MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009837	GCGA	2	8	46701	46708	25 %	0 %	50 %	25 %	157418141
1002	NC_009837	CGG	2	6	46747	46752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418141
1003	NC_009837	GTT	2	6	46796	46801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418141
1004	NC_009837	GGGC	2	8	46808	46815	0 %	0 %	75 %	25 %	157418141
1005	NC_009837	CCTG	2	8	46828	46835	0 %	25 %	25 %	50 %	157418141
1006	NC_009837	CA	3	6	46933	46938	50 %	0 %	0 %	50 %	157418141
1007	NC_009837	CCT	2	6	47049	47054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418141
1008	NC_009837	GGT	2	6	47059	47064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1009	NC_009837	CAG	2	6	47150	47155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1010	NC_009837	TGG	2	6	47178	47183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1011	NC_009837	TGG	2	6	47208	47213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1012	NC_009837	CTG	2	6	47216	47221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1013	NC_009837	TGC	2	6	47239	47244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1014	NC_009837	ATGTGG	2	12	47313	47324	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157418141
1015	NC_009837	CTG	2	6	47345	47350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1016	NC_009837	CGT	2	6	47361	47366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1017	NC_009837	TTC	2	6	47385	47390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418141
1018	NC_009837	AGG	2	6	47409	47414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418141
1019	NC_009837	GA	3	6	47432	47437	50 %	0 %	50 %	0 %	157418141
1020	NC_009837	GGT	2	6	47521	47526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1021	NC_009837	CA	3	6	47554	47559	50 %	0 %	0 %	50 %	157418141
1022	NC_009837	TGC	2	6	47589	47594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1023	NC_009837	TGGGGC	2	12	47619	47630	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	157418141
1024	NC_009837	CGGT	2	8	47643	47650	0 %	25 %	50 %	25 %	157418141
1025	NC_009837	GCT	2	6	47710	47715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1026	NC_009837	GCAGC	2	10	47716	47725	20 %	0 %	40 %	40 %	157418141
1027	NC_009837	TGG	2	6	47778	47783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1028	NC_009837	GTG	2	6	47847	47852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1029	NC_009837	CAG	2	6	47900	47905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1030	NC_009837	TGC	2	6	47914	47919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1031	NC_009837	CAT	2	6	47929	47934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418141
1032	NC_009837	AGG	2	6	48054	48059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418141
1033	NC_009837	GCA	2	6	48127	48132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1034	NC_009837	ATG	2	6	48291	48296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418141
1035	NC_009837	CGT	2	6	48380	48385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1036	NC_009837	TGG	2	6	48423	48428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1037	NC_009837	CGGA	2	8	48681	48688	25 %	0 %	50 %	25 %	157418141
1038	NC_009837	CAG	2	6	48689	48694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1039	NC_009837	TGGCC	2	10	48739	48748	0 %	20 %	40 %	40 %	157418141
1040	NC_009837	AGC	2	6	48876	48881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1041	NC_009837	GTG	2	6	49037	49042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1042	NC_009837	GCCG	2	8	49043	49050	0 %	0 %	50 %	50 %	157418141
1043	NC_009837	CAGG	2	8	49064	49071	25 %	0 %	50 %	25 %	157418141
1044	NC_009837	CTG	2	6	49304	49309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1045	NC_009837	GTG	3	9	49364	49372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1046	NC_009837	GTC	2	6	49389	49394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1047	NC_009837	GGT	2	6	49418	49423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418141
1048	NC_009837	G	6	6	49431	49436	0 %	0 %	100 %	0 %	157418141
1049	NC_009837	CAG	2	6	49447	49452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1050	NC_009837	CCG	2	6	49528	49533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418141
1051	NC_009837	ACCTG	2	10	49585	49594	20 %	20 %	20 %	40 %	157418141
1052	NC_009837	CTG	2	6	49748	49753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1053	NC_009837	GCA	2	6	49765	49770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418141
1054	NC_009837	TGA	2	6	49846	49851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418142
1055	NC_009837	AACAC	2	10	49866	49875	60 %	0 %	0 %	40 %	157418142
1056	NC_009837	CTGGT	2	10	49923	49932	0 %	40 %	40 %	20 %	157418142
1057	NC_009837	ATC	2	6	49950	49955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418142
1058	NC_009837	AGG	2	6	50107	50112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418142
1059	NC_009837	TGG	2	6	50250	50255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418142
1060	NC_009837	GCT	2	6	50327	50332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418142
1061	NC_009837	GCCT	2	8	50397	50404	0 %	25 %	25 %	50 %	157418142
1062	NC_009837	GCTG	2	8	50405	50412	0 %	25 %	50 %	25 %	157418142
1063	NC_009837	CCA	2	6	50434	50439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418142
