MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P4

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017792	TCAG	2	8	46	53	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017792	GGC	2	6	54	59	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017792	CTG	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017792	AGC	2	6	1748	1753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017792	GGC	2	6	1761	1766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017792	CAC	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017792	TG	3	6	2442	2447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017792	AG	3	6	2453	2458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017792	ATG	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017792	GCA	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017792	AGC	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017792	CCG	2	6	2878	2883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017792	GAT	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017792	AGG	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017792	CA	3	6	2973	2978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017792	GAC	2	6	3023	3028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017792	GAG	2	6	3038	3043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017792	CTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017792	CCT	2	6	3181	3186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017792	CTG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017792	AGC	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017792	ACCATC	2	12	4196	4207	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017792	GGCTG	2	10	4995	5004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017792	ACC	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017792	GGA	2	6	5834	5839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017792	GGA	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017792	CAC	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017792	CAC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017792	C	6	6	6769	6774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_017792	CCA	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017792	CTT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017792	CG	3	6	6872	6877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017792	GCT	3	9	6928	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017792	CTG	2	6	6971	6976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017792	GTG	2	6	7487	7492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017792	GCA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017792	CGA	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017792	CAA	2	6	7583	7588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017792	ATC	2	6	7592	7597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017792	ACC	2	6	7686	7691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017792	GCC	2	6	7739	7744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017792	CTG	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017792	GAC	2	6	7989	7994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017792	TAA	2	6	8563	8568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017792	CAC	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017792	TGG	2	6	13434	13439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017792	TGGG	2	8	13452	13459	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017792	CGG	2	6	13469	13474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017792	AAT	2	6	13495	13500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017792	CTT	2	6	13507	13512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017792	GCC	2	6	13564	13569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017792	AAGAA	2	10	13572	13581	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017792	TTA	2	6	13602	13607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017792	AAG	3	9	14253	14261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017792	GTC	2	6	14263	14268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017792	CTT	2	6	14379	14384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017792	GAT	2	6	14411	14416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017792	AGCT	2	8	14466	14473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017792	CTA	2	6	15255	15260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017792	CAT	2	6	15272	15277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017792	AAT	2	6	15298	15303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017792	CGA	2	6	15308	15313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017792	ACA	3	9	18450	18458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017792	GAG	2	6	18461	18466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017792	CTA	2	6	18584	18589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017792	AG	3	6	18638	18643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017792	C	6	6	18804	18809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_017792	ATT	2	6	18878	18883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017792	GT	3	6	18968	18973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017792	AATA	2	8	18989	18996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017792	ATC	2	6	19084	19089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017792	AAT	2	6	19187	19192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017792	GAC	2	6	19326	19331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017792	TCT	2	6	19338	19343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017792	GGA	2	6	20904	20909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017792	GGT	2	6	20988	20993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017792	CCT	2	6	21028	21033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017792	G	6	6	21034	21039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017792	GCGACC	2	12	21115	21126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017792	CTCCC	2	10	21129	21138	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_017792	AGAA	2	8	21560	21567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017792	CTTT	2	8	21570	21577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017792	AAAG	2	8	22411	22418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017792	GAAA	3	12	22426	22437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017792	AGG	2	6	22553	22558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017792	TCG	2	6	22807	22812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017792	GGT	2	6	22814	22819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017792	CTG	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017792	CCTA	2	8	22915	22922	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017792	AGAA	2	8	22947	22954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017792	CTTT	2	8	22957	22964	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017792	AGA	2	6	22984	22989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017792	CAA	3	9	23002	23010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017792	A	6	6	23009	23014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017792	CCTG	2	8	23015	23022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017792	CAGG	2	8	23037	23044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017792	TTC	2	6	23046	23051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017792	CTC	2	6	23078	23083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017792	GCT	2	6	23162	23167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017792	TGG	2	6	23179	23184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017792	GGGC	2	8	23208	23215	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017792	GGGC	2	8	23219	23226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017792	ACGGCG	2	12	23231	23242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017792	GGC	2	6	23247	23252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017792	GGCC	2	8	23325	23332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017792	GCGCC	2	10	23367	23376	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017792	CTC	2	6	23393	23398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017792	AGC	2	6	23427	23432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017792	TCG	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017792	AGC	2	6	23493	23498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017792	AGG	2	6	23518	23523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017792	T	6	6	23552	23557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017792	CTC	2	6	23676	23681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017792	TCG	2	6	23686	23691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017792	CCAAG	2	10	23705	23714	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017792	CGC	2	6	23726	23731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017792	CGCGG	2	10	23735	23744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017792	TGC	2	6	23839	23844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017792	CTG	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017792	CAG	2	6	23907	23912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017792	CTG	2	6	23925	23930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017792	TGTGG	2	10	23936	23945	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017792	TGC	2	6	23977	23982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017792	GCA	2	6	23992	23997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017792	TCT	2	6	24020	24025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017792	CCG	2	6	24106	24111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017792	TGG	2	6	24115	24120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017792	CGA	2	6	24167	24172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017792	GAC	2	6	24183	24188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017792	GCAAG	2	10	24222	24231	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017792	GAG	2	6	24237	24242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017792	TGG	2	6	24270	24275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017792	AG	3	6	24861	24866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017792	GCA	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017792	CA	3	6	30444	30449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017792	AT	3	6	30456	30461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017792	CTTACG	2	12	30474	30485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017792	TAATA	2	10	30489	30498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017792	GAA	2	6	30536	30541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017792	AT	3	6	30543	30548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017792	TAGT	2	8	30599	30606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017792	GAA	2	6	30632	30637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017792	GGA	2	6	30642	30647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017792	CTGC	2	8	30797	30804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017792	GCT	2	6	30822	30827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.