MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 104322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008563	CGT	2	6	168295	168300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3502	NC_008563	GGC	2	6	168303	168308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622435
3503	NC_008563	GCT	2	6	168336	168341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3504	NC_008563	TGCG	2	8	168377	168384	0 %	25 %	50 %	25 %	117622435
3505	NC_008563	GAT	2	6	168444	168449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622435
3506	NC_008563	TGA	2	6	168492	168497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622435
3507	NC_008563	TTGGCG	2	12	168526	168537	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	117622435
3508	NC_008563	CAA	2	6	168553	168558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622435
3509	NC_008563	TGA	2	6	168567	168572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622435
3510	NC_008563	CTG	2	6	168580	168585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3511	NC_008563	GCA	2	6	168618	168623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3512	NC_008563	TGC	2	6	168626	168631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3513	NC_008563	CGT	2	6	168642	168647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3514	NC_008563	TCA	2	6	168702	168707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622435
3515	NC_008563	CCG	2	6	168737	168742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622435
3516	NC_008563	TGC	2	6	168746	168751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3517	NC_008563	AAC	2	6	168815	168820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622435
3518	NC_008563	TCC	2	6	168899	168904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622435
3519	NC_008563	GTG	2	6	168928	168933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622435
3520	NC_008563	TGG	3	9	168983	168991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622435
3521	NC_008563	CTGC	2	8	169119	169126	0 %	25 %	25 %	50 %	117622435
3522	NC_008563	GCTG	2	8	169253	169260	0 %	25 %	50 %	25 %	117622435
3523	NC_008563	A	6	6	169352	169357	100 %	0 %	0 %	0 %	117622435
3524	NC_008563	GAA	2	6	169407	169412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622435
3525	NC_008563	CGA	3	9	169413	169421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3526	NC_008563	GCT	2	6	169423	169428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3527	NC_008563	GCC	2	6	169444	169449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622435
3528	NC_008563	GCC	2	6	169461	169466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622435
3529	NC_008563	GGCGT	2	10	169489	169498	0 %	20 %	60 %	20 %	117622435
3530	NC_008563	GCA	2	6	169521	169526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3531	NC_008563	CGG	2	6	169563	169568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622435
3532	NC_008563	CGC	2	6	169592	169597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622435
3533	NC_008563	TCG	2	6	169629	169634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3534	NC_008563	CGA	2	6	169692	169697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3535	NC_008563	GCC	2	6	169706	169711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622435
3536	NC_008563	TTA	2	6	169732	169737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622435
3537	NC_008563	TGA	2	6	169794	169799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622435
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3539	NC_008563	CGG	2	6	170006	170011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622435
3540	NC_008563	TGA	3	9	170082	170090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622435
3541	NC_008563	TTG	2	6	170095	170100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622435
3542	NC_008563	GCA	2	6	170211	170216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3543	NC_008563	CCCG	2	8	170295	170302	0 %	0 %	25 %	75 %	117622435
3544	NC_008563	GAC	2	6	170506	170511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622435
3545	NC_008563	CGACG	2	10	170528	170537	20 %	0 %	40 %	40 %	117622435
3546	NC_008563	GA	3	6	170573	170578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008563	TCT	3	9	170581	170589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_008563	AGA	2	6	170600	170605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008563	CAAA	2	8	170706	170713	75 %	0 %	0 %	25 %	117622436
3550	NC_008563	CGT	3	9	170722	170730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622436
3551	NC_008563	GAT	2	6	170743	170748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622436
3552	NC_008563	ACG	2	6	170750	170755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622436
3553	NC_008563	ATG	2	6	170759	170764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622436
3554	NC_008563	GAA	2	6	170776	170781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622436
3555	NC_008563	GCAAAG	2	12	170804	170815	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	117622436
3556	NC_008563	GGCT	2	8	170839	170846	0 %	25 %	50 %	25 %	117622436
3557	NC_008563	GCT	3	9	170850	170858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622436
3558	NC_008563	A	6	6	170915	170920	100 %	0 %	0 %	0 %	117622436
3559	NC_008563	GCT	2	6	171027	171032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622436
3560	NC_008563	GAT	2	6	171108	171113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622436
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3562	NC_008563	AAG	2	6	171143	171148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622436
3563	NC_008563	GC	4	8	171156	171163	0 %	0 %	50 %	50 %	117622436
3564	NC_008563	ATC	2	6	171182	171187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622436
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3569	NC_008563	AGC	2	6	171281	171286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622436
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3572	NC_008563	ATG	2	6	171368	171373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622436
3573	NC_008563	AGCG	2	8	171487	171494	25 %	0 %	50 %	25 %	117622436
3574	NC_008563	CGAA	2	8	171512	171519	50 %	0 %	25 %	25 %	117622436
3575	NC_008563	CG	3	6	171543	171548	0 %	0 %	50 %	50 %	117622436
