MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus meridiei DSM 13257 chromosome

Total Repeats: 18838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018515	CCG	2	6	11	16	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018515	TATG	2	8	20	27	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018515	TTCT	2	8	65	72	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018515	A	8	8	78	85	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018515	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018515	ACTT	2	8	290	297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018515	TAA	2	6	311	316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018515	GT	3	6	348	353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018515	A	6	6	369	374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018515	AAT	2	6	389	394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018515	ATATT	2	10	440	449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018515	GAC	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018515	AAC	2	6	468	473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018515	T	6	6	549	554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018515	ATT	2	6	561	566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018515	T	8	8	565	572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018515	TTAA	2	8	1967	1974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018515	GAT	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018515	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018515	TA	3	6	2036	2041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018515	ATA	2	6	2063	2068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018515	TAC	3	9	2155	2163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018515	ACT	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018515	TAT	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018515	TTA	3	9	2181	2189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018515	T	6	6	2233	2238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018515	T	6	6	2246	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018515	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018515	CTTT	2	8	2293	2300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018515	TAA	2	6	2304	2309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018515	GAA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018515	AAGTT	2	10	2346	2355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018515	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018515	AGG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018515	CTTTAG	2	12	4878	4889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018515	AAT	2	6	4927	4932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018515	T	6	6	4946	4951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018515	A	6	6	4968	4973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018515	TA	3	6	4997	5002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018515	GGA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018515	TACA	2	8	9505	9512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018515	GAG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018515	CG	3	6	11195	11200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018515	GT	6	12	11215	11226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018515	TCT	2	6	11241	11246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018515	GAA	2	6	12545	12550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018515	ATA	2	6	12594	12599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018515	TAG	2	6	12605	12610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018515	AT	3	6	12626	12631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018515	GTT	2	6	12648	12653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018515	ATT	2	6	12773	12778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018515	ATT	2	6	12861	12866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018515	TCA	2	6	12917	12922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018515	TCC	2	6	12992	12997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018515	TA	3	6	13504	13509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018515	GGA	2	6	13511	13516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018515	CCGT	2	8	13568	13575	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018515	CCT	2	6	13590	13595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018515	T	6	6	13647	13652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018515	ATA	2	6	13680	13685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018515	T	6	6	13710	13715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018515	T	7	7	13717	13723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018515	GGA	2	6	13743	13748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018515	AT	3	6	14321	14326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018515	TAT	2	6	14361	14366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018515	TCC	2	6	15288	15293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018515	AC	3	6	15311	15316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018515	AAAG	2	8	15370	15377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018515	AT	3	6	15389	15394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018515	TC	3	6	15440	15445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018515	TGA	2	6	15479	15484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018515	CT	4	8	15575	15582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018515	T	6	6	15622	15627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018515	TAT	2	6	15668	15673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018515	AGG	2	6	15684	15689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018515	GGC	2	6	15856	15861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018515	GAT	2	6	15862	15867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018515	AGC	2	6	15919	15924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018515	TG	3	6	15941	15946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018515	CTG	2	6	15970	15975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018515	GAT	2	6	15997	16002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018515	TCAA	2	8	16003	16010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018515	GGT	2	6	16039	16044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018515	T	6	6	16056	16061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018515	TATT	2	8	16099	16106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018515	T	6	6	17785	17790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018515	TTA	2	6	17805	17810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018515	ATTA	2	8	17821	17828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018515	TTA	2	6	17830	17835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018515	TCT	2	6	18811	18816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018515	AAT	2	6	18860	18865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018515	AAG	2	6	18881	18886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018515	ACG	2	6	18897	18902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018515	ATA	2	6	18990	18995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018515	TTAC	2	8	18996	19003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018515	GTT	2	6	19034	19039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018515	TTA	2	6	19044	19049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018515	ATTATA	2	12	19066	19077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018515	TA	3	6	19089	19094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018515	TA	3	6	19113	