MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012797	CACGG	2	10	2	11	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012797	CA	3	6	20	25	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012797	GCA	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012797	TTG	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012797	ATT	2	6	2327	2332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012797	AAGTA	2	10	2334	2343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012797	GTC	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012797	GA	3	6	4387	4392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012797	TCT	2	6	4558	4563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012797	CTT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012797	AGG	2	6	5908	5913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012797	TAT	2	6	6626	6631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012797	AAT	2	6	6645	6650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012797	CGCT	2	8	10312	10319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012797	G	6	6	10331	10336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012797	GGT	2	6	10348	10353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012797	GTT	2	6	10387	10392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012797	GCC	2	6	10446	10451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012797	GCCA	2	8	10488	10495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012797	GGC	2	6	10501	10506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012797	T	6	6	11092	11097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012797	AAC	2	6	11098	11103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012797	TGAAC	2	10	11126	11135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012797	AT	3	6	11247	11252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012797	CGA	2	6	11288	11293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012797	GGT	2	6	11317	11322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012797	CAAG	2	8	14274	14281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012797	TCA	2	6	16917	16922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012797	CTT	2	6	16988	16993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012797	CT	3	6	17159	17164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012797	TCT	2	6	17220	17225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012797	ATG	2	6	17710	17715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012797	CTT	2	6	18022	18027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012797	CGC	2	6	18029	18034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012797	AGG	2	6	18063	18068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012797	AAT	3	9	18799	18807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012797	GA	3	6	18808	18813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012797	TCA	2	6	20480	20485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012797	TCT	3	9	20498	20506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012797	GAA	2	6	21316	21321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012797	TGC	2	6	21416	21421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012797	ACG	2	6	21434	21439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012797	CGGCA	2	10	21442	21451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012797	CG	3	6	21517	21522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012797	CACGC	2	10	21555	21564	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_012797	CTTG	2	8	21645	21652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012797	AAT	2	6	21657	21662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012797	T	8	8	22454	22461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012797	ACG	2	6	23287	23292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012797	AC	3	6	31646	31651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012797	GC	3	6	33330	33335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012797	GCC	2	6	35419	35424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012797	GCC	2	6	35455	35460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012797	CGC	2	6	37764	37769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012797	TGC	2	6	39724	39729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012797	GAC	2	6	39800	39805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012797	CAG	2	6	40041	40046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012797	AGGG	2	8	40067	40074	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012797	CCT	2	6	40109	40114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012797	CAA	2	6	40162	40167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012797	A	6	6	40224	40229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012797	TAT	2	6	40997	41002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012797	ATA	2	6	41017	41022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012797	TG	3	6	42208	42213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012797	TTTTA	2	10	42262	42271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012797	TCC	2	6	42505	42510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012797	GTC	2	6	43333	43338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012797	ACA	2	6	43354	43359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012797	CCA	2	6	43410	43415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012797	CAC	2	6	43447	43452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012797	GCC	2	6	44173	44178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012797	GCA	2	6	44214	44219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012797	ACC	2	6	44237	44242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012797	CCTGT	2	10	45531	45540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_012797	ACG	2	6	45571	45576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012797	CAG	2	6	45666	45671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012797	CAG	2	6	45693	45698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012797	CAG	2	6	45730	45735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012797	CCG	2	6	45736	45741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012797	GGC	2	6	45840	45845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012797	CAT	2	6	45885	45890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012797	TTC	2	6	45911	45916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012797	CGC	3	9	46368	46376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012797	CAG	2	6	46466	46471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012797	A	6	6	46513	46518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012797	GTCG	2	8	46534	46541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012797	CTC	2	6	46595	46600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_012797	GAGGGG	2	12	46605	46616	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012797	G	7	7	46613	46619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012797	TAG	2	6	46961	46966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012797	ATA	2	6	46980	46985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012797	TTC	2	6	46988	46993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012797	AGCG	2	8	47001	47008	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012797	A	6	6	47054	47059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012797	AGGTA	2	10	47095	47104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012797	CG	3	6	47158	47163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012797	T	6	6	47199	47204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012797	T	6	6	50893	50898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012797	GCA	2	6	52501	52506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012797	CG	3	6	52553	52558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012797	CTGG	2	8	52596	52603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012797	GTCC	2	8	52639	52646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012797	G	6	6	52722	52727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012797	CCCGG	2	10	57524	57533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_012797	CCG	2	6	57571	57576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012797	CCG	2	6	57584	57589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_012797	CGC	2	6	57604	57609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012797	GCC	2	6	57673	57678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012797	GTG	2	6	57712	57717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012797	GCC	2	6	57736	57741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012797	ATC	2	6	58507	58512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012797	GCCG	2	8	58529	58536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012797	GGCC	2	8	58546	58553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012797	CAGC	2	8	58565	58572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012797	ACA	2	6	58654	58659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012797	A	8	8	58668	58675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.