MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 104322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008563	A	6	6	669875	669880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_008563	CGG	2	6	669896	669901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_008563	ATA	2	6	669920	669925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622870
14004	NC_008563	CAC	2	6	670016	670021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622870
14005	NC_008563	AG	3	6	670032	670037	50 %	0 %	50 %	0 %	117622870
14006	NC_008563	CGA	2	6	670066	670071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622870
14007	NC_008563	ATG	2	6	670143	670148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622870
14008	NC_008563	GTG	2	6	670185	670190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622870
14009	NC_008563	CGG	2	6	670200	670205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622870
14010	NC_008563	GCT	2	6	670255	670260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622870
14011	NC_008563	TCT	2	6	670261	670266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622870
14012	NC_008563	CTT	2	6	670267	670272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622870
14013	NC_008563	CAT	2	6	670279	670284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622870
14014	NC_008563	CGG	2	6	670294	670299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622870
14015	NC_008563	AGA	2	6	670321	670326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622870
14016	NC_008563	GTC	2	6	670385	670390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622870
14017	NC_008563	GGT	2	6	670391	670396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622870
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14019	NC_008563	GAT	2	6	670466	670471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622870
14020	NC_008563	GAT	2	6	670589	670594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622870
14021	NC_008563	TCG	2	6	670596	670601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622870
14022	NC_008563	TGG	2	6	670621	670626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622870
14023	NC_008563	CGAT	2	8	670638	670645	25 %	25 %	25 %	25 %	117622870
14024	NC_008563	CGC	2	6	670655	670660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622870
14025	NC_008563	GCA	2	6	670669	670674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622870
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14027	NC_008563	CGT	2	6	670699	670704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622870
14028	NC_008563	CACG	2	8	670753	670760	25 %	0 %	25 %	50 %	117622870
14029	NC_008563	TCG	2	6	670797	670802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622870
14030	NC_008563	GACG	2	8	670803	670810	25 %	0 %	50 %	25 %	117622870
14031	NC_008563	CAC	2	6	670822	670827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622870
14032	NC_008563	ATG	2	6	670875	670880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622870
14033	NC_008563	CGC	2	6	670975	670980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622870
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14042	NC_008563	GTGG	2	8	671246	671253	0 %	25 %	75 %	0 %	117622870
14043	NC_008563	CAG	2	6	671258	671263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622870
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14045	NC_008563	TAG	2	6	671354	671359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14047	NC_008563	GAT	2	6	671470	671475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14049	NC_008563	CGG	2	6	671513	671518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622871
14050	NC_008563	CGG	2	6	671528	671533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622871
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14052	NC_008563	CGC	2	6	671768	671773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622871
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14065	NC_008563	ATGC	2	8	672674	672681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14068	NC_008563	TGG	2	6	673046	673051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_008563	ACG	2	6	673054	673059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14073	NC_008563	GCG	2	6	673380	673385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14093	NC_008563	CTT	2	6	674160	674165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622874
14094	NC_008563	GCC	2	6	674217	674222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622874
14095	NC_008563	GCAG	2	8	674234	674241	25 %	0 %	50 %	25 %	117622874
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14100	NC_008563	CATA	2	8	674409	674416	50 %	25 %	0 %	25 %	117622874
14101	NC_008563	CAG	2	6	674425	674430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622874
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14103	NC_008563	AGTGA	2	10	674659	674668	40 %	20 %	40 %	0 %	117622874
14104	NC_008563	GCT	2	6	674711	674716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622874
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14106	NC_008563	GCG	2	6	674807	674812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622874
14107	NC_008563	AAT	2	6	674833	674838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622874
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14109	NC_008563	AGC	2	6	674861	674866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622874
14110	NC_008563	GAT	2	6	674982	674987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622874
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14112	NC_008563	GAT	2	6	675130	675135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622874
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14114	NC_008563	GTC	2	6	675211	675216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622874
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14118	NC_008563	GTTG	2	8	675363	675370	0 %	50 %	50 %	0 %	117622874
14119	NC_008563	AG	3	6	675372	675377	50 %	0 %	50 %	0 %	117622874
14120	NC_008563	CAA	2	6	675399	675404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622874
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14242	NC_008563	GTG	2	6	681243	681248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622879
14243	NC_008563	AGA	2	6	681302	681307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622879
14244	NC_008563	GAA	2	6	681342	681347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622879
14245	NC_008563	TCAA	2	8	681352	681359	50 %	25 %	0 %	25 %	117622879
14246	NC_008563	CAAC	2	8	681364	681371	50 %	0 %	0 %	50 %	117622879
14247	NC_008563	TGC	2	6	681377	681382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622879
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14250	NC_008563	TTG	2	6	681535	681540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622879
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14258	NC_008563	TCTG	2	8	681853	681860	0 %	50 %	25 %	25 %	117622879
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14262	NC_008563	AACGCT	2	12	682005	682016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	117622879
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14266	NC_008563	CGA	2	6	682052	682057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622879
14267	NC_008563	TGT	2	6	682091	682096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622879
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14269	NC_008563	T	7	7	682207	682213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14270	NC_008563	TGGC	2	8	682338	682345	0 %	25 %	50 %	25 %	117622880
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14277	NC_008563	AATA	2	8	682528	682535	75 %	25 %	0 %	0 %	117622880
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14305	NC_008563	ACC	2	6	683845	683850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14348	NC_008563	ATC	2	6	685769	685774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14349	NC_008563	TGT	2	6	685808	685813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14350	NC_008563	CCA	3	9	685830	685838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14351	NC_008563	GAAA	2	8	685841	685848	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14352	NC_008563	AAT	2	6	685849	685854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14353	NC_008563	AAT	2	6	685870	685875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14354	NC_008563	ATA	2	6	685984	685989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14355	NC_008563	TTAAT	2	10	685993	686002	40 %	60 %	0 %	0 %	117622883
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14483	NC_008563	GGCGAA	2	12	692487	692498	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	117622888
14484	NC_008563	GATC	2	8	692573	692580	25 %	25 %	25 %	25 %	117622888
14485	NC_008563	GAA	2	6	692595	692600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622888
14486	NC_008563	AAG	2	6	692635	692640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622888
14487	NC_008563	CAC	2	6	692705	692710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622888
14488	NC_008563	TCT	2	6	692713	692718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622888
14489	NC_008563	TGC	2	6	692861	692866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622888
14490	NC_008563	GAT	2	6	692868	692873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622888
14491	NC_008563	GCC	2	6	692998	693003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622888
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14497	NC_008563	TTC	2	6	693179	693184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14498	NC_008563	AATT	2	8	693188	693195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_008563	TTC	2	6	693292	693297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14500	NC_008563	ATC	2	6	693337	693342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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