MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 chromosome

Total Repeats: 14779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015589	TCA	3	9	1	9	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015589	T	8	8	54	61	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015589	T	6	6	96	101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015589	TAA	2	6	1510	1515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015589	TAC	3	9	1604	1612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015589	A	6	6	1619	1624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015589	TAA	2	6	1631	1636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015589	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015589	T	6	6	4405	4410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015589	CCTT	2	8	4479	4486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015589	ATC	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015589	A	6	6	6541	6546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015589	AGG	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015589	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015589	TAA	2	6	7540	7545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015589	TAA	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015589	TTCG	2	8	7594	7601	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015589	TAT	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015589	T	7	7	10174	10180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015589	T	8	8	10202	10209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015589	AT	3	6	10216	10221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015589	CGC	2	6	10229	10234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015589	GTT	2	6	10241	10246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015589	GGCA	2	8	10267	10274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015589	GCA	3	9	10272	10280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015589	AGA	2	6	10287	10292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015589	A	6	6	10294	10299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015589	ATT	2	6	10302	10307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015589	ATG	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015589	AAG	2	6	10336	10341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015589	A	7	7	10370	10376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015589	A	6	6	10385	10390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015589	AGA	2	6	10441	10446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015589	GAT	2	6	10492	10497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015589	A	6	6	10550	10555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015589	GGC	2	6	10675	10680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015589	AGG	2	6	10845	10850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015589	CGA	2	6	10919	10924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015589	GCA	2	6	10993	10998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015589	CGC	2	6	11040	11045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015589	GAA	2	6	11052	11057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015589	GAA	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015589	CAG	2	6	11139	11144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015589	GGT	2	6	11204	11209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015589	TGG	2	6	11263	11268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015589	GGA	2	6	11329	11334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015589	GGC	2	6	11349	11354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015589	C	8	8	11465	11472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_015589	GAA	2	6	11594	11599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015589	AG	3	6	11663	11668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015589	GGT	2	6	11672	11677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015589	GTC	2	6	11686	11691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015589	TCGTG	2	10	11695	11704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015589	GGA	2	6	11800	11805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015589	ATC	2	6	11824	11829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015589	AC	3	6	11851	11856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015589	TAC	2	6	11858	11863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015589	GAAGC	2	10	11881	11890	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015589	TGAAG	2	10	11893	11902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015589	AC	3	6	12020	12025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015589	CAC	2	6	12035	12040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015589	ACA	2	6	12049	12054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015589	GA	3	6	12081	12086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015589	CCT	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015589	CAAG	2	8	12204	12211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015589	AGC	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015589	CG	3	6	12301	12306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015589	TCA	2	6	12323	12328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015589	GA	3	6	12346	12351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015589	CAG	2	6	12393	12398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015589	AAG	2	6	12475	12480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015589	CGT	2	6	12486	12491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015589	GAAG	2	8	12527	12534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015589	AAGA	2	8	12541	12548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015589	GAA	2	6	12584	12589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015589	CGG	2	6	12665	12670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015589	AGG	2	6	12711	12716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015589	GGA	2	6	12748	12753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015589	AAAG	2	8	12754	12761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015589	GCG	2	6	12782	12787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015589	TCA	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015589	G	6	6	12983	12988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015589	ACC	2	6	12989	12994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015589	C	6	6	12993	12998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_015589	GGGAG	2	10	13064	13073	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015589	AAGCGA	2	12	13203	13214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015589	AGG	2	6	13328	13333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015589	GGA	2	6	13417	13422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015589	AGC	2	6	13646	13651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015589	AAG	2	6	13812	13817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015589	CCG	2	6	13864	13869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015589	ACC	2	6	13973	13978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015589	AGG	2	6	14006	14011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015589	CGG	2	6	14023	14028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015589	GAG	2	6	14091	14096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015589	AGC	2	6	14123	14128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015589	CCGTA	2	10	14175	14184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015589	AGGT	2	8	14194	14201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015589	GC	3	6	14219	14224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015589	GA	3	6	14225	14230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015589	CGG	2	6	14478	14483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015589	GACAG	2	10	14624	14633	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015589	GTAT	2	8	14724	