MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 44494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005295	ATA	2	6	119758	119763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238801
3502	NC_005295	TAA	2	6	119783	119788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238801
3503	NC_005295	T	6	6	119794	119799	0 %	100 %	0 %	0 %	57238801
3504	NC_005295	TACTA	2	10	119826	119835	40 %	40 %	0 %	20 %	57238801
3505	NC_005295	TAG	2	6	119843	119848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238801
3506	NC_005295	AGG	2	6	119916	119921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238801
3507	NC_005295	CTT	2	6	119937	119942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238801
3508	NC_005295	AT	4	8	119957	119964	50 %	50 %	0 %	0 %	57238801
3509	NC_005295	TGGC	2	8	119976	119983	0 %	25 %	50 %	25 %	57238801
3510	NC_005295	AGC	2	6	120033	120038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238802
3511	NC_005295	GTT	2	6	120101	120106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238802
3512	NC_005295	TGA	2	6	120126	120131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238802
3513	NC_005295	GT	3	6	120210	120215	0 %	50 %	50 %	0 %	57238802
3514	NC_005295	AAG	2	6	120255	120260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238802
3515	NC_005295	AAT	2	6	120267	120272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238802
3516	NC_005295	AGG	3	9	120302	120310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238802
3517	NC_005295	AAT	2	6	120349	120354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238802
3518	NC_005295	AATCTA	2	12	120356	120367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	57238802
3519	NC_005295	AAG	2	6	120373	120378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_005295	ATT	2	6	120394	120399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_005295	TGT	2	6	120427	120432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_005295	TATTAA	2	12	120451	120462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_005295	AGACT	2	10	120463	120472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3524	NC_005295	TTA	2	6	120473	120478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_005295	TTTG	2	8	120499	120506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_005295	TAT	2	6	120565	120570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_005295	TA	3	6	120573	120578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_005295	AATA	2	8	120589	120596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_005295	A	6	6	120617	120622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_005295	AT	5	10	120624	120633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_005295	T	7	7	120639	120645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_005295	ATT	2	6	120646	120651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_005295	TAT	2	6	120693	120698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_005295	TG	3	6	120704	120709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_005295	ATT	2	6	120726	120731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238803
3536	NC_005295	TAT	2	6	120738	120743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238803
3537	NC_005295	AGG	2	6	120774	120779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238803
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3539	NC_005295	ATA	2	6	120836	120841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238803
3540	NC_005295	ATA	2	6	120872	120877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238803
3541	NC_005295	AGTCA	2	10	120887	120896	40 %	20 %	20 %	20 %	57238803
3542	NC_005295	GTA	2	6	120917	120922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238803
3543	NC_005295	TAG	2	6	120968	120973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238803
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3548	NC_005295	TGC	2	6	121259	121264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238803
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3553	NC_005295	TA	3	6	121471	121476	50 %	50 %	0 %	0 %	57238803
3554	NC_005295	ATTG	2	8	121494	121501	25 %	50 %	25 %	0 %	57238803
3555	NC_005295	AGG	2	6	121518	121523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238803
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3557	NC_005295	TAT	2	6	121589	121594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238803
3558	NC_005295	AG	4	8	121615	121622	50 %	0 %	50 %	0 %	57238803
3559	NC_005295	ATGGC	2	10	121648	121657	20 %	20 %	40 %	20 %	57238803
3560	NC_005295	TA	3	6	121700	121705	50 %	50 %	0 %	0 %	57238803
3561	NC_005295	GAT	2	6	121714	121719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238803
3562	NC_005295	GTG	2	6	121736	121741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238803
3563	NC_005295	AGATG	2	10	121818	121827	40 %	20 %	40 %	0 %	57238803
3564	NC_005295	TAG	2	6	121866	121871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238803
3565	NC_005295	TTAA	2	8	121873	121880	50 %	50 %	0 %	0 %	57238803
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3572	NC_005295	TAG	2	6	122070	122075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238803
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3592	NC_005295	ATA	2	6	122993	122998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238803
3593	NC_005295	TGT	2	6	123031	123036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238803
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3595	NC_005295	GTA	2	6	123062	123067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238803
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3597	NC_005295	ACC	2	6	123210	123215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57238803
3598	NC_005295	A	6	6	123237	123242	100 %	0 %	0 %	0 %	57238803
3599	NC_005295	TGG	2	6	123273	123278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238803
3600	NC_005295	TAGA	2	8	123323	123330	50 %	25 %	25 %	0 %	57238803
3601	NC_005295	AT	3	6	123376	123381	50 %	50 %	0 %	0 %	57238803
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3605	NC_005295	GTTAT	2	10	123514	123523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_005295	AT	3	6	123542	123547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_005295	ACA	2	6	123590	123595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_005295	T	7	7	123661	123667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_005295	TAA	2	6	123691	123696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_005295	T	7	7	123704	123710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_005295	GAT	2	6	123772	123777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238804
3612	NC_005295	T	6	6	123785	123790	0 %	100 %	0 %	0 %	57238804
3613	NC_005295	CAT	2	6	123801	123806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238804
3614	NC_005295	AGCTG	2	10	123876	123885	20 %	20 %	40 %	20 %	57238804
3615	NC_005295	TTTA	2	8	123903	123910	25 %	75 %	0 %	0 %	57238804
3616	NC_005295	TAA	2	6	123998	124003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238804
3617	NC_005295	TCT	2	6	124006	124011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238804
3618	NC_005295	TTC	2	6	124032	124037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238804
3619	NC_005295	TTG	2	6	124059	124064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_005295	TATT	2	8	124085	124092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_005295	AATAA	2	10	124093	124102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_005295	ATG	2	6	124129	124134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_005295	TAA	2	6	124219	124224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_005295	TAT	2	6	124228	124233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_005295	TA	3	6	124235	124240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_005295	AGTTA	2	10	124244	124253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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