MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 11834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016629	TC	3	6	176539	176544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_016629	TGT	2	6	177072	177077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016629	T	6	6	177108	177113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016629	ATT	2	6	177187	177192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016629	AGC	2	6	177295	177300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016629	GGA	2	6	177305	177310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016629	CGCT	2	8	180180	180187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
508	NC_016629	TCC	2	6	180374	180379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_016629	CCGA	2	8	180391	180398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
510	NC_016629	AGG	2	6	180420	180425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016629	CCT	2	6	184446	184451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_016629	A	6	6	184469	184474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016629	GTCAG	2	10	184547	184556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
514	NC_016629	AGAAA	2	10	184615	184624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016629	AGG	2	6	184655	184660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016629	ACG	2	6	185903	185908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016629	CAGGA	2	10	185978	185987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
518	NC_016629	CGATG	2	10	186041	186050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
519	NC_016629	GGAT	2	8	186111	186118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016629	CCT	2	6	186153	186158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_016629	ACCG	2	8	186172	186179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_016629	CTCC	2	8	187480	187487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
523	NC_016629	ACTG	2	8	187518	187525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_016629	A	6	6	187529	187534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016629	T	6	6	187546	187551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016629	CGG	2	6	187573	187578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016629	TC	5	10	187670	187679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_016629	TGG	2	6	188663	188668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016629	GGA	2	6	188686	188691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016629	T	8	8	190421	190428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016629	GC	3	6	190453	190458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_016629	GGA	2	6	190472	190477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016629	AAG	2	6	192690	192695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016629	TCA	2	6	192705	192710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016629	GGA	2	6	193264	193269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016629	CAT	2	6	194306	194311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016629	CT	3	6	195682	195687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_016629	GGCGTA	2	12	198624	198635	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
539	NC_016629	AGTAT	2	10	200418	200427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016629	TCCG	2	8	200519	200526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_016629	CCG	2	6	200536	200541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_016629	CAA	2	6	200583	200588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016629	CG	3	6	201705	201710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_016629	T	6	6	201715	201720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016629	CCG	2	6	201786	201791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_016629	AGG	2	6	201886	201891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016629	AGG	2	6	202460	202465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016629	TCCT	2	8	206405	206412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_016629	CGG	2	6	206495	206500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016629	TTA	2	6	206513	206518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016629	CTC	2	6	206589	206594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_016629	AAT	2	6	206673	206678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016629	GCC	2	6	207361	207366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_016629	ATC	2	6	207395	207400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016629	ATT	2	6	207433	207438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016629	CGAGAG	2	12	207460	207471	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
557	NC_016629	GAG	2	6	207537	207542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016629	GCG	2	6	213555	213560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016629	GCC	2	6	213565	213570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_016629	CCGC	2	8	213611	213618	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
561	NC_016629	GT	3	6	213660	213665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016629	CTTT	2	8	213880	213887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_016629	GCC	2	6	214245	214250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_016629	AGG	2	6	214285	214290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016629	GCG	2	6	214300	214305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_016629	TGC	2	6	215529	215534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016629	CA	3	6	215661	215666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_016629	CCG	2	6	215674	215679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_016629	GC	3	6	215689	215694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_016629	GC	3	6	215708	215713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_016629	T	6	6	215727	215732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016629	AG	4	8	218795	218802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016629	ATT	2	6	224115	224120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016629	GCA	2	6	224163	224168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016629	CCT	2	6	226520	226525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_016629	TTG	2	6	228877	228882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016629	GA	3	6	228911	228916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016629	CT	3	6	228927	228932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_016629	ACG	2	6	229026	229031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016629	CTG	2	6	229206	229211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016629	GTG	2	6	229243	229248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016629	TC	3	6	229311	229316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_016629	TA	3	6	229329	229334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016629	CCA	2	6	229352	229357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_016629	GACG	2	8	230125	230132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
586	NC_016629	AGGC	2	8	230191	230198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_016629	TAC	2	6	230321	230326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016629	AAT	2	6	230452	230457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016629	TCATT	2	10	230470	230479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
590	NC_016629	CTT	2	6	230502	230507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_016629	GGGC	2	8	230537	230544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
592	NC_016629	TCC	2	6	231475	231480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_016629	GC	3	6	233799	233804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_016629	GCCG	2	8	234631	234638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_016629	CTG	2	6	234640	234645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016629	CGG	2	6	234669	234674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016629	GCGTAT	2	12	234679	234690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
598	NC_016629	GCTG	2	8	234773	234780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_016629	TAGT	2	8	234882	234889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016629	TGT	2	6	234942	234947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016629	T	6	6	236343	236348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016629	TGA	2	6	236381	236386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016629	C	6	6	236425	236430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
604	NC_016629	CATG	2	8	236542	236549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_016629	TGCA	2	8	236583	236590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016629	GAC	2	6	236640	236645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_016629	GA	3	6	236672	236677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016629	GAT	2	6	237364	237369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016629	CCG	2	6	237419	237424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_016629	CCG	2	6	238087	238092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_016629	CCT	2	6	238100	238105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_016629	CTT	2	6	238141	238146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_016629	GCC	2	6	238200	238205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_016629	ATAA	2	8	238206	238213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016629	GCC	2	6	238219	238224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_016629	TGCA	2	8	238237	238244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_016629	TCA	2	6	246604	246609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016629	TTG	2	6	246644	246649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016629	GAT	2	6	246657	246662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016629	AGT	2	6	246921	246926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016629	CTC	2	6	247319	247324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_016629	TC	3	6	247872	247877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_016629	AGG	2	6	247885	247890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016629	CGGG	2	8	247896	247903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
625	NC_016629	CGCC	2	8	247944	247951	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
626	NC_016629	TA	3	6	247985	247990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016629	A	7	7	248010	248016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016629	AGG	2	6	250091	250096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016629	CTAC	2	8	251675	251682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_016629	ACA	2	6	251825	251830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016629	CCT	2	6	251842	251847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_016629	TGG	3	9	251871	251879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016629	G	6	6	251878	251883	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016629	TAT	2	6	251958	251963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016629	CTG	2	6	251997	252002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016629	GCT	2	6	252014	252019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016629	CAG	2	6	252038	252043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016629	CTG	2	6	252052	252057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_016629	TTA	2	6	252199	252204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_016629	T	6	6	300878	300883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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