %	25 %	0 %	157418280
3543	NC_009837	GAA	2	6	170801	170806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418280
3544	NC_009837	A	6	6	170821	170826	100 %	0 %	0 %	0 %	157418280
3545	NC_009837	TGG	2	6	170924	170929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418281
3546	NC_009837	TAC	2	6	171010	171015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418281
3547	NC_009837	GCC	2	6	171031	171036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418281
3548	NC_009837	GACTGG	2	12	171209	171220	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	157418281
3549	NC_009837	CAT	2	6	171232	171237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418281
3550	NC_009837	CAG	2	6	171262	171267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418281
3551	NC_009837	AAG	2	6	171359	171364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418281
3552	NC_009837	TGAA	2	8	171377	171384	50 %	25 %	25 %	0 %	157418281
3553	NC_009837	GTA	2	6	171406	171411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418281
3554	NC_009837	TG	3	6	171464	171469	0 %	50 %	50 %	0 %	157418281
3555	NC_009837	ATC	2	6	171478	171483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418281
3556	NC_009837	TCGA	2	8	171566	171573	25 %	25 %	25 %	25 %	157418281
3557	NC_009837	CAC	2	6	171627	171632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418281
3558	NC_009837	TGT	2	6	171678	171683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418281
3559	NC_009837	CTG	2	6	171812	171817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418281
3560	NC_009837	ACA	2	6	171881	171886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418281
3561	NC_009837	GTT	2	6	171963	171968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418281
3562	NC_009837	ACT	2	6	171976	171981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418281
3563	NC_009837	TTA	2	6	172013	172018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418281
3564	NC_009837	ACA	2	6	172049	172054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418281
3565	NC_009837	TCTT	2	8	172082	172089	0 %	75 %	0 %	25 %	157418281
3566	NC_009837	AAC	2	6	172129	172134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418281
3567	NC_009837	TG	3	6	172161	172166	0 %	50 %	50 %	0 %	157418281
3568	NC_009837	AC	3	6	172353	172358	50 %	0 %	0 %	50 %	157418281
3569	NC_009837	TGA	2	6	172427	172432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418281
3570	NC_009837	CAT	2	6	172434	172439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418281
3571	NC_009837	GAAC	2	8	172456	172463	50 %	0 %	25 %	25 %	157418281
3572	NC_009837	TAT	2	6	172524	172529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418281
3573	NC_009837	TGG	2	6	172554	172559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418281
3574	NC_009837	TA	3	6	172632	172637	50 %	50 %	0 %	0 %	157418281
3575	NC_009837	GCT	2	6	172648	172653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418281
3576	NC_009837	TGC	2	6	172656	172661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418281
3577	NC_009837	T	7	7	172663	172669	0 %	100 %	0 %	0 %	157418281
3578	NC_009837	GCA	2	6	172717	172722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418281
3579	NC_009837	AAT	2	6	172754	172759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418281
3580	NC_009837	AT	3	6	172758	172763	50 %	50 %	0 %	0 %	157418281
3581	NC_009837	ATC	2	6	172773	172778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418282
3582	NC_009837	GAA	2	6	172918	172923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418282
3583	NC_009837	TGA	2	6	172961	172966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418282
3584	NC_009837	TAA	2	6	172971	172976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418282
3585	NC_009837	ATAGCT	2	12	172981	172992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157418282
3586	NC_009837	GGC	2	6	173061	173066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418282
3587	NC_009837	A	7	7	173082	173088	100 %	0 %	0 %	0 %	157418282
3588	NC_009837	GAA	2	6	173215	173220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418282
3589	NC_009837	CG	3	6	173232	173237	0 %	0 %	50 %	50 %	157418282
3590	NC_009837	TGC	2	6	173243	173248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3591	NC_009837	AAT	2	6	173263	173268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157418282
3592	NC_009837	CAA	2	6	173293	173298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418282
3593	NC_009837	ACC	2	6	173302	173307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418282
3594	NC_009837	CAG	2	6	173311	173316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3595	NC_009837	TCG	2	6	173380	173385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3596	NC_009837	GCA	2	6	173403	173408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3597	NC_009837	CAG	2	6	173473	173478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3598	NC_009837	GCCT	2	8	173543	173550	0 %	25 %	25 %	50 %	157418282
3599	NC_009837	GCTA	2	8	173631	173638	25 %	25 %	25 %	25 %	157418282
3600	NC_009837	CAG	2	6	173700	173705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3601	NC_009837	CGGT	2	8	173735	173742	0 %	25 %	50 %	25 %	157418282
3602	NC_009837	TGC	2	6	173906	173911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3603	NC_009837	GAA	2	6	173932	173937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418282
3604	NC_009837	CGT	2	6	174031	174036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418282
3605	NC_009837	A	6	6	174232	174237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous 1 2 3 4 5 6 78Next >