MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 3592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018001	ACT	2	6	442132	442137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_018001	TAG	2	6	442177	442182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018001	TAA	2	6	442248	442253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018001	GGA	2	6	442306	442311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018001	AT	3	6	442335	442340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018001	AAAC	2	8	442371	442378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_018001	GTC	2	6	442466	442471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_018001	AATA	2	8	442498	442505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018001	GCA	2	6	442536	442541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_018001	TGT	2	6	442641	442646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018001	GTG	2	6	442671	442676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018001	ACA	2	6	442694	442699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018001	GCT	2	6	442859	442864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_018001	TTG	2	6	442890	442895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018001	GA	3	6	442896	442901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018001	TC	3	6	442957	442962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_018001	GCT	2	6	442973	442978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_018001	GA	3	6	442985	442990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018001	AG	3	6	443085	443090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018001	GAT	2	6	443107	443112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018001	CGC	2	6	443157	443162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_018001	CTA	2	6	443230	443235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_018001	GAG	2	6	443236	443241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018001	AT	3	6	443287	443292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018001	GAGCTA	2	12	443296	443307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_018001	A	7	7	443336	443342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018001	ACT	2	6	443351	443356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_018001	TA	3	6	443363	443368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018001	TGA	2	6	443400	443405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018001	AGA	2	6	443413	443418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018001	AGT	2	6	443441	443446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018001	TGG	2	6	445215	445220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018001	TTA	2	6	445909	445914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018001	TTA	2	6	445923	445928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018001	AC	3	6	449775	449780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_018001	CCA	2	6	450037	450042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_018001	TAT	3	9	450045	450053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018001	TTAA	2	8	450158	450165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018001	TCA	2	6	453241	453246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018001	AAT	2	6	453247	453252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018001	TAA	2	6	453281	453286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018001	TTG	2	6	453306	453311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018001	ATTA	2	8	453325	453332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018001	AG	3	6	453335	453340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018001	TAAA	2	8	455890	455897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018001	GTG	2	6	456008	456013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018001	AT	3	6	461310	461315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018001	TACTC	2	10	471065	471074	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1049	NC_018001	TA	3	6	471113	471118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018001	GAG	2	6	471266	471271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018001	GGT	2	6	471276	471281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018001	TC	3	6	471283	471288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_018001	TAT	2	6	471322	471327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018001	AAC	2	6	471386	471391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_018001	GAT	2	6	471440	471445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018001	TGGG	2	8	471462	471469	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018001	GCC	2	6	471492	471497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_018001	CCGG	2	8	471528	471535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_018001	ACC	2	6	474290	474295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_018001	TA	3	6	474306	474311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018001	AT	3	6	474324	474329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018001	AAT	2	6	474331	474336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018001	ATAA	2	8	474348	474355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018001	CCCCT	2	10	474571	474580	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1065	NC_018001	A	9	9	474585	474593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018001	TAA	2	6	478346	478351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018001	ATT	2	6	478360	478365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018001	GAT	2	6	479175	479180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018001	TTGA	2	8	479182	479189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018001	T	6	6	480893	480898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018001	ATA	2	6	480972	480977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018001	ATTA	2	8	480987	480994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018001	TGCTG	2	10	481034	481043	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_018001	TAC	2	6	481079	481084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_018001	TC	3	6	481110	481115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_018001	GA	4	8	481117	481124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_018001	CCAC	2	8	482511	482518	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1078	NC_018001	TTA	2	6	482556	482561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_018001	AT	3	6	482600	482605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018001	CCA	2	6	482606	482611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_018001	GAG	2	6	482651	482656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018001	TAT	2	6	482685	482690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018001	T	6	6	482690	482695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018001	ATT	2	6	482706	482711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018001	AAT	2	6	482714	482719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018001	TGA	2	6	482725	482730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018001	CCG	2	6	483204	483209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_018001	ACT	2	6	483223	483228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_018001	ACT	2	6	483286	483291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018001	TAA	2	6	485538	485543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018001	GAA	2	6	487901	487906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018001	ATT	2	6	487962	487967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018001	AAG	2	6	487968	487973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018001	CAA	2	6	489663	489668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_018001	ATTA	2	8	489719	489726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018001	TAC	2	6	489732	489737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_018001	ATAACA	2	12	491011	491022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1098	NC_018001	TTG	2	6	491070	491075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018001	A	6	6	491386	491391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018001	ATT	2	6	491401	491406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018001	GGT	2	6	493852	493857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018001	ATCA	2	8	495649	495656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_018001	AAT	2	6	495981	495986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018001	TCAC	2	8	496014	496021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_018001	AGTA	2	8	496027	496034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018001	GAA	2	6	496097	496102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018001	GTAAA	2	10	497401	497410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018001	AGA	2	6	498144	498149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018001	AG	3	6	498237	498242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018001	GCTAT	2	10	498315	498324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_018001	AT	3	6	498323	498328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018001	CTAT	2	8	498405	498412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_018001	TACA	2	8	498414	498421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_018001	ATGT	2	8	498432	498439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018001	GGCT	2	8	498518	498525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_018001	ATT	2	6	498537	498542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018001	CT	3	6	498550	498555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_018001	AG	3	6	498556	498561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018001	GAG	2	6	498575	498580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018001	TTG	2	6	498581	498586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018001	TGT	2	6	498955	498960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018001	TAC	2	6	499329	499334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_018001	TC	3	6	499364	499369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_018001	ATT	2	6	499404	499409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018001	CTAT	2	8	500093	500100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_018001	TTG	2	6	500145	500150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018001	ACT	2	6	500180	500185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_018001	TTAA	2	8	500220	500227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018001	TAG	2	6	500307	500312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018001	TA	3	6	501277	501282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018001	GA	3	6	501336	501341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018001	ACT	2	6	501365	501370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_018001	CT	3	6	501414	501419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_018001	CAG	2	6	501427	501432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_018001	GAA	2	6	501436	501441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_018001	TTC	2	6	501510	501515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_018001	AAT	2	6	614048	614053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_018001	TGA	2	6	616307	616312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_018001	AAAT	2	8	616326	616333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_018001	TATT	2	8	618993	619000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_018001	CAA	2	6	619021	619026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_018001	TGA	2	6	619068	619073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_018001	CGC	2	6	621579	621584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1418	NC_018001	CAT	2	6	621631	621636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_018001	TAC	2	6	624521	624526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_018001	AC	3	6	630934	630939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1424	NC_018001	ACAT	2	8	631138	631145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1425	NC_018001	CTC	2	6	631147	631152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1432	NC_018001	TAA	2	6	631666	631671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_018001	CCTA	2	8	631696	631703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1434	NC_018001	T	7	7	632934	632940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_018001	GGT	2	6	641153	641158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_018001	ACT	2	6	642762	642767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1444	NC_018001	TAT	2	6	644185	644190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_018001	ATA	2	6	644204	644209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_018001	T	6	6	644359	644364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_018001	ATT	2	6	644386	644391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_018001	TGG	2	6	644406	644411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_018001	GA	3	6	645265	645270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_018001	AT	3	6	645275	645280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_018001	GAG	2	6	645293	645298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1469	NC_018001	ACC	2	6	646589	646594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1481	NC_018001	GTATG	2	10	648479	648488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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