19118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018515	TAA	2	6	19150	19155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018515	TAAT	2	8	19167	19174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018515	AAACA	2	10	19197	19206	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018515	AAAAC	2	10	19220	19229	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018515	AT	3	6	19235	19240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018515	TAT	2	6	19247	19252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018515	T	7	7	19329	19335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018515	TAAT	3	12	19386	19397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018515	TTAA	2	8	19401	19408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018515	TTAA	2	8	19422	19429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018515	AAT	2	6	19434	19439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018515	AAG	2	6	19458	19463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018515	ACCTA	2	10	19467	19476	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_018515	A	6	6	19484	19489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018515	GAG	2	6	19505	19510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018515	AAC	2	6	23073	23078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018515	GAAA	2	8	23082	23089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018515	AG	3	6	23090	23095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018515	TTA	2	6	23100	23105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018515	CT	3	6	23111	23116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018515	T	6	6	23116	23121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018515	AGG	2	6	23171	23176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018515	TAG	2	6	23445	23450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018515	AGA	2	6	23480	23485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018515	TCT	2	6	23509	23514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018515	A	6	6	23525	23530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018515	TTTTA	2	10	23546	23555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018515	AAT	2	6	23604	23609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018515	GGGA	2	8	23640	23647	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018515	AGC	2	6	25264	25269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018515	AGG	2	6	28654	28659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018515	TAAA	2	8	28959	28966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018515	TAA	2	6	30510	30515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018515	A	6	6	33415	33420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018515	CAA	2	6	33783	33788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018515	T	7	7	33846	33852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018515	TAT	2	6	33867	33872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018515	TAT	2	6	33948	33953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018515	T	8	8	36718	36725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018515	AGG	2	6	36751	36756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018515	ACC	2	6	37745	37750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018515	GTT	2	6	37767	37772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018515	ACTTAA	2	12	39003	39014	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_018515	AAG	2	6	39025	39030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018515	CTT	2	6	39049	39054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018515	T	6	6	39053	39058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018515	TTTA	2	8	39080	39087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018515	TA	3	6	39875	39880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018515	TGAAG	2	10	39940	39949	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018515	GGA	2	6	41205	41210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_018515	CGC	2	6	91995	92000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
297	NC_018515	ATG	2	6	92005	92010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018515	GAA	2	6	92044	92049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_018515	ATT	2	6	92158	92163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_018515	ACC	2	6	94097	94102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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425	NC_018515	C	8	8	102880	102887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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429	NC_018515	TA	3	6	103025	103030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_018515	TA	3	6	103120	103125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_018515	CAAA	2	8	103613	103620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
432	NC_018515	GA	3	6	103622	103627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
433	NC_018515	TAA	2	6	103641	103646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_018515	ATG	3	9	103675	103683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018515	GAG	2	6	103707	103712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_018515	AAAGA	2	10	103735	103744	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
438	NC_018515	TTG	2	6	103758	103763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_018515	TTA	2	6	103784	103789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_018515	AAAT	2	8	103979	103986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_018515	ATC	2	6	103996	104001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_018515	ATGG	2	8	104272	104279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018515	TGG	2	6	104301	104306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_018515	CGC	2	6	104446	104451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
455	NC_018515	ATG	2	6	104456	104461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_018515	GAA	2	6	104495	104500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_018515	AGG	2	6	104541	104546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_018515	GAA	2	6	105023	105028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_018515	CCT	2	6	105590	105595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
473	NC_018515	GA	3	6	105687	105692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
474	NC_018515	TGT	2	6	105748	105753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
475	NC_018515	GA	3	6	105762	105767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_018515	GAA	2	6	106038	106043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_018515	GGA	2	6	106202	106207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
482	NC_018515	AAAG	2	8	106208	106215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018515	ATC	2	6	106217	106222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
484	NC_018515	GCG	2	6	106236	106241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_018515	GAAT	2	8	106305	106312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
486	NC_018515	GAA	2	6	106321	106326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
487	NC_018515	AAG	2	6	106345	106350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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496	NC_018515	CCG	2	6	107316	107321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
497	NC_018515	ACC	2	6	107425	107430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_018515	AGG	2	6	107506	107511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_018515	TAG	2	6	107566	107571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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