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3580	NC_008563	TAC	2	6	171776	171781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622436
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3584	NC_008563	CG	3	6	171857	171862	0 %	0 %	50 %	50 %	117622436
3585	NC_008563	TC	3	6	171872	171877	0 %	50 %	0 %	50 %	117622436
3586	NC_008563	CAGC	2	8	171880	171887	25 %	0 %	25 %	50 %	117622436
3587	NC_008563	TC	3	6	171945	171950	0 %	50 %	0 %	50 %	117622436
3588	NC_008563	GCC	2	6	172006	172011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622436
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3592	NC_008563	CGT	2	6	172162	172167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622436
3593	NC_008563	AGCC	2	8	172213	172220	25 %	0 %	25 %	50 %	117622436
3594	NC_008563	GAT	2	6	172306	172311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622436
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3602	NC_008563	CAA	2	6	172755	172760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622436
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3607	NC_008563	GGT	2	6	172981	172986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622436
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3611	NC_008563	GCA	2	6	173091	173096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622436
3612	NC_008563	CTTT	2	8	173255	173262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_008563	TAA	2	6	173352	173357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008563	GTA	2	6	173458	173463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622437
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3621	NC_008563	AAG	2	6	173987	173992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622437
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3741	NC_008563	TTCCA	2	10	179279	179288	20 %	40 %	0 %	40 %	117622440
3742	NC_008563	GCT	2	6	179301	179306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622440
3743	NC_008563	GC	3	6	179321	179326	0 %	0 %	50 %	50 %	117622440
3744	NC_008563	TTG	2	6	179341	179346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622440
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3753	NC_008563	CAG	2	6	179758	179763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622441
3754	NC_008563	GACCG	2	10	179804	179813	20 %	0 %	40 %	40 %	117622441
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3763	NC_008563	TGCC	2	8	180055	180062	0 %	25 %	25 %	50 %	117622441
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3773	NC_008563	GCT	2	6	180712	180717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3774	NC_008563	GCT	2	6	180762	180767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3780	NC_008563	CTG	2	6	181115	181120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622442
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3793	NC_008563	TAT	2	6	181680	181685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622442
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3804	NC_008563	TTCTGG	2	12	182132	182143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	117622442
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3807	NC_008563	ATT	3	9	182355	182363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3808	NC_008563	TGA	2	6	182412	182417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622443
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3812	NC_008563	TGG	2	6	182612	182617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622443
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3814	NC_008563	TGCGGT	2	12	182722	182733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	117622443
3815	NC_008563	CTG	2	6	182753	182758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3817	NC_008563	GCC	2	6	182853	182858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622444
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3842	NC_008563	GCA	2	6	184902	184907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622446
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3846	NC_008563	A	8	8	185054	185061	100 %	0 %	0 %	0 %	117622447
3847	NC_008563	TCG	2	6	185072	185077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622447
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3850	NC_008563	CAA	2	6	185178	185183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622447
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3853	NC_008563	TTG	2	6	185359	185364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622447
3854	NC_008563	CCG	2	6	185397	185402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622447
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3856	NC_008563	AGCC	2	8	185472	185479	25 %	0 %	25 %	50 %	117622447
3857	NC_008563	CTGA	2	8	185481	185488	25 %	25 %	25 %	25 %	117622447
3858	NC_008563	GGC	2	6	185504	185509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622447
3859	NC_008563	ACGGG	2	10	185519	185528	20 %	0 %	60 %	20 %	117622447
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3984	NC_008563	CTCG	2	8	191133	191140	0 %	25 %	25 %	50 %	117622452
3985	NC_008563	CAG	2	6	191209	191214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622452
3986	NC_008563	CGGT	2	8	191255	191262	0 %	25 %	50 %	25 %	117622452
3987	NC_008563	GTG	2	6	191465	191470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622452
3988	NC_008563	CGT	2	6	191481	191486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622452
3989	NC_008563	GCG	2	6	191500	191505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622452
3990	NC_008563	CGG	2	6	191523	191528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622452
3991	NC_008563	TAA	2	6	191629	191634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622452
3992	NC_008563	GCGT	2	8	191638	191645	0 %	25 %	50 %	25 %	117622452
3993	NC_008563	GCCAG	2	10	191646	191655	20 %	0 %	40 %	40 %	117622452
3994	NC_008563	TCG	2	6	191723	191728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622452
3995	NC_008563	AGT	2	6	191744	191749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622452
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3999	NC_008563	CTT	2	6	191952	191957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622452
4000	NC_008563	TGA	2	6	191970	191975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622452

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