MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_013223	CTG	2	6	2476949	2476954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_013223	CCA	2	6	2477084	2477089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_013223	CACCG	2	10	2477111	2477120	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7005	NC_013223	CCATT	2	10	2477125	2477134	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7006	NC_013223	AAT	2	6	2477183	2477188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013223	GAA	2	6	2477201	2477206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013223	ACG	2	6	2477214	2477219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_013223	T	6	6	2477235	2477240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_013223	GGC	2	6	2477277	2477282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_013223	TCGG	2	8	2477405	2477412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7012	NC_013223	A	7	7	2477440	2477446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_013223	T	6	6	2477466	2477471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_013223	A	6	6	2477472	2477477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_013223	GGAAT	2	10	2477554	2477563	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_013223	GT	3	6	2477567	2477572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_013223	AT	3	6	2477608	2477613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_013223	GAA	2	6	2477627	2477632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_013223	TGC	2	6	2477679	2477684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_013223	G	6	6	2477763	2477768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_013223	ACA	2	6	2477837	2477842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_013223	CTC	2	6	2477890	2477895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_013223	ACG	2	6	2477939	2477944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7026	NC_013223	TGTC	2	8	2478175	2478182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7029	NC_013223	CTC	2	6	2478376	2478381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_013223	GTA	2	6	2478454	2478459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7032	NC_013223	CGT	2	6	2478720	2478725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_013223	TC	3	6	2478880	2478885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7034	NC_013223	C	6	6	2479105	2479110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7035	NC_013223	GAA	2	6	2479359	2479364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013223	CTTT	2	8	2479444	2479451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_013223	GCT	2	6	2479460	2479465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7041	NC_013223	TGG	2	6	2479642	2479647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_013223	AT	3	6	2479706	2479711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_013223	GAT	2	6	2480111	2480116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7048	NC_013223	TCT	2	6	2480350	2480355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7054	NC_013223	AGGC	2	8	2480722	2480729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7055	NC_013223	TGG	2	6	2480762	2480767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7060	NC_013223	GT	3	6	2481049	2481054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_013223	GTA	2	6	2481211	2481216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_013223	GT	3	6	2481218	2481223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_013223	ATG	2	6	2481243	2481248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_013223	CGT	2	6	2481255	2481260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_013223	TCC	2	6	2481269	2481274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7071	NC_013223	TCC	2	6	2481735	2481740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7072	NC_013223	GCC	2	6	2481861	2481866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_013223	CG	3	6	2481869	2481874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_013223	GCT	2	6	2481925	2481930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7077	NC_013223	CTG	2	6	2482094	2482099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7081	NC_013223	TG	3	6	2482271	2482276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7085	NC_013223	GCCC	2	8	2482620	2482627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7086	NC_013223	GCG	2	6	2482635	2482640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7092	NC_013223	CG	3	6	2482819	2482824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7093	NC_013223	AGA	2	6	2482825	2482830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_013223	A	6	6	2485216	2485221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_013223	CAGC	2	8	2485231	2485238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_013223	CCT	2	6	2485511	2485516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7101	NC_013223	A	6	6	2485852	2485857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_013223	TTA	2	6	2485868	2485873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7104	NC_013223	CCG	2	6	2485986	2485991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_013223	CCCG	2	8	2487527	2487534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7106	NC_013223	CGG	2	6	2487575	2487580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_013223	AT	3	6	2487583	2487588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_013223	GCT	2	6	2487594	2487599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7110	NC_013223	CTT	3	9	2488884	2488892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_013223	GTT	2	6	2491619	2491624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_013223	TCC	2	6	2494394	2494399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_013223	AAC	2	6	2494438	2494443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_013223	TCC	2	6	2494736	2494741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_013223	GGC	2	6	2497307	2497312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_013223	GCC	2	6	2497318	2497323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_013223	A	7	7	2497347	2497353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_013223	GAAA	2	8	2497749	2497756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_013223	C	6	6	2499198	2499203	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7120	NC_013223	CCGCC	2	10	2499221	2499230	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7121	NC_013223	CAG	2	6	2499239	2499244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_013223	CAAAA	2	10	2501200	2501209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7124	NC_013223	A	6	6	2501206	2501211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7126	NC_013223	CCCG	2	8	2501279	2501286	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7127	NC_013223	C	6	6	2506687	2506692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7128	NC_013223	T	6	6	2506695	2506700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_013223	C	6	6	2506729	2506734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7130	NC_013223	GTT	2	6	2506743	2506748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7132	NC_013223	CGG	2	6	2506779	2506784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7133	NC_013223	CCT	2	6	2507256	2507261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7134	NC_013223	TTA	2	6	2507272	2507277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7142	NC_013223	CCG	2	6	2511283	2511288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7259	NC_013223	GGGT	2	8	2582915	2582922	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7260	NC_013223	TTATCG	2	12	2583826	2583837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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7398	NC_013223	CGTA	2	8	2646844	2646851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7399	NC_013223	CGTA	2	8	2646854	2646861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7400	NC_013223	TGC	2	6	2646885	2646890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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