MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 9670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020055	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020055	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020055	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020055	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020055	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020055	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020055	AT	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020055	A	7	7	313	319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020055	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020055	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020055	G	6	6	1308	1313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020055	CA	3	6	1333	1338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020055	TTCTT	2	10	1351	1360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020055	CT	3	6	1475	1480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020055	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020055	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020055	C	9	9	1954	1962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_020055	T	8	8	1964	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020055	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020055	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020055	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020055	G	6	6	2114	2119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020055	T	6	6	2211	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020055	T	6	6	2286	2291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020055	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020055	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020055	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020055	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020055	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020055	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020055	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020055	T	7	7	2505	2511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020055	GAATA	2	10	2687	2696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020055	GA	3	6	2813	2818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020055	AC	3	6	5504	5509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020055	T	6	6	6142	6147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020055	T	7	7	6167	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020055	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020055	GA	3	6	6234	6239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020055	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020055	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020055	TACCT	2	10	8495	8504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020055	A	8	8	8563	8570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020055	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020055	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020055	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020055	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020055	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020055	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020055	TGAAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020055	ACTT	2	8	9097	9104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020055	T	6	6	9103	9108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020055	TGTT	2	8	9203	9210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020055	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020055	AT	3	6	10345	10350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020055	GTT	2	6	10363	10368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020055	A	7	7	10395	10401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020055	T	7	7	11188	11194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020055	AGT	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020055	A	7	7	11235	11241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020055	T	7	7	11288	11294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020055	AATA	2	8	11308	11315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020055	AT	3	6	11333	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020055	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020055	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020055	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020055	A	6	6	11442	11447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020055	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020055	GTT	2	6	11464	11469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020055	TCCC	2	8	11501	11508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_020055	T	6	6	11572	11577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020055	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020055	AT	3	6	15860	15865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020055	T	6	6	17488	17493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020055	ATTT	2	8	17495	17502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020055	TGA	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020055	TCC	2	6	17654	17659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020055	AGG	2	6	17665	17670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020055	TTTA	2	8	17695	17702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020055	ATTTT	2	10	17744	17753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020055	T	6	6	17750	17755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020055	CCA	2	6	17756	17761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020055	TC	3	6	17796	17801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020055	T	8	8	19933	19940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020055	TTA	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020055	CAA	2	6	19976	19981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020055	ATTT	2	8	19990	19997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020055	TAAT	2	8	20876	20883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020055	A	6	6	20955	20960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020055	ATTT	2	8	20964	20971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020055	T	6	6	20969	20974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020055	TTCG	2	8	21011	21018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020055	GTA	2	6	21081	21086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020055	TGT	2	6	21087	21092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020055	GGA	2	6	21102	21107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020055	AT	3	6	21806	21811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020055	TGG	2	6	21927	21932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020055	AGT	2	6	21935	21940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020055	TTC	2	6	22409	22414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020055	C	6	6	22421	22426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_020055	GCG	2	6	23258	23263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020055	ATT	2	6	23590	23595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020055	G	6	6	23600	23605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020055	AT	3	6	23956	23961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020055	GTT	2	6	23974	23979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020055	A	7	7	24006	24012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020055	ATA	3	9	24336	24344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020055	AGT	2	6	24348	24353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020055	TGT	2	6	24368	24373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020055	TAA	2	6	24387	24392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020055	TGC	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020055	GA	4	8	24534	24541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020055	CCT	2	6	24561	24566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020055	T	7	7	24799	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020055	AGT	2	6	24819	24824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020055	A	7	7	24846	24852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020055	ATAAA	2	10	24872	24881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020055	T	6	6	24906	24911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020055	AAATT	2	10	27868	27877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020055	AGA	2	6	27935	27940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020055	AATA	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020055	TGC	2	6	28308	28313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020055	GCA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020055	ATTA	2	8	28415	28422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020055	A	6	6	28437	28442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020055	G	6	6	28453	28458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020055	TGTTT	2	10	28513	28522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020055	CCA	2	6	28523	28528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_020055	ATA	2	6	35069	35074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020055	AAG	2	6	35144	35149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020055	ATA	2	6	35159	35164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020055	ACT	2	6	36304	36309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020055	A	6	6	36336	36341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020055	T	7	7	36396	36402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020055	AGT	2	6	36416	36421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020055	A	7	7	36443	36449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020055	T	7	7	36496	36502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020055	AATA	2	8	36516	36523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020055	AT	3	6	36541	36546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020055	ACC	2	6	36559	36564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020055	TAA	2	6	36612	36617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020055	CAA	2	6	36645	36650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020055	A	6	6	36649	36654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020055	AAT	2	6	36658	36663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020055	GTT	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020055	TGG	2	6	36810	36815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020055	TG	3	6	36825	36830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020055	ATT	3	9	36869	36877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020055	AT	3	6	36938	36943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020055	GAA	2	6	36956	36961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020055	CAG	2	6	37067	37072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_020055	ATT	2	6	37212	37217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020055	ACG	2	6	37227	37232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020055	AAT	2	6	37248	37253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020055	ATTA	2	8	40089	40096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020055	TTG	2	6	40107	40112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_020055	T	7	7	40193	40199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_020055	TA	3	6	40794	40799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020055	TTAA	2	8	40902	40909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020055	TAA	2	6	40941	40946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020055	AGA	3	9	42932	42940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_020055	AAT	2	6	43237	43242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020055	ATT	2	6	43250	43255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020055	T	6	6	43313	43318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020055	GCT	2	6	43379	43384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_020055	TTC	2	6	43385	43390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_020055	GGGA	2	8	43423	43430	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020055	T	9	9	43561	43569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020055	A	6	6	43570	43575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_020055	T	7	7	49965	49971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020055	TTAA	2	8	49976	49983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020055	T	6	6	53794	53799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_020055	GTAT	2	8	98527	98534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
301	NC_020055	TTA	2	6	98566	98571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_020055	A	7	7	98625	98631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_020055	CTA	2	6	100180	100185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_020055	CTA	2	6	103491	103496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_020055	TA	3	6	104249	104254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_020055	TGTT	2	8	105324	105331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_020055	ATA	2	6	156328	156333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_020055	AGA	2	6	163486	163491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_020055	ATTTC	2	10	163499	163508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_020055	ATA	2	6	163519	163524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_020055	T	6	6	163550	163555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_020055	T	6	6	163690	163695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_020055	TAAA	2	8	164405	164412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_020055	ACTG	2	8	164414	164421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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