MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013223	GTT	2	6	527597	527602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013223	GCG	2	6	527666	527671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013223	CCG	2	6	527709	527714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1504	NC_013223	T	6	6	527739	527744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013223	GAG	2	6	527754	527759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013223	GCTC	2	8	527799	527806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_013223	GTT	2	6	527823	527828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013223	GCG	2	6	527892	527897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_013223	CCG	2	6	527935	527940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_013223	GAG	2	6	527979	527984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013223	GCTC	2	8	528024	528031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_013223	GTT	2	6	528048	528053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013223	GCG	2	6	528341	528346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013223	CAA	2	6	528444	528449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013223	GA	3	6	528451	528456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013223	GCC	2	6	529942	529947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_013223	GAGGCT	2	12	530011	530022	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1518	NC_013223	CGGG	2	8	530034	530041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_013223	CGC	2	6	530109	530114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_013223	GAC	3	9	530835	530843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013223	GAT	2	6	530870	530875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013223	CT	3	6	535259	535264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_013223	CCTG	2	8	535276	535283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_013223	AGC	2	6	535346	535351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013223	GGCG	2	8	537340	537347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_013223	AGG	2	6	537378	537383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013223	TGCT	2	8	540942	540949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_013223	GC	3	6	540991	540996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_013223	TAG	2	6	541025	541030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013223	AGC	2	6	541045	541050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013223	GAGG	2	8	542865	542872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013223	CTGC	2	8	545998	546005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_013223	TGGG	2	8	546013	546020	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013223	AGC	2	6	546091	546096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013223	CCT	2	6	546898	546903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_013223	GTC	2	6	546915	546920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_013223	TTG	3	9	546958	546966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013223	TCC	2	6	547361	547366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_013223	AAG	2	6	547853	547858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013223	ATT	2	6	547887	547892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013223	T	6	6	547919	547924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013223	TTC	2	6	549248	549253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013223	A	6	6	549324	549329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013223	GGT	2	6	549353	549358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013223	TGA	2	6	549438	549443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013223	G	6	6	550559	550564	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013223	TG	3	6	550572	550577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013223	A	6	6	550758	550763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013223	CCA	2	6	550879	550884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_013223	TTC	2	6	550890	550895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013223	T	6	6	550919	550924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013223	CT	3	6	550971	550976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_013223	GC	3	6	551556	551561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_013223	CGG	2	6	551564	551569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_013223	CTT	2	6	553881	553886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013223	CAG	2	6	553908	553913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_013223	TCGG	2	8	554022	554029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_013223	TGG	2	6	554126	554131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013223	GCC	2	6	554206	554211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_013223	GTCCA	2	10	554215	554224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1561	NC_013223	CATT	2	8	554232	554239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_013223	AGG	2	6	554253	554258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013223	TTCT	2	8	558073	558080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_013223	GGC	2	6	559395	559400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_013223	CTC	2	6	561419	561424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_013223	A	6	6	563366	563371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013223	GCA	2	6	563438	563443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013223	GTG	2	6	563466	563471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013223	CCT	2	6	563601	563606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_013223	TTTTC	2	10	563674	563683	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_013223	CCG	2	6	563733	563738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_013223	GCG	2	6	563790	563795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_013223	GGT	2	6	563796	563801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013223	CGT	2	6	563807	563812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_013223	GAG	2	6	564067	564072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013223	GAG	2	6	564081	564086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013223	GTC	2	6	566707	566712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_013223	AG	3	6	566761	566766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013223	AGG	2	6	566775	566780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1586	NC_013223	GGCCG	2	10	568322	568331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1587	NC_013223	GTG	2	6	568332	568337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013223	TGC	2	6	568402	568407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013223	GGC	2	6	568408	568413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_013223	GGC	2	6	568419	568424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_013223	T	6	6	568449	568454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013223	GAG	2	6	568455	568460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013223	GCC	2	6	568465	568470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1599	NC_013223	CCGG	2	8	569691	569698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_013223	CG	3	6	569780	569785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_013223	GAC	2	6	571146	571151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_013223	GAA	2	6	572357	572362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013223	T	6	6	574859	574864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013223	GGC	2	6	574903	574908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013223	T	6	6	574953	574958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013223	AG	3	6	575784	575789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013223	GAT	2	6	576498	576503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013223	CCG	2	6	576504	576509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_013223	ATC	2	6	576512	576517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013223	T	6	6	576521	576526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013223	GCT	2	6	576565	576570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013223	CCA	2	6	576581	576586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_013223	GCAG	2	8	576643	576650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_013223	ACC	2	6	576677	576682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_013223	AGA	2	6	576710	576715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013223	AGG	2	6	578260	578265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013223	CGG	2	6	578431	578436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_013223	GGC	3	9	578474	578482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013223	GAC	2	6	578484	578489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013223	AGC	2	6	578503	578508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_013223	GTC	2	6	578529	578534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_013223	GTAT	2	8	578556	578563	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013223	CCT	2	6	579144	579149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_013223	CT	4	8	579159	579166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_013223	CGC	2	6	579200	579205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_013223	TGT	2	6	579218	579223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013223	TGA	2	6	579965	579970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013223	GGT	2	6	580010	580015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013223	CGC	2	6	580084	580089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_013223	GC	3	6	580115	580120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_013223	GA	3	6	580189	580194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013223	ATTC	2	8	581107	581114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_013223	AGC	2	6	581128	581133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_013223	AGTCTG	2	12	581999	582010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1635	NC_013223	CAA	2	6	582069	582074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_013223	CAGCG	2	10	582932	582941	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1651	NC_013223	CATA	2	8	586919	586926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1652	NC_013223	T	6	6	586959	586964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1653	NC_013223	CCGC	2	8	588257	588264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1656	NC_013223	AGCAA	2	10	591364	591373	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1672	NC_013223	CGT	2	6	603115	603120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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