MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 104322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008563	GCG	3	9	144511	144519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622410
3002	NC_008563	ATG	2	6	144562	144567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622410
3003	NC_008563	CTG	2	6	144748	144753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622410
3004	NC_008563	GAT	2	6	144771	144776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622410
3005	NC_008563	TC	3	6	144824	144829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_008563	CAT	2	6	144850	144855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622411
3007	NC_008563	CAC	2	6	144926	144931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622411
3008	NC_008563	ACC	2	6	144974	144979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622411
3009	NC_008563	TGT	2	6	145021	145026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622411
3010	NC_008563	GC	3	6	145029	145034	0 %	0 %	50 %	50 %	117622411
3011	NC_008563	GCG	2	6	145053	145058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622411
3012	NC_008563	CCG	2	6	145075	145080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622411
3013	NC_008563	GCCC	2	8	145090	145097	0 %	0 %	25 %	75 %	117622411
3014	NC_008563	GCG	2	6	145159	145164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622411
3015	NC_008563	CAC	2	6	145184	145189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622411
3016	NC_008563	GCTG	2	8	145230	145237	0 %	25 %	50 %	25 %	117622411
3017	NC_008563	AAAC	2	8	145390	145397	75 %	0 %	0 %	25 %	117622411
3018	NC_008563	GGC	2	6	145509	145514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622411
3019	NC_008563	TGG	2	6	145539	145544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622411
3020	NC_008563	TGG	2	6	145576	145581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622411
3021	NC_008563	TCG	2	6	145612	145617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3022	NC_008563	GCA	2	6	145671	145676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3023	NC_008563	ACC	2	6	145707	145712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622411
3024	NC_008563	CGA	2	6	145725	145730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3025	NC_008563	GTG	2	6	145847	145852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622411
3026	NC_008563	TAAAGG	2	12	146038	146049	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	117622411
3027	NC_008563	CAG	2	6	146105	146110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3028	NC_008563	CGG	2	6	146216	146221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622411
3029	NC_008563	GAC	2	6	146338	146343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3030	NC_008563	CAT	2	6	146344	146349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622411
3031	NC_008563	GAA	2	6	146356	146361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622411
3032	NC_008563	ACG	2	6	146366	146371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3033	NC_008563	GGC	2	6	146507	146512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622411
3034	NC_008563	GCT	2	6	146611	146616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3035	NC_008563	CTT	2	6	146644	146649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622411
3036	NC_008563	GTG	2	6	146686	146691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622411
3037	NC_008563	AGGC	2	8	146722	146729	25 %	0 %	50 %	25 %	117622411
3038	NC_008563	CTG	2	6	146761	146766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3039	NC_008563	ACC	2	6	146834	146839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622411
3040	NC_008563	CAG	2	6	146846	146851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3041	NC_008563	ACC	2	6	146856	146861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622411
3042	NC_008563	GAA	2	6	146933	146938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622411
3043	NC_008563	AGC	2	6	147015	147020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622411
3044	NC_008563	GCGCG	2	10	147040	147049	0 %	0 %	60 %	40 %	117622411
3045	NC_008563	GTA	2	6	147104	147109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622411
3046	NC_008563	GCC	2	6	147116	147121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622411
3047	NC_008563	CCAG	2	8	147130	147137	25 %	0 %	25 %	50 %	117622411
3048	NC_008563	CGC	2	6	147204	147209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622411
3049	NC_008563	TAG	2	6	147264	147269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008563	AATT	2	8	147271	147278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008563	TG	3	6	147292	147297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008563	TCA	2	6	147302	147307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008563	TTA	2	6	147319	147324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008563	GAAT	2	8	147336	147343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008563	TTG	2	6	147375	147380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008563	GTC	2	6	147502	147507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622412
3057	NC_008563	TGG	2	6	147550	147555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622412
3058	NC_008563	CTG	2	6	147558	147563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622412
3059	NC_008563	TTTATG	2	12	147573	147584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	117622412
3060	NC_008563	CCA	2	6	147661	147666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622412
3061	NC_008563	TTG	2	6	147727	147732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622412
3062	NC_008563	ATC	2	6	147738	147743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622412
3063	NC_008563	GCT	2	6	147818	147823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622412
3064	NC_008563	CCGTC	2	10	147831	147840	0 %	20 %	20 %	60 %	117622412
3065	NC_008563	GTGAA	2	10	147841	147850	40 %	20 %	40 %	0 %	117622412
3066	NC_008563	TGG	2	6	147895	147900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622412
3067	NC_008563	CTG	2	6	147960	147965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622412
3068	NC_008563	ATTT	2	8	148013	148020	25 %	75 %	0 %	0 %	117622413
3069	NC_008563	TGAT	2	8	148022	148029	25 %	50 %	25 %	0 %	117622413
3070	NC_008563	GCA	2	6	148113	148118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622413
3071	NC_008563	CGT	2	6	148122	148127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622413
3072	NC_008563	TGG	2	6	148191	148196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622413
3073	NC_008563	GTTCA	2	10	148228	148237	20 %	40 %	20 %	20 %	117622413
3074	NC_008563	CA	3	6	148236	148241	50 %	0 %	0 %	50 %	117622413
3075	NC_008563	GCA	2	6	148314	148319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622413
3076	NC_008563	GTT	2	6	148324	148329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622413
