MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EDL933 chromosome

Total Repeats: 113820

< Previous12...3233343536373839404142...227228Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_002655	TAAG	2	8	860218	860225	50 %	25 %	25 %	0 %	15800450
18002	NC_002655	CTT	2	6	860265	860270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15800450
18003	NC_002655	AAG	2	6	860335	860340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15800450
18004	NC_002655	TGA	2	6	860346	860351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_002655	ATGT	2	8	860437	860444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_002655	CGC	2	6	860464	860469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15800451
18007	NC_002655	T	6	6	860580	860585	0 %	100 %	0 %	0 %	15800451
18008	NC_002655	TTGC	2	8	860591	860598	0 %	50 %	25 %	25 %	15800451
18009	NC_002655	TCT	3	9	860628	860636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15800451
18010	NC_002655	A	6	6	860657	860662	100 %	0 %	0 %	0 %	15800451
18011	NC_002655	CG	4	8	860730	860737	0 %	0 %	50 %	50 %	15800451
18012	NC_002655	TAG	2	6	860740	860745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800451
18013	NC_002655	TTG	2	6	860768	860773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_002655	CTA	2	6	860826	860831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_002655	GGT	2	6	860848	860853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_002655	GTG	2	6	860854	860859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_002655	GCAC	2	8	860893	860900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18018	NC_002655	TGC	2	6	860906	860911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_002655	TCA	3	9	860913	860921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15800452
18020	NC_002655	CGA	2	6	861006	861011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800452
18021	NC_002655	TGAA	2	8	861101	861108	50 %	25 %	25 %	0 %	15800452
18022	NC_002655	GTT	2	6	861121	861126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15800452
18023	NC_002655	TGAC	2	8	861193	861200	25 %	25 %	25 %	25 %	15800452
18024	NC_002655	TTGATT	2	12	861255	861266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15800452
18025	NC_002655	ATT	2	6	861291	861296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15800452
18026	NC_002655	GCG	2	6	861324	861329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800453
18027	NC_002655	CG	3	6	861328	861333	0 %	0 %	50 %	50 %	15800453
18028	NC_002655	TCTGG	2	10	861358	861367	0 %	40 %	40 %	20 %	15800453
18029	NC_002655	CT	3	6	861375	861380	0 %	50 %	0 %	50 %	15800453
18030	NC_002655	AG	3	6	861392	861397	50 %	0 %	50 %	0 %	15800453
18031	NC_002655	CGC	2	6	861740	861745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15800453
18032	NC_002655	CGG	2	6	861751	861756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800453
18033	NC_002655	CAAC	2	8	861776	861783	50 %	0 %	0 %	50 %	15800453
18034	NC_002655	AAAC	2	8	861788	861795	75 %	0 %	0 %	25 %	15800453
18035	NC_002655	CAA	2	6	861872	861877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15800453
18036	NC_002655	GTC	2	6	861910	861915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800453
18037	NC_002655	CTG	2	6	861960	861965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800453
18038	NC_002655	CAT	2	6	861998	862003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15800453
18039	NC_002655	TTG	2	6	862081	862086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15800454
18040	NC_002655	GTG	2	6	862113	862118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15800454
18041	NC_002655	ACC	2	6	862145	862150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15800454
18042	NC_002655	GGT	2	6	862157	862162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15800454
18043	NC_002655	AAT	2	6	862244	862249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15800454
18044	NC_002655	GGTT	2	8	862289	862296	0 %	50 %	50 %	0 %	15800454
18045	NC_002655	CTTG	2	8	862331	862338	0 %	50 %	25 %	25 %	15800454
18046	NC_002655	AG	3	6	862341	862346	50 %	0 %	50 %	0 %	15800454
18047	NC_002655	ATT	2	6	862426	862431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15800454
18048	NC_002655	CAG	2	6	862433	862438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800454
18049	NC_002655	TGC	2	6	862439	862444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18050	NC_002655	GCG	2	6	862459	862464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_002655	GTTC	2	8	862475	862482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18052	NC_002655	GGC	2	6	862510	862515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800455
18053	NC_002655	GGT	2	6	862516	862521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15800455
18054	NC_002655	TGA	2	6	862611	862616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800455
18055	NC_002655	CAG	2	6	862636	862641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18056	NC_002655	GCT	2	6	862642	862647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18057	NC_002655	GAA	2	6	862648	862653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15800455
18058	NC_002655	GCT	2	6	862714	862719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18059	NC_002655	GAA	2	6	862741	862746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15800455
18060	NC_002655	AAGC	2	8	862774	862781	50 %	0 %	25 %	25 %	15800455
18061	NC_002655	GGC	2	6	862788	862793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800455
18062	NC_002655	GCG	2	6	862801	862806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800455
18063	NC_002655	GAT	2	6	862834	862839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800455
18064	NC_002655	GAA	2	6	862849	862854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15800455
18065	NC_002655	GAA	2	6	862860	862865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15800455
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18071	NC_002655	GCA	2	6	862942	862947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18072	NC_002655	GCG	2	6	862951	862956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800455
