MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 19632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	ATTT	2	8	45	52	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018068	A	7	7	53	59	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018068	CCT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018068	T	6	6	228	233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018068	AAC	2	6	239	244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018068	A	6	6	249	254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018068	T	8	8	293	300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018068	CAAG	2	8	308	315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018068	AAT	2	6	369	374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018068	TA	3	6	376	381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018068	A	6	6	411	416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018068	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018068	CTA	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018068	TAT	2	6	468	473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018068	T	6	6	530	535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018068	T	6	6	555	560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018068	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018068	T	6	6	2046	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018068	CTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018068	TAC	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018068	ACT	2	6	2123	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018068	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018068	TTA	3	9	2139	2147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018068	AGG	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018068	ATT	2	6	4664	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018068	TAGT	2	8	4709	4716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018068	TATT	2	8	4719	4726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018068	TTTA	2	8	4749	4756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018068	AAT	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018068	TAT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018068	GGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018068	AAAAT	2	10	9226	9235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018068	ATAA	2	8	9314	9321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018068	AGG	2	6	9323	9328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018068	AT	3	6	12120	12125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018068	TTG	2	6	12128	12133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018068	AT	3	6	12142	12147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018068	TGT	2	6	12163	12168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018068	TTC	2	6	12296	12301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018068	CTC	2	6	12598	12603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018068	GGA	2	6	13184	13189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018068	CCGT	2	8	13241	13248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018068	CCT	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018068	ATTT	2	8	13276	13283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018068	TGT	2	6	13323	13328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018068	T	6	6	13349	13354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018068	TAA	2	6	13433	13438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018068	ATT	2	6	13931	13936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018068	T	6	6	13974	13979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018068	TTA	2	6	14085	14090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018068	A	7	7	14108	14114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018068	AAAT	2	8	14118	14125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018068	ATTT	2	8	14180	14187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018068	AAGA	2	8	14192	14199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018068	CTGGCA	2	12	15078	15089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018068	TA	3	6	15111	15116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018068	ATT	2	6	15117	15122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018068	AGATA	2	10	15162	15171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018068	TTG	2	6	15194	15199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018068	CT	4	8	15311	15318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018068	AGC	2	6	15548	15553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018068	TG	3	6	15570	15575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018068	GGT	3	9	15623	15631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018068	TAT	2	6	15651	15656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018068	GGT	2	6	15666	15671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018068	T	6	6	15683	15688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018068	AAG	2	6	15826	15831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018068	TAT	2	6	15916	15921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018068	ATT	2	6	15931	15936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018068	ATA	2	6	17664	17669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018068	AAGA	2	8	18647	18654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018068	TTC	2	6	18667	18672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018068	CTGG	2	8	18678	18685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018068	TAT	2	6	19002	19007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018068	CTT	2	6	19010	19015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018068	CAA	2	6	19024	19029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018068	AGT	2	6	19082	19087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018068	TTC	2	6	19129	19134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018068	GAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018068	GA	3	6	19171	19176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018068	AAATT	2	10	19208	19217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018068	AGG	2	6	19230	19235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018068	CT	3	6	22830	22835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018068	T	7	7	22835	22841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018068	AATT	2	8	22884	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018068	TAT	2	6	22980	22985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018068	T	6	6	24094	24099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018068	CATTC	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018068	ACTT	2	8	24152	24159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018068	AGG	2	6	24181	24186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018068	GGA	2	6	28105	28110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018068	AAG	2	6	28431	28436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018068	GAT	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018068	A	6	6	28472	28477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018068	TCA	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018068	CAA	2	6	32898	32903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018068	AAG	2	6	32928	32933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018068	CCT	2	6	32945	32950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018068	TCAC	2	8	33292	33299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018068	TAC	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018068	AAATT	2	10	33386	33395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018068	AAAGGA	2	12	33400	33411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018068	T	6	6	33425	33430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018068	GAG	2	6	33485	33490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018068	T	8	8	36234	36241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018068	G	6	6	36268	36273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018068	A	6	6	37299	37304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018068	CAAC	2	8	37314	37321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018068	TGG	2	6	37351	37356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018068	GAA	2	6	38578	38583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018068	T	7	7	38603	38609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018068	TAA	2	6	38703	38708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018068	GCA	2	6	40326	40331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018068	CA	3	6	40330	40335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018068	GAT	2	6	41526	41531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018068	TTG	2	6	41624	41629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018068	ACGC	2	8	41652	41659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018068	TCG	2	6	41728	41733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018068	CAG	2	6	41770	41775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018068	AAGG	2	8	41836	41843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018068	GCA	2	6	41870	41875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018068	A	6	6	41993	41998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018068	GCC	2	6	42047	42052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018068	GCC	2	6	42151	42156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018068	CATA	2	8	43011	43018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018068	GTT	2	6	43021	43026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018068	T	6	6	44252	44257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018068	T	7	7	44332	44338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018068	TGC	2	6	44404	44409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018068	T	6	6	44430	44435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018068	TAA	2	6	44450	44455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018068	GGA	2	6	44501	44506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018068	TCA	2	6	45893	45898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018068	T	7	7	45952	45958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018068	GGA	2	6	46018	46023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018068	CTC	2	6	47569	47574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018068	AGG	2	6	47642	47647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018068	TTG	2	6	48527	48532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018068	T	6	6	48537	48542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018068	CCT	2	6	48958	48963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018068	ATAA	2	8	49022	49029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018068	A	6	6	49895	49900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018068	GTA	2	6	49914	49919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018068	AAC	3	9	49941	49949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018068	TTC	2	6	52648	52653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018068	CTT	2	6	52655	52660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018068	TTAAT	2	10	52694	52703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018068	AT	3	6	52734	52739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018068	TAA	2	6	52743	52748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018068	TTGT	2	8	93635	93642	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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