MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Delftia sp. Cs1-4 chromosome

Total Repeats: 15476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015563	CCTG	2	8	1438912	1438919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_015563	GCA	2	6	1438929	1438934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015563	GCCC	2	8	1438935	1438942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3004	NC_015563	GTT	2	6	1438962	1438967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015563	GAG	2	6	1438970	1438975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015563	GGC	2	6	1442264	1442269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015563	T	6	6	1442278	1442283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015563	CAA	2	6	1442341	1442346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015563	CA	3	6	1442369	1442374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_015563	TG	3	6	1442388	1442393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015563	CGGT	2	8	1442398	1442405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_015563	ACC	2	6	1442414	1442419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_015563	ATGG	2	8	1442432	1442439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015563	ACC	2	6	1442444	1442449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_015563	TGCA	2	8	1444652	1444659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_015563	T	8	8	1444680	1444687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015563	GTG	2	6	1444707	1444712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015563	CTG	2	6	1444738	1444743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015563	CGCGG	2	10	1444771	1444780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3020	NC_015563	AGGCG	2	10	1447517	1447526	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_015563	CG	3	6	1447565	1447570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_015563	ATG	2	6	1447681	1447686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015563	CCG	2	6	1447730	1447735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_015563	TGG	3	9	1448814	1448822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015563	GCT	2	6	1448865	1448870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015563	TGA	2	6	1448914	1448919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015563	A	7	7	1448928	1448934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015563	TGG	2	6	1448939	1448944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015563	GCT	2	6	1448987	1448992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015563	TGG	2	6	1449070	1449075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015563	GCT	2	6	1449118	1449123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_015563	T	6	6	1449190	1449195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015563	TGG	2	6	1449238	1449243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015563	GCC	2	6	1449263	1449268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_015563	A	7	7	1449283	1449289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015563	GGC	2	6	1449290	1449295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015563	GCC	2	6	1449300	1449305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_015563	GC	3	6	1449318	1449323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_015563	GC	3	6	1449325	1449330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_015563	GCTTG	2	10	1450363	1450372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3041	NC_015563	GCGG	2	8	1450385	1450392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_015563	CGGG	2	8	1450395	1450402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_015563	GGC	2	6	1450415	1450420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_015563	A	6	6	1450435	1450440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015563	TGAT	2	8	1450467	1450474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015563	GC	3	6	1450552	1450557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_015563	G	6	6	1450609	1450614	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015563	TC	3	6	1453769	1453774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_015563	TGTGG	2	10	1453776	1453785	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015563	TGCG	2	8	1453789	1453796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_015563	CGG	2	6	1453823	1453828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015563	GGCG	2	8	1453847	1453854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_015563	CGC	2	6	1453860	1453865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_015563	GCG	2	6	1453949	1453954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015563	GGC	2	6	1453996	1454001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015563	CGC	2	6	1454008	1454013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_015563	GCG	2	6	1454017	1454022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_015563	GGC	2	6	1454040	1454045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_015563	GCC	2	6	1456059	1456064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_015563	GCC	2	6	1456163	1456168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_015563	A	7	7	1456200	1456206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015563	AGA	2	6	1456210	1456215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015563	GAA	2	6	1456233	1456238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015563	GAA	2	6	1456245	1456250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015563	GCCGC	2	10	1457198	1457207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3066	NC_015563	CG	3	6	1457238	1457243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_015563	GCG	2	6	1458276	1458281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015563	GTC	2	6	1458291	1458296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_015563	TGC	2	6	1458326	1458331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_015563	GCC	2	6	1458342	1458347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_015563	ACC	2	6	1461704	1461709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_015563	GA	3	6	1461713	1461718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015563	T	6	6	1462621	1462626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015563	G	6	6	1462632	1462637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015563	CTTC	2	8	1462688	1462695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_015563	TGAGGC	2	12	1463625	1463636	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3077	NC_015563	TG	3	6	1465723	1465728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015563	CGA	2	6	1465737	1465742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_015563	GC	3	6	1465782	1465787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_015563	GCC	2	6	1465790	1465795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_015563	GCG	2	6	1465805	1465810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015563	GC	3	6	1465848	1465853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_015563	CG	4	8	1465876	1465883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_015563	TGC	2	6	1466062	1466067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_015563	GTG	2	6	1466153	1466158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015563	GAT	2	6	1466243	1466248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015563	TTTG	2	8	1466341	1466348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015563	AGG	2	6	1466850	1466855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015563	GAC	2	6	1468396	1468401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_015563	GCG	2	6	1468416	1468421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015563	CGGC	2	8	1468422	