MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 2782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	AGG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013890	AG	3	6	45	50	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013890	CTTG	2	8	102	109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013890	GGGA	2	8	232	239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013890	GTT	3	9	1616	1624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013890	T	6	6	1623	1628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013890	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013890	A	6	6	1762	1767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013890	TTA	4	12	1808	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013890	TAA	2	6	3860	3865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013890	ATTTC	2	10	5800	5809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013890	AT	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013890	A	7	7	5872	5878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013890	TGGC	2	8	5985	5992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013890	AGA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013890	TAA	2	6	8211	8216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013890	CAG	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013890	TA	4	8	11359	11366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013890	CCT	2	6	11371	11376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013890	CTTT	2	8	12318	12325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013890	AGAT	2	8	12328	12335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013890	CCG	2	6	12342	12347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013890	GAA	2	6	12389	12394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013890	AGGG	2	8	12412	12419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013890	TAAA	2	8	12445	12452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013890	AGC	3	9	13871	13879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013890	GGT	2	6	14808	14813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013890	GGA	2	6	14838	14843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013890	AATC	2	8	15559	15566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013890	AGG	2	6	15574	15579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013890	CAG	2	6	16405	16410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013890	CCT	2	6	18225	18230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013890	A	6	6	18294	18299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013890	CAA	2	6	18379	18384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013890	TC	4	8	18446	18453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013890	TAAAA	2	10	18489	18498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013890	GA	3	6	18569	18574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013890	GGCCT	2	10	18590	18599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013890	CTG	2	6	18607	18612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013890	GAA	2	6	18634	18639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013890	ATA	2	6	18664	18669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013890	TCTT	2	8	18708	18715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013890	TGG	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013890	GCC	2	6	18785	18790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013890	ATG	3	9	18900	18908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013890	TAT	2	6	18938	18943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013890	TAG	2	6	18981	18986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013890	AAT	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013890	AT	4	8	19482	19489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013890	T	6	6	19489	19494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013890	AT	3	6	19506	19511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013890	GGGCT	2	10	19873	19882	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013890	GCA	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013890	CAG	3	9	19965	19973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013890	GGGC	2	8	20041	20048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013890	GTC	2	6	20097	20102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013890	CAG	2	6	20127	20132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013890	CAGC	2	8	20156	20163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013890	GAC	2	6	20221	20226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013890	TTTA	2	8	20265	20272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013890	TG	3	6	20279	20284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013890	ATC	2	6	20301	20306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013890	CAG	2	6	20328	20333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013890	T	6	6	20378	20383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013890	CTG	2	6	20404	20409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013890	ACC	2	6	20434	20439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013890	TAAA	2	8	20482	20489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013890	TGG	2	6	20494	20499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013890	GAT	2	6	20568	20573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013890	GCTT	2	8	20626	20633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013890	AT	3	6	20638	20643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013890	AGG	2	6	20695	20700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013890	ATA	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013890	CGG	2	6	21358	21363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013890	TCC	2	6	24262	24267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013890	AT	4	8	24328	24335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013890	GA	3	6	24370	24375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013890	TAAA	2	8	24376	24383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013890	AT	3	6	28999	29004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013890	GT	3	6	29039	29044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013890	GCT	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013890	AAT	2	6	29088	29093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013890	ATG	2	6	29108	29113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013890	GTT	2	6	29114	29119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013890	TATC	2	8	29153	29160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013890	AAAT	2	8	29165	29172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013890	AT	3	6	29171	29176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013890	AT	4	8	29254	29261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013890	GAAA	2	8	29268	29275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013890	AAAT	2	8	29276	29283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013890	AGG	2	6	29300	29305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013890	AT	3	6	31867	31872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013890	CAG	2	6	32004	32009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013890	CTTT	2	8	34487	34494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013890	GTG	2	6	34649	34654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013890	TTC	2	6	34663	34668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013890	GAGG	2	8	34691	34698	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013890	TCGT	2	8	34760	34767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013890	AAAATC	2	12	34795	34806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013890	TGG	2	6	34881	34886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013890	CAG	2	6	34924	34929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013890	CCA	2	6	35025	35030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013890	CTT	2	6	35058	35063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013890	CCT	2	6	35125	35130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013890	ATT	2	6	35160	35165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013890	ATA	2	6	36017	36022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013890	TAT	2	6	36032	36037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013890	TTA	2	6	36546	36551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013890	TAT	2	6	36566	36571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013890	TTA	2	6	36761	36766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013890	TAA	2	6	36778	36783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013890	AT	4	8	36798	36805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013890	TCC	2	6	38644	38649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013890	AGA	2	6	41464	41469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013890	ATT	2	6	41480	41485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013890	TGA	2	6	41499	41504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013890	TATCT	2	10	41525	41534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013890	GGC	2	6	45845	45850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013890	TCT	2	6	45899	45904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013890	ATG	2	6	45908	45913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013890	A	6	6	47088	47093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013890	ATA	2	6	47155	47160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013890	AG	3	6	47182	47187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013890	TAC	2	6	47297	47302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013890	TGG	2	6	47347	47352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013890	ATT	2	6	47549	47554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013890	TAG	2	6	47559	47564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013890	GCGA	2	8	47567	47574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013890	AAG	2	6	47638	47643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013890	TTCT	2	8	47761	47768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013890	CCG	2	6	47804	47809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013890	TGA	2	6	47837	47842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013890	GAA	2	6	47965	47970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013890	CGA	2	6	47976	47981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013890	AAGCGA	2	12	48024	48035	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_013890	GTGAA	2	10	48101	48110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013890	GTT	2	6	48152	48157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013890	GA	3	6	48283	48288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013890	AGC	2	6	48466	48471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013890	GTG	2	6	48508	48513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013890	AAC	2	6	48619	48624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013890	CAG	2	6	48775	48780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013890	TTA	2	6	48782	48787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013890	CAC	2	6	48794	48799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013890	G	6	6	48815	48820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013890	AGG	2	6	48825	48830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013890	TGG	2	6	48921	48926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013890	GA	3	6	48935	48940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013890	GAG	2	6	49237	49242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013890	CGG	2	6	49281	49286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013890	AAC	2	6	49356	49361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013890	TGG	2	6	49531	49536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013890	TGG	2	6	49606	49611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013890	CCT	2	6	49633	49638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_013890	TCG	2	6	49884	49889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_013890	CGT	2	6	49990	49995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013890	GT	3	6	50060	50065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_013890	GT	3	6	50218	50223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013890	TGG	2	6	50379	50384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_013890	CTTT	2	8	50618	50625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_013890	TAA	2	6	50638	50643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013890	A	7	7	50665	50671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013890	TAAAA	2	10	53211	53220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_013890	ATT	2	6	53440	53445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_013890	CCA	2	6	57633	57638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_013890	GGTT	2	8	57775	57782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013890	CTC	2	6	57879	57884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_013890	TGTTT	2	10	57899	57908	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013890	TCA	2	6	57918	57923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_013890	CTA	2	6	61642	61647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_013890	ATT	2	6	77148	77153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_013890	A	7	7	77167	77173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013890	GATT	2	8	77214	77221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013890	CCT	2	6	77714	77719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_013890	ATA	3	9	109320	109328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_013890	TCC	2	6	110476	110481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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288	NC_013890	TAA	2	6	111083	111088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013890	TAT	2	6	111089	111094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_013890	CTG	2	6	113050	113055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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