14731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015589	ACC	2	6	14749	14754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015589	GGAA	2	8	14880	14887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015589	CG	3	6	14890	14895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015589	CGG	2	6	14972	14977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015589	CGT	2	6	15168	15173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015589	CGCAGG	2	12	15197	15208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015589	GGAC	2	8	15250	15257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015589	GAC	2	6	15393	15398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015589	ATCG	2	8	15454	15461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015589	GAAT	2	8	15513	15520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015589	CAG	2	6	15580	15585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015589	TCC	2	6	15591	15596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015589	GTC	2	6	15638	15643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015589	T	6	6	15653	15658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015589	AT	3	6	15704	15709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015589	A	6	6	15713	15718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015589	AAAG	2	8	15750	15757	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015589	GGT	2	6	15917	15922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015589	T	6	6	17208	17213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015589	TCA	2	6	17240	17245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015589	T	6	6	17255	17260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015589	TA	3	6	17314	17319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015589	T	7	7	17365	17371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015589	TTA	2	6	17379	17384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015589	A	6	6	17384	17389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015589	T	6	6	17407	17412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015589	AGG	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015589	AGG	2	6	18600	18605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015589	AT	3	6	19873	19878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015589	T	6	6	19950	19955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015589	G	6	6	19977	19982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015589	ATT	2	6	21226	21231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015589	ATAAA	2	10	21353	21362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015589	AAT	2	6	21375	21380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015589	AGT	2	6	21381	21386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015589	TAA	2	6	23322	23327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015589	ATT	2	6	23354	23359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015589	AAT	2	6	23365	23370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015589	GGC	2	6	23414	23419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015589	AGG	2	6	23424	23429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015589	TCC	2	6	23739	23744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_015589	ACAA	2	8	23779	23786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015589	A	6	6	23818	23823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015589	AAAC	2	8	23828	23835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015589	TCCTT	2	10	23861	23870	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_015589	AG	3	6	23873	23878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015589	GGTG	2	8	23881	23888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015589	TCC	2	6	23918	23923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_015589	AGA	2	6	23959	23964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015589	GAT	2	6	23987	23992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015589	CAA	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015589	ATC	2	6	24084	24089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015589	CGG	2	6	24123	24128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_015589	GGA	2	6	24146	24151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015589	AAC	2	6	26895	26900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015589	GTA	2	6	26974	26979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015589	CAA	2	6	27021	27026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_015589	AAC	2	6	28346	28351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015589	AGG	2	6	28463	28468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_015589	CTT	2	6	28685	28690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_015589	TTA	2	6	28755	28760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_015589	TA	3	6	29245	29250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015589	C	6	6	29985	29990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
171	NC_015589	TA	3	6	30047	30052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015589	AGG	2	6	30159	30164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015589	AGG	2	6	30291	30296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015589	GTT	2	6	30337	30342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015589	CTT	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_015589	T	7	7	30463	30469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015589	ACA	2	6	30958	30963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_015589	CTCGA	2	10	30996	31005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_015589	TGA	2	6	31020	31025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015589	CT	3	6	31029	31034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_015589	AAT	2	6	31063	31068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015589	TTAAGG	2	12	31078	31089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015589	T	6	6	31124	31129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015589	TG	3	6	31190	31195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015589	TAA	2	6	31240	31245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015589	ATA	2	6	31281	31286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015589	AT	3	6	31296	31301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015589	AGAA	2	8	31309	31316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015589	AAG	2	6	33152	33157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015589	AAT	2	6	33201	33206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015589	TTA	2	6	34230	34235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015589	AATT	2	8	34297	34304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_015589	T	6	6	44547	44552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_015589	TAA	2	6	48850	48855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_015589	CCA	2	6	49915	49920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_015589	CTT	2	6	51033	51038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_015589	CACATA	2	12	51111	51122	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_015589	ACC	2	6	51132	51137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_015589	TTC	2	6	51159	51164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_015589	TCT	2	6	51242	51247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_015589	GAT	2	6	51327	51332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015589	CGG	2	6	51454	51459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_015589	CATT	2	8	51499	51506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
289	NC_015589	CGGGT	2	10	51551	51560	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_015589	TGTAT	2	10	51628	51637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015589	GTA	2	6	52009	52014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015589	TTAT	2	8	52015	52022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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