MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 10582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017310	TCC	2	6	3505369	3505374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_017310	C	6	6	3505377	3505382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10503	NC_017310	GAT	2	6	3505386	3505391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_017310	CACGAA	2	12	3505400	3505411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_017310	TGC	2	6	3505478	3505483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_017310	G	6	6	3505487	3505492	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_017310	CAT	2	6	3505497	3505502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_017310	CAT	2	6	3505519	3505524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_017310	TCA	2	6	3506289	3506294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_017310	CCCG	2	8	3506326	3506333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10511	NC_017310	GAC	2	6	3506341	3506346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_017310	CAC	2	6	3506507	3506512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_017310	AC	3	6	3506551	3506556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_017310	CG	3	6	3506559	3506564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10515	NC_017310	ACG	2	6	3506566	3506571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_017310	TGC	2	6	3506946	3506951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_017310	CTT	2	6	3506962	3506967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_017310	ATC	2	6	3507065	3507070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_017310	CAAG	2	8	3507093	3507100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10520	NC_017310	GAC	2	6	3510164	3510169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_017310	CT	3	6	3510236	3510241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10522	NC_017310	GCCT	2	8	3510246	3510253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_017310	AGC	2	6	3510260	3510265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_017310	CCCG	2	8	3510277	3510284	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10525	NC_017310	AG	3	6	3510327	3510332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_017310	CT	3	6	3510333	3510338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_017310	CAT	2	6	3514671	3514676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_017310	GC	3	6	3514693	3514698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10529	NC_017310	GC	4	8	3514710	3514717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10530	NC_017310	CCT	2	6	3517357	3517362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10531	NC_017310	GAT	2	6	3519155	3519160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_017310	TGT	2	6	3519192	3519197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_017310	TGCG	2	8	3519276	3519283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10534	NC_017310	G	6	6	3519359	3519364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_017310	GCCC	2	8	3519389	3519396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10536	NC_017310	ATG	2	6	3519398	3519403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_017310	TATC	2	8	3519468	3519475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10538	NC_017310	ATC	2	6	3519503	3519508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_017310	GATTC	2	10	3519548	3519557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10540	NC_017310	CGC	2	6	3519686	3519691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10541	NC_017310	CAA	2	6	3521734	3521739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_017310	CATA	2	8	3522196	3522203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10543	NC_017310	CAT	2	6	3522252	3522257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_017310	GCGCC	2	10	3522258	3522267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10545	NC_017310	GGC	2	6	3522298	3522303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_017310	GCC	2	6	3522336	3522341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10547	NC_017310	GCGG	2	8	3522356	3522363	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10548	NC_017310	C	6	6	3525082	3525087	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10549	NC_017310	TTGT	2	8	3525108	3525115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_017310	C	6	6	3525163	3525168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10551	NC_017310	CCGG	2	8	3525182	3525189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10552	NC_017310	CGT	2	6	3525202	3525207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_017310	GCC	2	6	3525225	3525230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10554	NC_017310	ATGG	2	8	3525231	3525238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_017310	GC	3	6	3525276	3525281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10556	NC_017310	CCG	2	6	3525283	3525288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_017310	GCC	2	6	3525289	3525294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_017310	CGC	2	6	3525321	3525326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_017310	AGG	2	6	3525347	3525352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_017310	GC	3	6	3525367	3525372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10561	NC_017310	CGC	2	6	3525381	3525386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10562	NC_017310	CGC	2	6	3525401	3525406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10563	NC_017310	AGC	2	6	3525408	3525413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_017310	GTC	2	6	3526588	3526593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_017310	GGC	2	6	3529385	3529390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_017310	GGCAT	2	10	3529418	3529427	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10567	NC_017310	TCGG	2	8	3529453	3529460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10568	NC_017310	GACA	2	8	3529523	3529530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10569	NC_017310	TTCT	2	8	3529560	3529567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10570	NC_017310	GCC	2	6	3529658	3529663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_017310	CTT	2	6	3529687	3529692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_017310	GCTAC	2	10	3529701	3529710	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10573	NC_017310	GAG	2	6	3529725	3529730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_017310	CAC	2	6	3530560	3530565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10575	NC_017310	CA	3	6	3530569	3530574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10576	NC_017310	ACC	2	6	3531621	3531626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10577	NC_017310	T	6	6	3531657	3531662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_017310	CAG	2	6	3531721	3531726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_017310	ACC	2	6	3531790	3531795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10580	NC_017310	CAC	2	6	3531821	3531826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10581	NC_017310	CAC	2	6	3532007	3532012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10582	NC_017310	CAC	2	6	3532020	3532025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.