MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 5662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015161	CGGA	2	8	339678	339685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_015161	GCC	2	6	339724	339729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015161	CTG	2	6	339750	339755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015161	CCT	2	6	339782	339787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_015161	GTTT	2	8	342522	342529	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015161	CGG	2	6	342541	342546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015161	CCAG	3	12	342571	342582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_015161	CT	3	6	342667	342672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_015161	GCG	2	6	342733	342738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015161	AG	4	8	342923	342930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015161	TGA	2	6	342971	342976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015161	CAC	2	6	342994	342999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015161	TGT	2	6	343075	343080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015161	GAA	2	6	343087	343092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015161	TCG	2	6	343119	343124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015161	AGAT	2	8	343226	343233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015161	T	8	8	343256	343263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015161	CGCTC	2	10	343309	343318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1019	NC_015161	AGC	2	6	343319	343324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015161	TGG	2	6	343386	343391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015161	GCC	2	6	343408	343413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_015161	GTC	2	6	343437	343442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015161	TGC	2	6	343464	343469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015161	AGG	2	6	343485	343490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015161	TCAG	2	8	343515	343522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_015161	GAC	2	6	343531	343536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1028	NC_015161	AAG	2	6	343588	343593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015161	AGC	2	6	343622	343627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015161	GT	4	8	343637	343644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015161	TGC	2	6	343653	343658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015161	AGC	2	6	343670	343675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015161	CGC	2	6	343680	343685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_015161	CGG	2	6	345018	345023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015161	CAG	2	6	345049	345054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015161	CCA	2	6	345072	345077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_015161	CCCG	2	8	345798	345805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1038	NC_015161	GCC	2	6	347736	347741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_015161	CTC	2	6	347782	347787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_015161	TCT	2	6	347792	347797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015161	CCGG	2	8	347799	347806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_015161	AGC	2	6	348976	348981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015161	AGC	2	6	348990	348995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_015161	AGTGG	2	10	349900	349909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015161	CGC	2	6	349938	349943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1047	NC_015161	CTCA	2	8	350086	350093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_015161	CAGCTG	2	12	350184	350195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015161	GCCT	2	8	350243	350250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015161	GCA	2	6	350260	350265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015161	GCGG	2	8	350287	350294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_015161	CTC	2	6	353000	353005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_015161	AG	4	8	353073	353080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1055	NC_015161	TGC	2	6	354391	354396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015161	TCG	2	6	354480	354485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015161	CG	3	6	354492	354497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015161	GTC	2	6	354505	354510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015161	TCG	2	6	354545	354550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015161	T	8	8	354565	354572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015161	CCT	2	6	354579	354584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_015161	CTG	2	6	354814	354819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015161	GGC	2	6	354840	354845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1067	NC_015161	GA	3	6	355019	355024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015161	GCG	2	6	355122	355127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015161	GCT	2	6	355137	355142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015161	GAG	2	6	355196	355201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015161	GCT	2	6	355211	355216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015161	GCA	2	6	355228	355233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1074	NC_015161	GCT	2	6	355259	355264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1077	NC_015161	GTC	2	6	355350	355355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015161	CTGA	2	8	355364	355371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1080	NC_015161	GCA	2	6	355417	355422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015161	GAC	2	6	355444	355449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1085	NC_015161	GAAC	2	8	355573	355580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_015161	A	8	8	355623	355630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015161	ATC	2	6	355650	355655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_015161	TTC	2	6	355794	355799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015161	CA	3	6	355803	355808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_015161	TCG	2	6	355882	355887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015161	TCA	2	6	355910	355915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_015161	CT	4	8	355956	355963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_015161	CGC	2	6	356148	356153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_015161	CAGGT	2	10	356166	356175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_015161	GCG	2	6	356190	356195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015161	GCT	2	6	356203	356208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_015161	GGC	2	6	356854	356859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015161	GCC	2	6	356864	356869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_015161	GATA	2	8	357693	357700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015161	GCT	2	6	359149	359154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015161	G	7	7	359170	359176	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015161	G	7	7	359179	359185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015161	TGC	2	6	360630	360635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015161	TGA	2	6	360718	360723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015161	CTG	2	6	360737	360742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015161	CTGG	2	8	360745	360752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_015161	TGCC	2	8	360774	360781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_015161	TGG	2	6	361657	361662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015161	ACA	2	6	365304	365309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015161	AT	3	6	365319	365324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015161	AGC	2	6	366839	366844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015161	CGG	2	6	367775	367780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015161	TGA	2	6	367793	367798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015161	GTT	2	6	367817	367822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015161	GGC	2	6	368913	368918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015161	AGC	2	6	368929	368934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015161	GCTG	2	8	368968	368975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_015161	G	6	6	368980	368985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015161	GCC	2	6	368995	369000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015161	CTCA	2	8	369001	369008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_015161	G	6	6	369016	369021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015161	GCCC	2	8	369025	369032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1125	NC_015161	C	6	6	369030	369035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1126	NC_015161	CTG	2	6	369683	369688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015161	G	7	7	369688	369694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015161	AGG	2	6	369812	369817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015161	CGGG	2	8	376318	376325	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_015161	CAG	2	6	379079	379084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015161	GGGA	2	8	379088	379095	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015161	CTCC	2	8	379109	379116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_015161	GCT	2	6	379118	379123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015161	CCG	2	6	381850	381855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1267	NC_015161	CGCC	2	8	442323	442330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1268	NC_015161	A	8	8	442351	442358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_015161	T	7	7	489552	489558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_015161	GTG	2	6	492234	492239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_015161	CCGA	2	8	492295	492302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_015161	TGG	2	6	492385	492390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_015161	TCA	2	6	492411	492416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_015161	TTA	2	6	492544	492549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_015161	GCTTTA	2	12	492594	492605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1415	NC_015161	AGG	2	6	492687	492692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_015161	G	6	6	494744	494749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_015161	CCG	2	6	494772	494777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1422	NC_015161	TCTCA	2	10	494791	494800	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1430	NC_015161	GGGCA	2	10	507059	507068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1433	NC_015161	AGGA	2	8	507281	507288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_015161	GC	3	6	509170	509175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1437	NC_015161	TGC	2	6	510034	510039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_015161	ACC	2	6	510250	510255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1439	NC_015161	TGC	2	6	510331	510336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_015161	GTC	2	6	510445	510450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_015161	TCG	2	6	510485	510490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_015161	CCT	2	6	510519	510524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1452	NC_015161	AGGCTA	2	12	511034	511045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1499	NC_015161	TGT	2	6	530141	530146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_015161	GAA	2	6	530153	530158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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