MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013223	CAT	2	6	1627677	1627682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_013223	CTGC	2	8	1631277	1631284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_013223	CAGG	2	8	1631316	1631323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_013223	ACA	2	6	1631365	1631370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013223	CGC	2	6	1631378	1631383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_013223	GGC	2	6	1631391	1631396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_013223	TTG	2	6	1631404	1631409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_013223	A	6	6	1631417	1631422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_013223	TCCC	2	8	1632475	1632482	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_013223	CCT	3	9	1633499	1633507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_013223	GAC	2	6	1633535	1633540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_013223	CTC	2	6	1633562	1633567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_013223	CCG	2	6	1633629	1633634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_013223	GCG	2	6	1633672	1633677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_013223	GTG	2	6	1636039	1636044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013223	CGT	2	6	1636085	1636090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_013223	GCC	2	6	1637465	1637470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_013223	T	7	7	1637479	1637485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_013223	GA	3	6	1637497	1637502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013223	TGTT	2	8	1639673	1639680	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013223	AGG	2	6	1639697	1639702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_013223	TCGT	2	8	1640322	1640329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_013223	CTT	2	6	1640367	1640372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_013223	CGC	2	6	1640655	1640660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_013223	A	9	9	1640674	1640682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013223	CTTTT	2	10	1640886	1640895	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4527	NC_013223	CCA	3	9	1640971	1640979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_013223	GA	3	6	1641003	1641008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_013223	GAG	2	6	1641023	1641028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013223	A	7	7	1642502	1642508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013223	GCG	2	6	1642559	1642564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_013223	TCC	2	6	1642785	1642790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_013223	TGA	2	6	1642847	1642852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013223	GGT	2	6	1642918	1642923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013223	T	7	7	1642935	1642941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013223	TTCCTG	2	12	1642974	1642985	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_013223	CAGG	2	8	1643550	1643557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_013223	GGC	2	6	1644902	1644907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_013223	CA	3	6	1644911	1644916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_013223	GCA	2	6	1644987	1644992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_013223	CCG	2	6	1645002	1645007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_013223	GTT	2	6	1646065	1646070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013223	GCG	2	6	1646142	1646147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_013223	CGA	3	9	1646173	1646181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_013223	GC	3	6	1646995	1647000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_013223	GCT	2	6	1647028	1647033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_013223	GCC	2	6	1647115	1647120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_013223	CGG	2	6	1647135	1647140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_013223	CTG	2	6	1647142	1647147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_013223	CTGC	2	8	1647152	1647159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_013223	AC	3	6	1647182	1647187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_013223	GAG	2	6	1647191	1647196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_013223	CGC	2	6	1647504	1647509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_013223	ACGC	2	8	1647546	1647553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_013223	ATC	2	6	1651852	1651857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_013223	GGACG	2	10	1652566	1652575	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4557	NC_013223	TTG	2	6	1652582	1652587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_013223	C	7	7	1653861	1653867	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4559	NC_013223	CAA	2	6	1653907	1653912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_013223	GCA	2	6	1653969	1653974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_013223	ACTG	2	8	1658078	1658085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_013223	TCT	2	6	1658136	1658141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_013223	CA	3	6	1658341	1658346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_013223	ATA	2	6	1658413	1658418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013223	CCG	2	6	1658544	1658549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_013223	GCC	2	6	1659563	1659568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_013223	GCATC	2	10	1659574	1659583	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4568	NC_013223	TC	3	6	1659582	1659587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_013223	GCAG	2	8	1660352	1660359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_013223	CCG	2	6	1660390	1660395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_013223	TC	3	6	1660401	1660406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_013223	G	6	6	1660440	1660445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013223	T	7	7	1660451	1660457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_013223	TGA	2	6	1660483	1660488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_013223	GCC	2	6	1660562	1660567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_013223	CGAC	2	8	1660572	1660579	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_013223	GCC	2	6	1663141	1663146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_013223	GAAA	2	8	1663148	1663155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_013223	GGC	2	6	1663161	1663166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_013223	GGT	2	6	1663255	1663260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_013223	CTGC	2	8	1663337	1663344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_013223	G	6	6	1664195	1664200	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_013223	A	7	7	1664376	1664382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_013223	ACC	2	6	1664394	1664399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_013223	CTT	2	6	1664403	1664408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_013223	C	6	6	1664453	1664458	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4587	NC_013223	TGGG	2	8	1664474	1664481	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013223	CTC	2	6	1664529	1664534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_013223	CGGT	2	8	1664657	1664664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_013223	GCA	2	6	1665143	1665148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_013223	CCT	2	6	1665149	1665154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_013223	C	6	6	1665188	1665193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4593	NC_013223	CGTA	2	8	1665247	1665254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_013223	CAC	2	6	1665309	1665314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_013223	TCT	2	6	1668537	1668542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_013223	GTATT	2	10	1668563	1668572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013223	GCC	3	9	1668582	1668590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_013223	A	6	6	1668597	1668602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013223	AGC	2	6	1668681	1668686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_013223	CGG	2	6	1668771	1668776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_013223	G	6	6	1668775	1668780	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013223	GAA	2	6	1668813	1668818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013223	TC	3	6	1668829	1668834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_013223	GCCACC	2	12	1668849	1668860	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_013223	GAG	2	6	1668927	1668932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_013223	AAC	2	6	1669408	1669413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013223	C	6	6	1669415	1669420	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4608	NC_013223	GAA	2	6	1671114	1671119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013223	AGA	2	6	1672161	1672166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013223	T	6	6	1672202	1672207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_013223	CCT	2	6	1674705	1674710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_013223	A	8	8	1674805	1674812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_013223	TTG	2	6	1675091	1675096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013223	CCT	2	6	1675127	1675132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_013223	CCTGC	2	10	1675580	1675589	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4616	NC_013223	GTC	2	6	1675692	1675697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_013223	TTG	2	6	1676271	1676276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013223	A	6	6	1676782	1676787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013223	A	8	8	1676893	1676900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013223	C	6	6	1676911	1676916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4621	NC_013223	TGG	2	6	1678151	1678156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013223	CTC	2	6	1678172	1678177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_013223	GAC	2	6	1678231	1678236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_013223	CGGT	2	8	1678237	1678244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_013223	AGG	2	6	1679703	1679708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013223	TC	3	6	1680893	1680898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_013223	TCTTT	2	10	1681772	1681781	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4628	NC_013223	CA	3	6	1681862	1681867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_013223	T	8	8	1681950	1681957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_013223	C	7	7	1682020	1682026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4631	NC_013223	AACA	2	8	1682031	1682038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4632	NC_013223	GGA	2	6	1682562	1682567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_013223	CGTA	2	8	1682675	1682682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4634	NC_013223	CGTA	2	8	1682685	1682692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4635	NC_013223	TCA	2	6	1682775	1682780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4638	NC_013223	CTG	3	9	1684710	1684718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4673	NC_013223	GGCA	2	8	1698071	1698078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4674	NC_013223	CGAG	2	8	1698097	1698104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4675	NC_013223	GT	3	6	1698188	1698193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4763	NC_013223	A	7	7	1721687	1721693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4764	NC_013223	GCA	2	6	1721719	1721724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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