MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013223	TCG	2	6	2219214	2219219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_013223	GTCT	2	8	2221333	2221340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6503	NC_013223	CAGG	2	8	2221369	2221376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_013223	TGC	2	6	2221385	2221390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_013223	CGC	2	6	2221396	2221401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_013223	ACC	2	6	2221402	2221407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6507	NC_013223	C	6	6	2221421	2221426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6508	NC_013223	CGAA	2	8	2221487	2221494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6509	NC_013223	T	8	8	2221510	2221517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_013223	CTGCGC	2	12	2221567	2221578	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_013223	TGAGG	2	10	2221650	2221659	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_013223	CCGC	2	8	2221680	2221687	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6513	NC_013223	CGC	2	6	2221700	2221705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_013223	AGCAA	2	10	2224112	2224121	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6515	NC_013223	CCGA	2	8	2224257	2224264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_013223	AGG	2	6	2224308	2224313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_013223	GGC	2	6	2225072	2225077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_013223	TGG	2	6	2225178	2225183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_013223	CGGT	2	8	2225190	2225197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6520	NC_013223	T	8	8	2226941	2226948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_013223	CGTA	2	8	2228365	2228372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_013223	GAGC	2	8	2233011	2233018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6523	NC_013223	TTC	2	6	2233075	2233080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_013223	GTT	2	6	2233109	2233114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_013223	ACC	2	6	2233686	2233691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_013223	TCT	2	6	2235099	2235104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_013223	CAA	2	6	2235199	2235204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_013223	CAC	2	6	2235373	2235378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6529	NC_013223	G	6	6	2235387	2235392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_013223	CCT	2	6	2235423	2235428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6531	NC_013223	T	6	6	2235448	2235453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_013223	CTGC	2	8	2235482	2235489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_013223	TCCC	2	8	2235504	2235511	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6534	NC_013223	AC	3	6	2235539	2235544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_013223	GGGA	2	8	2235557	2235564	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_013223	CTT	2	6	2235570	2235575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_013223	CGA	2	6	2235578	2235583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_013223	CCG	2	6	2235610	2235615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_013223	GCG	2	6	2236837	2236842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_013223	CCCCG	2	10	2236843	2236852	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6541	NC_013223	CCG	2	6	2237932	2237937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_013223	TCCA	2	8	2239165	2239172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_013223	GGC	2	6	2240383	2240388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_013223	T	6	6	2240429	2240434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_013223	CGC	3	9	2240435	2240443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_013223	C	6	6	2240477	2240482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6547	NC_013223	C	6	6	2240579	2240584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6548	NC_013223	AGCG	2	8	2240650	2240657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6549	NC_013223	AGG	2	6	2241220	2241225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_013223	CA	3	6	2244247	2244252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_013223	CCG	2	6	2244256	2244261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_013223	ATTC	2	8	2244286	2244293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6553	NC_013223	GAG	2	6	2244312	2244317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_013223	TCCG	2	8	2245967	2245974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_013223	CAGG	2	8	2245979	2245986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6556	NC_013223	GACC	2	8	2246101	2246108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_013223	A	8	8	2246231	2246238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_013223	TGAG	2	8	2246288	2246295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_013223	CCT	2	6	2246972	2246977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_013223	GCCA	2	8	2251884	2251891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_013223	GCC	2	6	2251938	2251943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_013223	GCC	2	6	2251970	2251975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_013223	TGTCC	2	10	2251998	2252007	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6564	NC_013223	CAG	2	6	2252044	2252049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_013223	A	7	7	2252055	2252061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_013223	CTC	2	6	2254112	2254117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_013223	CCT	2	6	2254668	2254673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6568	NC_013223	GT	3	6	2254764	2254769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_013223	GCAA	2	8	2254821	2254828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_013223	GCC	2	6	2254858	2254863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_013223	TTG	2	6	2254872	2254877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_013223	CA	3	6	2254893	2254898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_013223	CGG	2	6	2254924	2254929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_013223	GCC	2	6	2254943	2254948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_013223	CGA	2	6	2256294	2256299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6579	NC_013223	CTCCC	2	10	2256648	2256657	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6580	NC_013223	G	15	15	2256679	2256693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_013223	AGG	2	6	2256698	2256703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6584	NC_013223	GCC	2	6	2259717	2259722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_013223	A	8	8	2259743	2259750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_013223	TGGC	2	8	2259861	2259868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6587	NC_013223	CA	3	6	2259915	2259920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6589	NC_013223	GAA	2	6	2259966	2259971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_013223	GGC	2	6	2259974	2259979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_013223	GCA	2	6	2260003	2260008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6593	NC_013223	TGG	2	6	2260835	2260840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_013223	AGG	2	6	2261035	2261040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_013223	GCAA	2	8	2263050	2263057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6597	NC_013223	CTTGG	2	10	2270239	2270248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6598	NC_013223	GCC	2	6	2270254	2270259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_013223	CA	3	6	2271596	2271601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6601	NC_013223	CCA	2	6	2271810	2271815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_013223	GAC	2	6	2273183	2273188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6604	NC_013223	TGC	2	6	2273349	2273354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6607	NC_013223	GCCTT	2	10	2274108	2274117	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6608	NC_013223	TGG	2	6	2274173	2274178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6612	NC_013223	ACG	2	6	2275559	2275564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_013223	GA	3	6	2275890	2275895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_013223	GGT	2	6	2275931	2275936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_013223	TGA	2	6	2277751	2277756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_013223	CCG	2	6	2278715	2278720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_013223	T	7	7	2278738	2278744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6619	NC_013223	CGAC	2	8	2281104	2281111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6620	NC_013223	T	6	6	2281151	2281156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_013223	GAC	2	6	2281182	2281187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_013223	GCC	2	6	2281208	2281213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_013223	CGC	2	6	2281219	2281224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_013223	CTG	2	6	2281236	2281241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_013223	ACA	2	6	2281250	2281255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_013223	CTCATC	2	12	2281640	2281651	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_013223	CCCAT	2	10	2281667	2281676	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6628	NC_013223	CCCT	2	8	2281692	2281699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6629	NC_013223	G	6	6	2282576	2282581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_013223	ACG	2	6	2282596	2282601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6632	NC_013223	GCA	2	6	2282664	2282669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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