MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 plasmid pAPEC-O1-ColBM

Total Repeats: 3605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009837	TGC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009837	ATG	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418084
3	NC_009837	CCT	2	6	81	86	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157418084
4	NC_009837	GTG	2	6	104	109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418084
5	NC_009837	CCG	2	6	126	131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418084
6	NC_009837	A	6	6	307	312	100 %	0 %	0 %	0 %	157418085
7	NC_009837	GCTG	2	8	419	426	0 %	25 %	50 %	25 %	157418085
8	NC_009837	GTT	2	6	457	462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418085
9	NC_009837	CTG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418085
10	NC_009837	GTG	2	6	532	537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418085
11	NC_009837	TGGC	2	8	552	559	0 %	25 %	50 %	25 %	157418085
12	NC_009837	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418085
13	NC_009837	GC	3	6	824	829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009837	ACG	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009837	ATT	2	6	888	893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009837	T	6	6	922	927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009837	AAC	2	6	948	953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009837	T	6	6	961	966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009837	ACT	2	6	968	973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009837	TGT	2	6	983	988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009837	ATG	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229776985
22	NC_009837	AGC	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229776985
23	NC_009837	TCT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229776985
24	NC_009837	ACG	2	6	1346	1351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229776985
25	NC_009837	CCG	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229776985
26	NC_009837	TGC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229776985
27	NC_009837	CCTTC	2	10	1556	1565	0 %	40 %	0 %	60 %	229776985
28	NC_009837	ATT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229776985
29	NC_009837	TGA	2	6	1685	1690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229776985
30	NC_009837	ATG	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229776985
31	NC_009837	TCATTG	2	12	1762	1773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229776985
32	NC_009837	GC	3	6	1777	1782	0 %	0 %	50 %	50 %	229776985
33	NC_009837	TGT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229776985
34	NC_009837	TGC	2	6	1817	1822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229776985
35	NC_009837	CTG	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229776985
36	NC_009837	GTT	2	6	1853	1858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229776985
37	NC_009837	AGTAAT	2	12	1965	1976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	229776985
38	NC_009837	TGGA	2	8	1992	1999	25 %	25 %	50 %	0 %	229776985
39	NC_009837	A	6	6	2036	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	229776985
40	NC_009837	TGT	2	6	2042	2047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229776985
41	NC_009837	TGG	2	6	2304	2309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418087
42	NC_009837	GC	3	6	2321	2326	0 %	0 %	50 %	50 %	157418087
43	NC_009837	GAT	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418087
44	NC_009837	CTT	2	6	2499	2504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418087
45	NC_009837	CAG	2	6	2519	2524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418087
46	NC_009837	GCC	2	6	2577	2582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418087
47	NC_009837	GCT	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418087
48	NC_009837	TGGT	2	8	2625	2632	0 %	50 %	50 %	0 %	157418087
49	NC_009837	GAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418087
50	NC_009837	CAA	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418087
51	NC_009837	GAAT	2	8	2734	2741	50 %	25 %	25 %	0 %	157418087
52	NC_009837	GCTG	2	8	2761	2768	0 %	25 %	50 %	25 %	157418087
53	NC_009837	ATT	2	6	2792	2797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157418087
54	NC_009837	GTT	2	6	2834	2839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418087
55	NC_009837	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	157418087
56	NC_009837	AGA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418087
57	NC_009837	AGC	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418087
58	NC_009837	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	157418087
59	NC_009837	GAA	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418087
60	NC_009837	TCA	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418087
61	NC_009837	TAGA	2	8	3111	3118	50 %	25 %	25 %	0 %	157418087
62	NC_009837	AG	3	6	3142	3147	50 %	0 %	50 %	0 %	157418087
63	NC_009837	TAAC	2	8	3257	3264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009837	TTG	2	6	3434	3439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009837	TTG	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009837	TTG	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009837	TGCC	2	8	3776	3783	0 %	25 %	25 %	50 %	157418088
68	NC_009837	AGTG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	50 %	0 %	157418088
69	NC_009837	TG	3	6	3790	3795	0 %	50 %	50 %	0 %	157418088
70	NC_009837	TGC	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418088
71	NC_009837	CCGCC	2	10	3850	3859	0 %	0 %	20 %	80 %	157418088
