MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013223	GA	3	6	2094578	2094583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_013223	C	6	6	2094628	2094633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6003	NC_013223	GGA	3	9	2094729	2094737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_013223	AAAGC	2	10	2094788	2094797	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_013223	TCAG	2	8	2094828	2094835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_013223	CA	3	6	2095169	2095174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_013223	CGT	2	6	2095257	2095262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_013223	TGC	2	6	2095277	2095282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_013223	GA	3	6	2095298	2095303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_013223	GTC	2	6	2095385	2095390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_013223	GAG	2	6	2095396	2095401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_013223	CGC	2	6	2096632	2096637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_013223	TCCC	2	8	2096642	2096649	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6014	NC_013223	GCCAA	2	10	2096661	2096670	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6015	NC_013223	GGA	2	6	2102128	2102133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_013223	ATCGGG	2	12	2102165	2102176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6017	NC_013223	GT	3	6	2102189	2102194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_013223	G	6	6	2102250	2102255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_013223	GGCC	2	8	2102280	2102287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_013223	TCC	2	6	2102313	2102318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_013223	GGAA	2	8	2102338	2102345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_013223	CAA	2	6	2102383	2102388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_013223	GGGA	2	8	2102877	2102884	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_013223	GTTTC	2	10	2102979	2102988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6025	NC_013223	GAAC	2	8	2103005	2103012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_013223	GTTT	2	8	2103032	2103039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_013223	ACT	2	6	2103053	2103058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_013223	A	6	6	2103545	2103550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_013223	CGC	2	6	2103560	2103565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_013223	ACTG	2	8	2103567	2103574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_013223	CGCAA	2	10	2103618	2103627	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6032	NC_013223	CAA	2	6	2103667	2103672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_013223	CGG	2	6	2103685	2103690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_013223	CCTT	2	8	2103705	2103712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_013223	GCC	2	6	2103756	2103761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_013223	CAC	2	6	2103813	2103818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_013223	A	7	7	2106630	2106636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_013223	ACA	2	6	2106645	2106650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_013223	TCC	2	6	2106657	2106662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_013223	GCA	2	6	2106755	2106760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_013223	GCC	2	6	2106772	2106777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_013223	CAATA	2	10	2106796	2106805	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6043	NC_013223	A	6	6	2106821	2106826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_013223	CTT	2	6	2109789	2109794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_013223	GCC	2	6	2109806	2109811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_013223	AT	3	6	2109881	2109886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_013223	CGC	2	6	2109916	2109921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_013223	AGG	2	6	2110065	2110070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_013223	GACGG	2	10	2110474	2110483	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_013223	GAT	2	6	2110514	2110519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_013223	AGG	2	6	2110537	2110542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_013223	GGT	2	6	2110570	2110575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_013223	AGC	2	6	2111306	2111311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_013223	ACA	2	6	2111372	2111377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_013223	GC	3	6	2111406	2111411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_013223	TGC	2	6	2111434	2111439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_013223	TCT	2	6	2111505	2111510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_013223	CAA	2	6	2111605	2111610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_013223	CA	3	6	2111711	2111716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_013223	CAA	2	6	2111769	2111774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_013223	AG	3	6	2111851	2111856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_013223	CCT	2	6	2111983	2111988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_013223	AGC	2	6	2112015	2112020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_013223	ACC	2	6	2112047	2112052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_013223	GCT	2	6	2112083	2112088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_013223	A	6	6	2112195	2112200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_013223	TTCTCT	2	12	2112216	2112227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_013223	TCT	2	6	2112252	2112257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_013223	AT	3	6	2112350	2112355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_013223	GTA	2	6	2112457	2112462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_013223	ACA	2	6	2112485	2112490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_013223	CCG	2	6	2112511	2112516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_013223	A	6	6	2112551	2112556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_013223	G	6	6	2114943	2114948	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_013223	GCCT	2	8	2115015	2115022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_013223	AGG	2	6	2115109	2115114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_013223	CA	3	6	2115147	2115152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_013223	GAG	2	6	2115185	2115190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_013223	GGC	2	6	2115702	2115707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_013223	ATC	2	6	2115793	2115798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_013223	CCT	2	6	2115833	2115838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_013223	TTG	2	6	2115841	2115846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_013223	CGG	2	6	2115850	2115855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_013223	CGT	2	6	2115938	2115943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_013223	TGCT	2	8	2116028	2116035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_013223	AGC	2	6	2116045	2116050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_013223	TCC	2	6	2116067	2116072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_013223	TC	3	6	2116085	2116090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_013223	CGG	2	6	2116093	2116098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_013223	CCT	2	6	2116847	2116852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_013223	CA	3	6	2117741	2117746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_013223	ACC	2	6	2117748	2117753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_013223	GAA	2	6	2119421	2119426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_013223	A	6	6	2119429	2119434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_013223	TCGGCT	2	12	2119609	2119620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_013223	CCG	2	6	2119621	2119626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_013223	AAG	2	6	2119649	2119654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_013223	TCC	2	6	2121580	2121585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_013223	CAC	2	6	2121613	