MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 3592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018001	AAT	2	6	186004	186009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018001	TCA	2	6	187647	187652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018001	AAT	2	6	187663	187668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018001	TTTA	2	8	187678	187685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018001	TGG	2	6	189592	189597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018001	TCA	2	6	190852	190857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_018001	GTA	2	6	193421	193426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018001	A	6	6	193426	193431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018001	AGG	2	6	194428	194433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018001	GGCC	2	8	195556	195563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_018001	GAA	2	6	195585	195590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018001	TAC	2	6	195957	195962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_018001	TAAA	3	12	195977	195988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018001	GCC	2	6	201715	201720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_018001	CTC	2	6	201751	201756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_018001	AT	3	6	209027	209032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018001	TCA	2	6	211097	211102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_018001	TGCT	2	8	211128	211135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_018001	ATT	2	6	211185	211190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018001	ATG	2	6	211218	211223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018001	GGC	2	6	211227	211232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_018001	ATA	2	6	211239	211244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018001	TA	3	6	211263	211268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018001	ATT	2	6	211322	211327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018001	ATC	2	6	211338	211343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018001	GAG	2	6	211344	211349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018001	TCT	2	6	211775	211780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018001	CCA	2	6	211875	211880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_018001	CTC	2	6	211895	211900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_018001	CAA	2	6	211908	211913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018001	A	6	6	211918	211923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018001	GT	4	8	211944	211951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018001	ATA	2	6	213554	213559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018001	ATT	2	6	213561	213566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018001	TTTTTA	2	12	213587	213598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018001	TAT	2	6	213620	213625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018001	TTC	2	6	216528	216533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018001	TAT	2	6	216595	216600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018001	A	6	6	219107	219112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018001	CTT	2	6	219121	219126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_018001	TAA	3	9	219151	219159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018001	AAAT	2	8	219160	219167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018001	AAGTTA	2	12	219178	219189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018001	AT	3	6	219219	219224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018001	TGAA	2	8	221795	221802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018001	ATT	3	9	221825	221833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018001	ATT	3	9	221838	221846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018001	ATTA	2	8	221864	221871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018001	GAT	2	6	221880	221885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018001	GGT	2	6	221893	221898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018001	CCT	2	6	228084	228089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_018001	AAC	2	6	228126	228131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_018001	AGT	2	6	228164	228169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018001	TCGT	2	8	228189	228196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_018001	TCA	2	6	228259	228264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018001	CCCCA	2	10	228685	228694	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
557	NC_018001	TATT	2	8	232694	232701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018001	AT	3	6	232706	232711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018001	AGT	2	6	232744	232749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018001	TA	3	6	232767	232772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018001	AAT	2	6	232773	232778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018001	AT	3	6	233647	233652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018001	CAT	2	6	233661	233666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018001	GGC	2	6	233717	233722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_018001	TC	4	8	233753	233760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_018001	TC	3	6	233839	233844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_018001	CTT	2	6	233855	233860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_018001	CCG	2	6	233952	233957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_018001	TCC	2	6	233973	233978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_018001	ATA	2	6	234034	234039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018001	TTA	2	6	234052	234057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018001	GCT	2	6	234889	234894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018001	CTC	2	6	235246	235251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_018001	AT	3	6	235258	235263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018001	AAT	2	6	235308	235313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018001	GTT	2	6	235344	235349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018001	TGG	2	6	235375	235380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018001	ATA	2	6	237550	237555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018001	ATT	2	6	237600	237605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018001	TCC	2	6	237675	237680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_018001	GTT	2	6	237719	237724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018001	ATA	2	6	237770	237775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018001	GAG	2	6	237787	237792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018001	TTC	2	6	237845	237850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_018001	AT	3	6	237953	237958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018001	TAA	2	6	237960	237965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018001	ATAG	2	8	237979	237986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018001	TGT	2	6	237987	237992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018001	AAT	2	6	238007	238012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018001	TA	3	6	238033	238038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018001	TGAT	2	8	238388	238395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018001	CT	3	6	238402	238407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_018001	GGA	2	6	238413	238418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018001	AT	3	6	238466	238471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018001	ATA	2	6	238476	238481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018001	TGG	2	6	238487	238492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018001	AGT	2	6	239714	239719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018001	CAT	2	6	239730	239735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_018001	TTC	2	6	239748	239753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018001	A	6	6	239772	239777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018001	TAAA	2	8	239814	239821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018001	ATT	2	6	244132	244137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018001	TAT	2	6	244158	244163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018001	ATT	2	6	244172	244177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018001	TTAC	2	8	244183	244190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_018001	TAT	2	6	248759	248764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018001	AT	3	6	249831	249836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018001	ATAA	2	8	249872	249879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018001	CCT	2	6	249893	249898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_018001	CAC	2	6	250319	250324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_018001	AAT	2	6	250362	250367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018001	TTC	2	6	250374	250379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_018001	TTAA	2	8	250973	250980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018001	ATA	2	6	253679	253684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018001	ATT	2	6	259224	259229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018001	TA	3	6	259247	259252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018001	CT	3	6	260085	260090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_018001	TTG	2	6	260139	260144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018001	ATTT	2	8	260949	260956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018001	AGT	2	6	260960	260965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018001	TA	3	6	260975	260980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018001	TA	3	6	260986	260991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018001	GCT	2	6	261003	261008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_018001	GTG	2	6	261015	261020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018001	TCC	2	6	264388	264393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_018001	ATT	2	6	270243	270248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018001	ATTA	2	8	270254	270261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018001	AT	4	8	270282	270289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018001	AAT	2	6	270298	270303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018001	CAT	2	6	270331	270336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_018001	CAG	2	6	270348	270353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018001	TAC	2	6	271984	271989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_018001	GGCC	2	8	271990	271997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_018001	ACC	2	6	272476	272481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_018001	ATT	2	6	272512	272517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018001	ATT	2	6	272540	272545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018001	ATA	2	6	273193	273198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018001	TAT	2	6	273202	273207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018001	ACC	2	6	273263	273268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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762	NC_018001	TG	3	6	366723	366728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_018001	TA	3	6	366836	366841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_018001	CAGGG	2	10	368431	368440	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
777	NC_018001	TCA	2	6	369380	369385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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921	NC_018001	GCTT	2	8	418783	418790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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