72	NC_009837	GCA	2	6	3916	3921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418088
73	NC_009837	ATG	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418088
74	NC_009837	GAA	2	6	4006	4011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418088
75	NC_009837	TTC	2	6	4050	4055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009837	AGTT	2	8	4144	4151	25 %	50 %	25 %	0 %	157418089
77	NC_009837	CTT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418089
78	NC_009837	G	7	7	4176	4182	0 %	0 %	100 %	0 %	157418089
79	NC_009837	GTC	2	6	4206	4211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
80	NC_009837	GCG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
81	NC_009837	GCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418089
82	NC_009837	CTG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
83	NC_009837	ATG	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418089
84	NC_009837	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
85	NC_009837	ACT	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418089
86	NC_009837	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418089
87	NC_009837	GGA	2	6	4501	4506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418089
88	NC_009837	T	6	6	4548	4553	0 %	100 %	0 %	0 %	157418089
89	NC_009837	CAT	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418089
90	NC_009837	CTG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418089
91	NC_009837	GCC	2	6	4884	4889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418089
92	NC_009837	GCG	2	6	4957	4962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
93	NC_009837	CGG	2	6	5003	5008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
94	NC_009837	C	6	6	5097	5102	0 %	0 %	0 %	100 %	157418089
95	NC_009837	AGCC	2	8	5112	5119	25 %	0 %	25 %	50 %	157418089
96	NC_009837	GCA	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157418089
97	NC_009837	CGG	3	9	5155	5163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418089
98	NC_009837	TATGC	2	10	5310	5319	20 %	40 %	20 %	20 %	157418090
99	NC_009837	GGCAC	2	10	5350	5359	20 %	0 %	40 %	40 %	157418090
100	NC_009837	AAC	2	6	5383	5388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157418090
101	NC_009837	GGA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418090
102	NC_009837	GTCT	2	8	5447	5454	0 %	50 %	25 %	25 %	157418090
103	NC_009837	A	6	6	5519	5524	100 %	0 %	0 %	0 %	157418090
104	NC_009837	ATG	2	6	5587	5592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157418090
105	NC_009837	CAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157418090
106	NC_009837	AC	3	6	5737	5742	50 %	0 %	0 %	50 %	157418090
107	NC_009837	ACGG	2	8	5830	5837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009837	GGC	2	6	5838	5843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009837	GCC	2	6	5847	5852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_009837	GTG	2	6	5944	5949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418091
111	NC_009837	GTT	2	6	6064	6069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157418091
112	NC_009837	GGA	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157418091
113	NC_009837	TGC	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418091
114	NC_009837	GTGATG	2	12	6148	6159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157418091
115	NC_009837	GAA	2	6	6232	6237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157418091
116	NC_009837	GA	3	6	6239	6244	50 %	0 %	50 %	0 %	157418091
117	NC_009837	GCG	2	6	6347	6352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009837	CAC	2	6	6377	6382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009837	TTG	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009837	CAG	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009837	GGT	2	6	6441	6446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009837	GCC	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009837	CG	3	6	6513	6518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009837	C	6	6	6521	6526	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_009837	GGAAG	2	10	6546	6555	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009837	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009837	TTC	3	9	6656	6664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157418092
128	NC_009837	TCCTCT	2	12	6669	6680	0 %	50 %	0 %	50 %	157418092
129	NC_009837	GGCGG	2	10	6726	6735	0 %	0 %	80 %	20 %	157418092
130	NC_009837	CGC	2	6	6828	6833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157418092
131	NC_009837	CGT	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418092
132	NC_009837	GCG	2	6	6929	6934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157418092
133	NC_009837	TGCC	2	8	6948	6955	0 %	25 %	25 %	50 %	157418092
134	NC_009837	CA	3	6	6962	6967	50 %	0 %	0 %	50 %	157418092
135	NC_009837	ACTG	2	8	7017	7024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009837	T	6	6	7052	7057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009837	A	6	6	7072	7077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009837	GCG	2	6	7130	7135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_009837	CTG	2	6	13014	13019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157418099
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275	NC_009837	TGG	2	6	13200	13205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157418099
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398	NC_009837	ATT	2	6	18305	18310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_009837	TGC	2	6	18323	18328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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