1468429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_015563	CTT	2	6	1468516	1468521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_015563	CGGG	2	8	1470433	1470440	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_015563	GCC	2	6	1470489	1470494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_015563	CG	3	6	1470523	1470528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_015563	G	6	6	1470528	1470533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015563	GCC	2	6	1470537	1470542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_015563	C	6	6	1472064	1472069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3099	NC_015563	GC	3	6	1473087	1473092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_015563	GGAC	2	8	1475931	1475938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_015563	TC	3	6	1475939	1475944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_015563	TGT	2	6	1475949	1475954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015563	GCA	2	6	1475970	1475975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_015563	TGTA	2	8	1475979	1475986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015563	TGG	2	6	1476002	1476007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015563	GCA	2	6	1476097	1476102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_015563	ATC	2	6	1476128	1476133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_015563	CTGC	2	8	1476229	1476236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_015563	GGC	2	6	1482442	1482447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_015563	ATG	2	6	1482458	1482463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015563	T	6	6	1482481	1482486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015563	TGGCGT	2	12	1483388	1483399	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3114	NC_015563	CGC	2	6	1483416	1483421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_015563	CGG	2	6	1483446	1483451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015563	GCCC	2	8	1483475	1483482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3117	NC_015563	AGGGC	2	10	1483487	1483496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3118	NC_015563	CCA	2	6	1483499	1483504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_015563	AG	4	8	1483540	1483547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015563	AGC	2	6	1485659	1485664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_015563	GCC	2	6	1485665	1485670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_015563	CGG	2	6	1485714	1485719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015563	GCC	2	6	1486724	1486729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_015563	CAA	2	6	1486778	1486783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_015563	CA	3	6	1488263	1488268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_015563	CCG	2	6	1493832	1493837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_015563	ACAG	2	8	1493856	1493863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_015563	CATGG	2	10	1497582	1497591	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3129	NC_015563	GATT	2	8	1497602	1497609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015563	GACT	2	8	1497615	1497622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_015563	CA	3	6	1497643	1497648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_015563	CCT	2	6	1498612	1498617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_015563	A	6	6	1500292	1500297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015563	GCC	2	6	1500298	1500303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_015563	GCGG	2	8	1500312	1500319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3136	NC_015563	TGT	2	6	1502034	1502039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_015563	TCG	2	6	1502050	1502055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_015563	GA	4	8	1502103	1502110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_015563	CGG	2	6	1503434	1503439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_015563	CGGC	2	8	1505206	1505213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_015563	GCG	2	6	1505285	1505290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_015563	TAG	2	6	1505329	1505334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3144	NC_015563	TGTC	2	8	1505413	1505420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3146	NC_015563	A	8	8	1506980	1506987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_015563	TGC	2	6	1507012	1507017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_015563	GGC	2	6	1507133	1507138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_015563	GCC	2	6	1507162	1507167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3150	NC_015563	TGC	3	9	1508675	1508683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3151	NC_015563	GC	3	6	1508717	1508722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3152	NC_015563	GCTG	2	8	1508730	1508737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3153	NC_015563	CGG	2	6	1508802	1508807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_015563	GCC	2	6	1508827	1508832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3155	NC_015563	CGG	2	6	1508843	1508848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_015563	TG	3	6	1509822	1509827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3162	NC_015563	GCCG	2	8	1513807	1513814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3163	NC_015563	CG	3	6	1513843	1513848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3168	NC_015563	TGT	2	6	1515803	1515808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3172	NC_015563	CGAAA	2	10	1519083	1519092	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3173	NC_015563	GA	3	6	1519170	1519175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_015563	GCT	2	6	1519201	1519206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3194	NC_015563	GCC	2	6	1531971	1531976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3195	NC_015563	T	6	6	1531986	1531991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3252	NC_015563	CCCGG	2	10	1561194	1561203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3257	NC_015563	GGC	2	6	1562514	1562519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3259	NC_015563	CGGG	2	8	1562544	1562551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_015563	TGA	2	6	1562609	1562614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_015563	TCG	2	6	1562621	1562626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_015563	GCG	2	6	1562670	1562675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_015563	TGCC	2	8	1562687	1562694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3264	NC_015563	GGC	2	6	1562726	1562731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3399	NC_015563	GGCCG	2	10	1659833	1659842	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3400	NC_015563	GC	3	6	1661445	1661450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3401	NC_015563	A	6	6	1661550	1661555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3402	NC_015563	GCA	2	6	1661562	1661567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3403	NC_015563	A	6	6	1662968	1662973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3405	NC_015563	CATGGT	2	12	1663188	1663199	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3413	NC_015563	A	7	7	1665358	1665364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3434	NC_015563	GCCT	2	8	1678671	1678678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3435	NC_015563	TG	3	6	1678710	1678715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3439	NC_015563	TG	4	8	1681967	1681974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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