1064	NC_009837	GCG	2	6	50448	50453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418142
1065	NC_009837	GGCC	2	8	50456	50463	0 %	0 %	50 %	50 %	157418142
1066	NC_009837	TGA	2	6	50467	50472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418142
1067	NC_009837	T	6	6	50537	50542	0 %	100 %	0 %	0 %	157418142
1068	NC_009837	TG	3	6	50588	50593	0 %	50 %	50 %	0 %	157418142
1069	NC_009837	ATG	2	6	50600	50605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009837	TTA	2	6	50622	50627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009837	ACA	2	6	50632	50637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_009837	GGAA	2	8	50709	50716	50 %	0 %	50 %	0 %	157418143
1073	NC_009837	CTG	2	6	50773	50778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418143
1074	NC_009837	CCTT	2	8	50779	50786	0 %	50 %	0 %	50 %	157418143
1075	NC_009837	GTC	2	6	50867	50872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418143
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1077	NC_009837	GTAT	2	8	50932	50939	25 %	50 %	25 %	0 %	157418143
1078	NC_009837	TGGG	2	8	50975	50982	0 %	25 %	75 %	0 %	157418143
1079	NC_009837	CAGC	2	8	51033	51040	25 %	0 %	25 %	50 %	157418143
1080	NC_009837	ATGA	2	8	51079	51086	50 %	25 %	25 %	0 %	157418143
1081	NC_009837	CTT	2	6	51098	51103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418143
1082	NC_009837	AGA	2	6	51134	51139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418143
1083	NC_009837	TTC	2	6	51205	51210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418143
1084	NC_009837	AG	3	6	51294	51299	50 %	0 %	50 %	0 %	157418143
1085	NC_009837	GTT	2	6	51328	51333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418143
1086	NC_009837	CCA	2	6	51358	51363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418143
1087	NC_009837	ATG	2	6	51383	51388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418143
1088	NC_009837	T	6	6	51460	51465	0 %	100 %	0 %	0 %	157418143
1089	NC_009837	GGC	2	6	51474	51479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418143
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1091	NC_009837	AGT	2	6	51566	51571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009837	GGA	2	6	51583	51588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009837	CAT	2	6	51693	51698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418144
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1095	NC_009837	CCA	2	6	51712	51717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157418144
1096	NC_009837	GGC	2	6	51774	51779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418144
1097	NC_009837	GAA	2	6	51780	51785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418144
1098	NC_009837	TGG	2	6	51862	51867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418144
1099	NC_009837	A	6	6	51967	51972	100 %	0 %	0 %	0 %	157418144
1100	NC_009837	TG	3	6	52016	52021	0 %	50 %	50 %	0 %	157418144
1101	NC_009837	TGCC	2	8	52035	52042	0 %	25 %	25 %	50 %	157418144
1102	NC_009837	AGG	3	9	52082	52090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418144
1103	NC_009837	CGC	2	6	52123	52128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418144
1104	NC_009837	A	7	7	52175	52181	100 %	0 %	0 %	0 %	157418144
1105	NC_009837	ATT	2	6	52265	52270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009837	AAT	2	6	52277	52282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009837	GAC	2	6	52286	52291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_009837	GAG	2	6	52299	52304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009837	AATG	2	8	52311	52318	50 %	25 %	25 %	0 %	157418145
1110	NC_009837	CGG	2	6	52368	52373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418145
1111	NC_009837	TGGA	2	8	52405	52412	25 %	25 %	50 %	0 %	157418145
1112	NC_009837	CTGC	2	8	52436	52443	0 %	25 %	25 %	50 %	157418145
1113	NC_009837	A	6	6	52527	52532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009837	T	7	7	52587	52593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009837	T	6	6	52641	52646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009837	TG	3	6	52707	52712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009837	G	6	6	52725	52730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009837	AT	3	6	52778	52783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009837	TAT	2	6	52792	52797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009837	CAGA	2	8	52852	52859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_009837	ACA	2	6	52884	52889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009837	C	7	7	52948	52954	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1123	NC_009837	AAGT	2	8	52967	52974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009837	TAT	2	6	53047	53052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418146
1125	NC_009837	CGG	2	6	53055	53060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418146
1126	NC_009837	ACT	2	6	53163	53168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418146
1127	NC_009837	CTT	2	6	53180	53185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418146
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1129	NC_009837	GTG	2	6	53316	53321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418146
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