MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 10436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_019793	CTC	2	6	1176502	1176507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_019793	CAT	2	6	1177136	1177141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_019793	GAG	2	6	1177146	1177151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019793	CGT	2	6	1177164	1177169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_019793	CAC	2	6	1177181	1177186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_019793	GGA	2	6	1177206	1177211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019793	TGG	2	6	1177216	1177221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_019793	CCG	2	6	1177229	1177234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_019793	TGG	2	6	1177250	1177255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019793	CAG	2	6	1177302	1177307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_019793	CCT	2	6	1177340	1177345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_019793	GA	3	6	1177358	1177363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019793	CGG	2	6	1177459	1177464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_019793	GGC	2	6	1177469	1177474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_019793	ACG	2	6	1177481	1177486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_019793	GC	3	6	1177491	1177496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_019793	CGT	2	6	1177512	1177517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_019793	TGG	2	6	1177537	1177542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_019793	CGC	2	6	1177565	1177570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_019793	GCC	2	6	1177591	1177596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_019793	CGA	2	6	1177716	1177721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_019793	GCC	3	9	1177732	1177740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_019793	GCG	2	6	1177749	1177754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_019793	GGGC	2	8	1177788	1177795	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_019793	GGGC	2	8	1177798	1177805	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_019793	CTC	2	6	1177807	1177812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3030	NC_019793	GC	3	6	1178064	1178069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_019793	CGT	2	6	1178076	1178081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_019793	GCG	2	6	1178107	1178112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_019793	AGG	2	6	1178148	1178153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019793	ACGTG	2	10	1178295	1178304	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_019793	ACGCG	2	10	1178305	1178314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3036	NC_019793	GCG	2	6	1178341	1178346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_019793	TC	3	6	1178400	1178405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3041	NC_019793	AGCG	2	8	1178466	1178473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_019793	GCC	2	6	1178515	1178520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_019793	GCT	2	6	1178685	1178690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_019793	GAG	2	6	1178744	1178749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3051	NC_019793	TGG	2	6	1179031	1179036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3055	NC_019793	GCA	2	6	1179102	1179107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_019793	CGA	2	6	1179186	1179191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_019793	CAG	2	6	1179199	1179204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3059	NC_019793	CCA	2	6	1179317	1179322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3062	NC_019793	AAGC	2	8	1179441	1179448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_019793	ACCG	2	8	1179466	1179473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3065	NC_019793	GCGG	2	8	1179547	1179554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3068	NC_019793	CCCG	2	8	1179717	1179724	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3069	NC_019793	AAC	2	6	1182417	1182422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_019793	GTCAG	2	10	1186321	1186330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3082	NC_019793	GCGTG	2	10	1186399	1186408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3098	NC_019793	GAC	2	6	1190557	1190562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_019793	GC	4	8	1190621	1190628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_019793	CGA	2	6	1190640	1190645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_019793	GC	3	6	1191928	1191933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_019793	GC	3	6	1191944	1191949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_019793	TCG	2	6	1191954	1191959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3105	NC_019793	TGCC	2	8	1193160	1193167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_019793	AC	3	6	1193509	1193514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_019793	GCC	2	6	1193627	1193632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3109	NC_019793	TTG	2	6	1193655	1193660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019793	CTC	2	6	1195234	1195239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_019793	GAG	2	6	1196261	1196266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019793	GCC	2	6	1196290	1196295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_019793	TTGAAT	2	12	1197797	1197808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_019793	TCC	2	6	1200643	1200648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_019793	CGTG	2	8	1200677	1200684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_019793	CGG	2	6	1200686	1200691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_019793	GC	3	6	1200823	1200828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_019793	CAG	2	6	1203326	1203331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_019793	AAGT	2	8	1204019	1204026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_019793	CAGC	2	8	1204033	1204040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_019793	CCG	2	6	1204042	1204047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3123	NC_019793	TC	3	6	1204075	1204080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_019793	GAA	2	6	1204200	1204205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_019793	CGC	2	6	1204223	1204228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_019793	AGAGA	2	10	1204256	1204265	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_019793	ACC	2	6	1205180	1205185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_019793	GGA	2	6	1205202	1205207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_019793	GGGC	2	8	1206458	1206465	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_019793	AAC	2	6	1209926	1209931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3248	NC_019793	AG	3	6	1243438	1243443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_019793	GCA	2	6	1243447	1243452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_019793	GGTAG	2	10	1243947	1243956	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_019793	TG	3	6	1243976	1243981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_019793	G	6	6	1243983	1243988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_019793	CGTC	2	8	1244014	1244021	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_019793	ACA	2	6	1244108	1244113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_019793	GGC	2	6	1244121	1244126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_019793	GC	3	6	1244246	1244251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_019793	AAG	3	9	1244264	1244272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_019793	AGG	2	6	1244282	1244287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_019793	AGC	2	6	1244315	1244320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_019793	ATG	2	6	1244429	1244434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_019793	AGC	2	6	1244462	1244467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_019793	CCA	2	6	1244536	1244541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3263	NC_019793	GCG	2	6	1244580	1244585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_019793	CA	3	6	1244629	1244634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3265	NC_019793	ACG	2	6	1244637	1244642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3266	NC_019793	TCA	2	6	1244655	1244660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3268	NC_019793	GTG	2	6	1244799	1244804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_019793	GCG	2	6	1244845	1244850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3270	NC_019793	CCT	2	6	1244900	1244905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3276	NC_019793	TGCCG	2	10	1245256	1245265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3283	NC_019793	CGCT	2	8	1245499	1245506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3291	NC_019793	GGA	2	6	1245946	1245951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_019793	ACC	2	6	1246056	1246061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3293	NC_019793	CGG	2	6	1246073	1246078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3294	NC_019793	CCG	2	6	1246132	1246137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3301	NC_019793	TTG	2	6	1246498	1246503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3304	NC_019793	GGCTG	2	10	1246677	1246686	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3331	NC_019793	GTTC	2	8	1248770	1248777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3343	NC_019793	TCACT	2	10	1251248	1251257	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3349	NC_019793	CG	3	6	1253017	1253022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3350	NC_019793	GAAG	2	8	1253042	1253049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_019793	CTG	2	6	1258359	1258364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3373	NC_019793	CTTCC	2	10	1258446	1258455	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3374	NC_019793	CTT	2	6	1259714	1259719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3375	NC_019793	GCT	2	6	1260633	1260638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3377	NC_019793	CT	3	6	1261898	1261903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3378	NC_019793	GAA	2	6	1261904	1261909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3379	NC_019793	TCA	2	6	1262442	1262447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3380	NC_019793	GCCG	2	8	1262448	1262455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3381	NC_019793	GAG	2	6	1262478	1262483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_019793	AG	3	6	1264642	1264647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3383	NC_019793	CG	4	8	1265851	1265858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3384	NC_019793	TGG	2	6	1267447	1267452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3385	NC_019793	CA	3	6	1267463	1267468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3386	NC_019793	CGC	2	6	1267481	1267486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3387	NC_019793	TCG	2	6	1267550	1267555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3388	NC_019793	CGTT	2	8	1267561	1267568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3389	NC_019793	GCA	2	6	1268097	1268102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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