18073	NC_002655	GAA	3	9	862959	862967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15800455
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18076	NC_002655	GCA	2	6	863014	863019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
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18078	NC_002655	GCA	2	6	863044	863049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18079	NC_002655	GCT	2	6	863059	863064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18080	NC_002655	GCA	2	6	863071	863076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18081	NC_002655	AGC	2	6	863088	863093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18082	NC_002655	GCC	2	6	863104	863109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15800455
18083	NC_002655	A	6	6	863116	863121	100 %	0 %	0 %	0 %	15800455
18084	NC_002655	AGC	3	9	863136	863144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
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18086	NC_002655	GAT	2	6	863182	863187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800455
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18088	NC_002655	AAGT	2	8	863346	863353	50 %	25 %	25 %	0 %	15800455
18089	NC_002655	GCA	2	6	863476	863481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800455
18090	NC_002655	ACC	2	6	863505	863510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15800455
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18092	NC_002655	GTC	2	6	863798	863803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18093	NC_002655	GTT	2	6	863812	863817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_002655	GGGC	2	8	863828	863835	0 %	0 %	75 %	25 %	15800456
18095	NC_002655	GGC	2	6	863860	863865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800456
18096	NC_002655	TGC	2	6	863871	863876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800456
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18101	NC_002655	GTACT	2	10	864074	864083	20 %	40 %	20 %	20 %	15800456
18102	NC_002655	TGA	2	6	864144	864149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800456
18103	NC_002655	GTT	2	6	864205	864210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15800456
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18105	NC_002655	CAC	2	6	864290	864295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15800456
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18107	NC_002655	ACCGA	2	10	864568	864577	40 %	0 %	20 %	40 %	15800456
18108	NC_002655	GTC	2	6	864626	864631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800456
18109	NC_002655	CGG	2	6	864657	864662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800456
18110	NC_002655	CAG	2	6	864714	864719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800456
18111	NC_002655	TGG	2	6	864753	864758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15800456
18112	NC_002655	GCA	3	9	864759	864767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800456
18113	NC_002655	GTC	2	6	864810	864815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800456
18114	NC_002655	GGGAT	2	10	864883	864892	20 %	20 %	60 %	0 %	15800456
18115	NC_002655	CCTG	2	8	864967	864974	0 %	25 %	25 %	50 %	15800456
18116	NC_002655	ATA	2	6	864990	864995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15800456
18117	NC_002655	TGA	2	6	865053	865058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800456
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18119	NC_002655	CAA	2	6	865096	865101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15800456
18120	NC_002655	CGG	2	6	865162	865167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800457
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18122	NC_002655	AAC	2	6	865226	865231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15800457
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18247	NC_002655	TGG	2	6	869992	869997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15800461
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18268	NC_002655	GA	3	6	870869	870874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18271	NC_002655	ATG	2	6	871172	871177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15800463
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18290	NC_002655	A	6	6	872189	872194	100 %	0 %	0 %	0 %	15800463
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18303	NC_002655	CAG	2	6	872859	872864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800464
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18313	NC_002655	GGTTC	2	10	873340	873349	0 %	40 %	40 %	20 %	15800465
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18342	NC_002655	CAA	2	6	874878	874883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15800466
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18349	NC_002655	TCA	2	6	875147	875152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15800466
18350	NC_002655	AATC	2	8	875229	875236	50 %	25 %	0 %	25 %	15800466
18351	NC_002655	CGT	2	6	875256	875261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15800466
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18353	NC_002655	T	6	6	875357	875362	0 %	100 %	0 %	0 %	15800466
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18357	NC_002655	TACG	2	8	875494	875501	25 %	25 %	25 %	25 %	15800466
18358	NC_002655	CGCTG	2	10	875664	875673	0 %	20 %	40 %	40 %	15800467
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18362	NC_002655	CG	4	8	876114	876121	0 %	0 %	50 %	50 %	15800467
18363	NC_002655	TGGC	2	8	876300	876307	0 %	25 %	50 %	25 %	15800467
18364	NC_002655	GCGGT	2	10	876340	876349	0 %	20 %	60 %	20 %	15800467
18365	NC_002655	GCG	2	6	876385	876390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15800467
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18491	NC_002655	ACG	2	6	883169	883174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15800475
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