2121618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_013223	TCAG	2	8	2121980	2121987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_013223	CCTG	2	8	2123134	2123141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_013223	TC	3	6	2123150	2123155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_013223	CGGG	2	8	2123182	2123189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_013223	CAA	2	6	2123227	2123232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_013223	TCA	2	6	2123261	2123266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_013223	GCT	2	6	2123275	2123280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_013223	ACC	2	6	2123384	2123389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_013223	TA	3	6	2123402	2123407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_013223	GTG	2	6	2123435	2123440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_013223	GGT	2	6	2123457	2123462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_013223	CGTT	2	8	2123498	2123505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_013223	GGA	2	6	2123516	2123521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_013223	CTG	2	6	2124460	2124465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_013223	CGC	2	6	2124477	2124482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_013223	T	6	6	2124511	2124516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_013223	TTG	2	6	2124527	2124532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_013223	CCT	2	6	2124570	2124575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_013223	A	7	7	2126729	2126735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_013223	G	6	6	2126758	2126763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_013223	CTGC	2	8	2126865	2126872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_013223	CGCA	2	8	2126878	2126885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_013223	GGC	2	6	2126944	2126949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_013223	TGCG	2	8	2127895	2127902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_013223	CTGC	2	8	2127937	2127944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6125	NC_013223	CGCA	2	8	2127950	2127957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_013223	CGC	2	6	2129284	2129289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_013223	T	6	6	2129662	2129667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_013223	AAC	2	6	2129671	2129676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_013223	ACCA	2	8	2129725	2129732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_013223	AT	3	6	2129803	2129808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_013223	ACG	3	9	2132442	2132450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_013223	GTT	2	6	2132456	2132461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6134	NC_013223	CTG	2	6	2132538	2132543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6137	NC_013223	T	7	7	2132752	2132758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_013223	T	6	6	2132762	2132767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6167	NC_013223	GAA	2	6	2139540	2139545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6248	NC_013223	CTCTTA	2	12	2154642	2154653	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6250	NC_013223	CCCA	2	8	2155004	2155011	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6251	NC_013223	GCA	2	6	2155022	2155027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6253	NC_013223	GGC	2	6	2155045	2155050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_013223	T	7	7	2155051	2155057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_013223	TGA	2	6	2155104	2155109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_013223	ATCGGG	2	12	2155150	2155161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6257	NC_013223	CGT	2	6	2155197	2155202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_013223	CCGATA	2	12	2155293	2155304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_013223	TTC	2	6	2155377	2155382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6260	NC_013223	TTC	2	6	2155393	2155398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6261	NC_013223	TAA	2	6	2155415	2155420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_013223	CGG	2	6	2155477	2155482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6263	NC_013223	AGCCGA	2	12	2155483	2155494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6264	NC_013223	GA	3	6	2155497	2155502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6265	NC_013223	CCCGAT	3	18	2155529	2155546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6266	NC_013223	AAGA	2	8	2155700	2155707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6267	NC_013223	CAG	2	6	2155720	2155725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6268	NC_013223	TCC	2	6	2155829	2155834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6269	NC_013223	GTCACA	2	12	2155858	2155869	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6270	NC_013223	TCAT	2	8	2155929	2155936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6272	NC_013223	GCC	2	6	2155986	2155991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6273	NC_013223	ACTAA	2	10	2156017	2156026	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6275	NC_013223	TACT	2	8	2157388	2157395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6280	NC_013223	TAA	2	6	2157521	2157526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6281	NC_013223	GAA	2	6	2157541	2157546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6283	NC_013223	CTTC	2	8	2157705	2157712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6284	NC_013223	GCCT	2	8	2157730	2157737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6285	NC_013223	CCCT	2	8	2157854	2157861	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6289	NC_013223	A	6	6	2159699	2159704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6293	NC_013223	TAT	2	6	2159899	2159904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6294	NC_013223	CT	3	6	2159973	2159978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6295	NC_013223	TTC	2	6	2160139	2160144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6296	NC_013223	AAC	2	6	2160194	2160199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6297	NC_013223	CGATCC	2	12	2160281	2160292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6299	NC_013223	CAA	2	6	2160358	2160363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6304	NC_013223	TTC	2	6	2160680	2160685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6310	NC_013223	CGCTT	2	10	2164087	2164096	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6312	NC_013223	CCAA	2	8	2164244	2164251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6372	NC_013223	T	6	6	2172298	2172303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6375	NC_013223	TTCAGA	2	12	2172412	2172423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6376	NC_013223	AT	3	6	2172425	2172430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6377	NC_013223	CAA	2	6	2172434	2172439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6378	NC_013223	GGGA	2	8	2173135	2173142	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6379	NC_013223	CTGGC	2	10	2173176	2173185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6380	NC_013223	TCGATT	2	12	2173446	2173457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6381	NC_013223	CAAC	2	8	2174284	2174291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6382	NC_013223	GATTTG	2	12	2174599	2174610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6383	NC_013223	T	6	6	2174625	2174630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6384	NC_013223	GCT	3	9	2174747	2174755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6386	NC_013223	TGT	2	6	2174781	2174786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6387	NC_013223	TTC	2	6	2174795	2174800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6389	NC_013223	TTC	2	6	2174859	2174864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6391	NC_013223	GCTAC	2	10	2178450	2178459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6392	NC_013223	GAA	2	6	2178478	2178483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6490	NC_013223	CCG	2	6	2215656	2215661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6500	NC_013223	A	8	8	2219204	2219211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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