MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 104322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008563	CTG	2	6	528093	528098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622744
11002	NC_008563	GTCATC	2	12	528102	528113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	117622744
11003	NC_008563	TGA	2	6	528168	528173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622744
11004	NC_008563	CTTT	2	8	528328	528335	0 %	75 %	0 %	25 %	117622744
11005	NC_008563	TAA	2	6	528474	528479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_008563	A	6	6	528508	528513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_008563	CAAA	2	8	528670	528677	75 %	0 %	0 %	25 %	117622745
11008	NC_008563	CAG	2	6	528681	528686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622745
11009	NC_008563	TCAC	2	8	528713	528720	25 %	25 %	0 %	50 %	117622745
11010	NC_008563	CGG	2	6	528725	528730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622745
11011	NC_008563	GGC	2	6	528779	528784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622745
11012	NC_008563	AGA	2	6	528890	528895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622745
11013	NC_008563	GGC	2	6	528981	528986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622745
11014	NC_008563	CCA	3	9	529024	529032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622745
11015	NC_008563	AAC	2	6	529057	529062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622745
11016	NC_008563	CAA	3	9	529086	529094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622745
11017	NC_008563	CTGG	2	8	529095	529102	0 %	25 %	50 %	25 %	117622745
11018	NC_008563	CT	3	6	529116	529121	0 %	50 %	0 %	50 %	117622745
11019	NC_008563	AACA	2	8	529141	529148	75 %	0 %	0 %	25 %	117622745
11020	NC_008563	GCT	2	6	529178	529183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622745
11021	NC_008563	CCG	2	6	529189	529194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622745
11022	NC_008563	TCA	2	6	529255	529260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622745
11023	NC_008563	GGC	2	6	529295	529300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622745
11024	NC_008563	GTG	2	6	529303	529308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622745
11025	NC_008563	TTC	2	6	529333	529338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622745
11026	NC_008563	ATG	3	9	529371	529379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622745
11027	NC_008563	CAC	2	6	529498	529503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622745
11028	NC_008563	GAA	2	6	529512	529517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622745
11029	NC_008563	A	6	6	529537	529542	100 %	0 %	0 %	0 %	117622745
11030	NC_008563	TGG	2	6	529543	529548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622745
11031	NC_008563	ATG	2	6	529595	529600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622745
11032	NC_008563	TAA	2	6	529612	529617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622746
11033	NC_008563	CGT	2	6	529645	529650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622746
11034	NC_008563	TGG	2	6	529671	529676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622746
11035	NC_008563	GCT	2	6	529693	529698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622746
11036	NC_008563	TAT	2	6	529822	529827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622746
11037	NC_008563	CTT	2	6	529831	529836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622746
11038	NC_008563	TCG	2	6	529837	529842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622746
11039	NC_008563	T	6	6	529860	529865	0 %	100 %	0 %	0 %	117622746
11040	NC_008563	AGG	2	6	529971	529976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117622746
11041	NC_008563	TGA	2	6	530016	530021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622746
11042	NC_008563	GGC	2	6	530055	530060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622746
11043	NC_008563	TCG	2	6	530073	530078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622746
11044	NC_008563	ATG	2	6	530087	530092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622746
11045	NC_008563	ATT	2	6	530108	530113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622746
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11047	NC_008563	TTC	2	6	530177	530182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622746
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11049	NC_008563	ATG	2	6	530225	530230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622746
11050	NC_008563	CGG	2	6	530238	530243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622746
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11052	NC_008563	CGCTGG	2	12	530322	530333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117622746
11053	NC_008563	CCG	2	6	530382	530387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622746
11054	NC_008563	GCT	2	6	530396	530401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622746
11055	NC_008563	CTC	2	6	530408	530413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117622746
11056	NC_008563	TCG	2	6	530433	530438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622746
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11069	NC_008563	TAT	2	6	530914	530919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_008563	TGG	2	6	530922	530927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_008563	A	7	7	530948	530954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_008563	TTG	2	6	530968	530973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_008563	AGG	2	6	530993	530998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_008563	TC	3	6	531386	531391	0 %	50 %	0 %	50 %	117622747
11083	NC_008563	GCT	2	6	531394	531399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622747
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11086	NC_008563	TGC	2	6	531454	531459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11088	NC_008563	TAA	2	6	531543	531548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_008563	CAC	2	6	531549	531554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_008563	AAG	2	6	531559	531564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_008563	ATA	2	6	531589	531594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_008563	CCTT	2	8	531648	531655	0 %	50 %	0 %	50 %	117622748
11093	NC_008563	CTGA	2	8	531706	531713	25 %	25 %	25 %	25 %	117622748
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11100	NC_008563	CAG	2	6	532010	532015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622748
11101	NC_008563	TCA	2	6	532039	532044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622748
11102	NC_008563	AAT	2	6	532057	532062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_008563	TTAT	2	8	532107	532114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_008563	TCCCGC	2	12	532266	532277	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	117622749
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11106	NC_008563	CTT	2	6	532355	532360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622749
11107	NC_008563	TTG	2	6	532419	532424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622749
11108	NC_008563	TGC	2	6	532465	532470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622749
11109	NC_008563	CTTT	2	8	532564	532571	0 %	75 %	0 %	25 %	117622749
11110	NC_008563	TGT	2	6	532576	532581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622749
11111	NC_008563	CATT	2	8	532604	532611	25 %	50 %	0 %	25 %	117622749
11112	NC_008563	GCC	2	6	532657	532662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622749
11113	NC_008563	ATC	2	6	532675	532680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622749
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11115	NC_008563	ACA	2	6	532840	532845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622749
11116	NC_008563	T	6	6	532862	532867	0 %	100 %	0 %	0 %	117622749
11117	NC_008563	TCTG	2	8	532882	532889	0 %	50 %	25 %	25 %	117622749
11118	NC_008563	TGT	2	6	532970	532975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622749
11119	NC_008563	TCT	2	6	533000	533005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622749
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11342	NC_008563	CAGC	2	8	543229	543236	25 %	0 %	25 %	50 %	117622760
11343	NC_008563	GCA	2	6	543271	543276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622760
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11345	NC_008563	CCA	2	6	543348	543353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622760
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11347	NC_008563	GCG	2	6	543452	543457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622760
11348	NC_008563	AAT	2	6	543499	543504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622760
11349	NC_008563	CAG	2	6	543520	543525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622760
11350	NC_008563	GT	3	6	543545	543550	0 %	50 %	50 %	0 %	117622760
11351	NC_008563	CT	3	6	543551	543556	0 %	50 %	0 %	50 %	117622760
11352	NC_008563	GC	3	6	543589	543594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11353	NC_008563	TCT	2	6	543706	543711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622761
11354	NC_008563	AGG	2	6	543759	543764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117622761
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11356	NC_008563	A	6	6	543835	543840	100 %	0 %	0 %	0 %	117622761
11357	NC_008563	CGCC	2	8	543851	543858	0 %	0 %	25 %	75 %	117622761
11358	NC_008563	GCG	2	6	543865	543870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622761
11359	NC_008563	AAT	2	6	543894	543899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622761
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11482	NC_008563	CTT	2	6	550258	550263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622767
11483	NC_008563	GTG	2	6	550273	550278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622767
11484	NC_008563	ATT	2	6	550292	550297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622767
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