3077	NC_008563	CGC	3	9	148368	148376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622413
3078	NC_008563	ATA	2	6	148394	148399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622413
3079	NC_008563	ATCCA	2	10	148554	148563	40 %	20 %	0 %	40 %	117622413
3080	NC_008563	A	6	6	148600	148605	100 %	0 %	0 %	0 %	117622413
3081	NC_008563	CCA	2	6	148620	148625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622413
3082	NC_008563	TTG	2	6	148646	148651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622413
3083	NC_008563	TGA	2	6	148653	148658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622413
3084	NC_008563	AAT	2	6	148700	148705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008563	GTAAG	2	10	148767	148776	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008563	A	7	7	148816	148822	100 %	0 %	0 %	0 %	117622414
3087	NC_008563	GGC	2	6	148831	148836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622414
3088	NC_008563	TAT	2	6	148932	148937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622414
3089	NC_008563	CT	3	6	148941	148946	0 %	50 %	0 %	50 %	117622414
3090	NC_008563	TAAA	2	8	148949	148956	75 %	25 %	0 %	0 %	117622414
3091	NC_008563	CGGG	2	8	148962	148969	0 %	0 %	75 %	25 %	117622414
3092	NC_008563	GCA	2	6	149070	149075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622414
3093	NC_008563	CAGG	2	8	149089	149096	25 %	0 %	50 %	25 %	117622414
3094	NC_008563	TAC	2	6	149098	149103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622414
3095	NC_008563	AAG	2	6	149117	149122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622414
3096	NC_008563	AAC	2	6	149150	149155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622414
3097	NC_008563	AACG	2	8	149176	149183	50 %	0 %	25 %	25 %	117622414
3098	NC_008563	ACT	2	6	149253	149258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622414
3099	NC_008563	CGA	2	6	149265	149270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622414
3100	NC_008563	ACCG	2	8	149271	149278	25 %	0 %	25 %	50 %	117622414
3101	NC_008563	CGC	2	6	149299	149304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622414
3102	NC_008563	CAC	2	6	149343	149348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622414
3103	NC_008563	CAT	2	6	149349	149354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622414
3104	NC_008563	CAC	2	6	149358	149363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622414
3105	NC_008563	GAA	2	6	149374	149379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622414
3106	NC_008563	ATT	2	6	149407	149412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622414
3107	NC_008563	TGG	2	6	149426	149431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622414
3108	NC_008563	GCT	2	6	149451	149456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622414
3109	NC_008563	TGC	2	6	149570	149575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622414
3110	NC_008563	TGTT	2	8	149669	149676	0 %	75 %	25 %	0 %	117622414
3111	NC_008563	ATG	2	6	149709	149714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622414
3112	NC_008563	GCC	2	6	149795	149800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622415
3113	NC_008563	TCA	2	6	149803	149808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622415
3114	NC_008563	CTTTA	2	10	149817	149826	20 %	60 %	0 %	20 %	117622415
3115	NC_008563	ATG	2	6	149910	149915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622415
3116	NC_008563	TCA	2	6	149949	149954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622415
3117	NC_008563	T	6	6	149955	149960	0 %	100 %	0 %	0 %	117622415
3118	NC_008563	GCT	2	6	149990	149995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622415
3119	NC_008563	ATT	2	6	150021	150026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622415
3120	NC_008563	GGT	2	6	150039	150044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622415
3121	NC_008563	TGTT	2	8	150061	150068	0 %	75 %	25 %	0 %	117622415
3122	NC_008563	T	6	6	150096	150101	0 %	100 %	0 %	0 %	117622415
3123	NC_008563	GCC	2	6	150290	150295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622415
3124	NC_008563	ATG	2	6	150373	150378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622415
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3126	NC_008563	ACGTGG	2	12	150455	150466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	117622415
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3129	NC_008563	CAA	2	6	150539	150544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_008563	TGA	2	6	151035	151040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3241	NC_008563	T	6	6	156410	156415	0 %	100 %	0 %	0 %	117622422
3242	NC_008563	TTG	2	6	156425	156430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622422
3243	NC_008563	CGCCA	2	10	156459	156468	20 %	0 %	20 %	60 %	117622422
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3245	NC_008563	ATTTT	2	10	156632	156641	20 %	80 %	0 %	0 %	117622422
3246	NC_008563	CGC	2	6	156657	156662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622422
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3278	NC_008563	AT	3	6	158054	158059	50 %	50 %	0 %	0 %	117622424
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3360	NC_008563	AATT	2	8	162231	162238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_008563	AAT	2	6	162248	162253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_008563	TA	3	6	162288	162293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_008563	GTAA	2	8	162329	162336	50 %	25 %	25 %	0 %	117622428
3364	NC_008563	GCT	2	6	162375	162380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622428
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3488	NC_008563	TCA	2	6	167821	167826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622434
3489	NC_008563	TCCG	2	8	167855	167862	0 %	25 %	25 %	50 %	117622434
3490	NC_008563	TTCTCT	2	12	167881	167892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622434
3491	NC_008563	CGG	2	6	167936	167941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622434
3492	NC_008563	GT	3	6	167970	167975	0 %	50 %	50 %	0 %	117622434
3493	NC_008563	GC	3	6	167977	167982	0 %	0 %	50 %	50 %	117622434
3494	NC_008563	GAA	2	6	168099	168104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622434
3495	NC_008563	GTC	2	6	168129	168134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622434
3496	NC_008563	TGC	2	6	168144	168149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622434
3497	NC_008563	TGC	2	6	168168	168173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622434
3498	NC_008563	TTA	2	6	168196	168201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622434
3499	NC_008563	CTG	2	6	168247	168252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622434
3500	NC_008563	CTG	2	6	168283	168288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622435

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