MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1

Total Repeats: 16108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012796	CGG	2	6	5213875	5213880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_012796	C	6	6	5213903	5213908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16003	NC_012796	GAA	2	6	5213913	5213918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_012796	G	9	9	5213921	5213929	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_012796	CGC	2	6	5213936	5213941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16006	NC_012796	GCTT	2	8	5213951	5213958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16007	NC_012796	GCC	2	6	5214085	5214090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16008	NC_012796	AGG	2	6	5214925	5214930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_012796	CTC	2	6	5214951	5214956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16010	NC_012796	G	6	6	5214960	5214965	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_012796	ATC	2	6	5214966	5214971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_012796	C	6	6	5214971	5214976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16013	NC_012796	AGG	2	6	5216651	5216656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_012796	CGC	2	6	5217620	5217625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16015	NC_012796	TCG	2	6	5217627	5217632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_012796	CAGC	2	8	5217634	5217641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_012796	GTC	2	6	5217647	5217652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_012796	GC	3	6	5217664	5217669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16019	NC_012796	TCG	2	6	5217700	5217705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_012796	TTC	2	6	5217738	5217743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_012796	CCTCC	2	10	5217749	5217758	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16022	NC_012796	CGC	2	6	5217764	5217769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16023	NC_012796	ACC	2	6	5217845	5217850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_012796	CCG	2	6	5217860	5217865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16025	NC_012796	ACG	2	6	5217871	5217876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_012796	GCC	2	6	5218002	5218007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16027	NC_012796	ATTTT	2	10	5218018	5218027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_012796	A	6	6	5218059	5218064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_012796	C	6	6	5218065	5218070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16030	NC_012796	ATT	2	6	5218085	5218090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_012796	GGC	2	6	5220857	5220862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_012796	G	6	6	5223209	5223214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_012796	TGAA	2	8	5223242	5223249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_012796	GCC	2	6	5223260	5223265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_012796	T	6	6	5223283	5223288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_012796	AT	3	6	5224128	5224133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_012796	TTA	2	6	5224165	5224170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_012796	CTGT	2	8	5224631	5224638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16039	NC_012796	ATT	2	6	5225031	5225036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_012796	C	7	7	5225353	5225359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16041	NC_012796	CTC	2	6	5225411	5225416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_012796	A	6	6	5226082	5226087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_012796	CGC	2	6	5226095	5226100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_012796	CCG	2	6	5228246	5228251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16045	NC_012796	GCC	2	6	5228267	5228272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_012796	CGG	2	6	5228283	5228288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_012796	CGTTT	2	10	5228291	5228300	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16048	NC_012796	GCC	2	6	5229353	5229358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16049	NC_012796	CGG	2	6	5229369	5229374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_012796	CGC	2	6	5230216	5230221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16051	NC_012796	GCG	2	6	5230250	5230255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_012796	A	6	6	5232413	5232418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_012796	TAT	2	6	5232433	5232438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_012796	GCCA	2	8	5232442	5232449	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16055	NC_012796	CGGC	2	8	5232469	5232476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16056	NC_012796	TTTGC	2	10	5232515	5232524	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16057	NC_012796	T	6	6	5232576	5232581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_012796	GAA	2	6	5232608	5232613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_012796	CGAA	2	8	5232635	5232642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16060	NC_012796	TCG	2	6	5232651	5232656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_012796	G	6	6	5232696	5232701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_012796	GCC	2	6	5232723	5232728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16063	NC_012796	TCT	2	6	5232736	5232741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_012796	AGCC	2	8	5235027	5235034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16065	NC_012796	GCAAG	2	10	5235042	5235051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16066	NC_012796	TAA	2	6	5235110	5235115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_012796	CGA	2	6	5235126	5235131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_012796	GGAG	2	8	5236792	5236799	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_012796	CGC	2	6	5237403	5237408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16070	NC_012796	GCC	2	6	5237409	5237414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16071	NC_012796	GA	3	6	5239125	5239130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_012796	CGG	2	6	5239140	5239145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_012796	GAA	2	6	5239180	5239185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_012796	GCC	2	6	5239194	5239199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_012796	CGG	2	6	5239205	5239210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_012796	TGC	2	6	5239228	5239233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_012796	GC	3	6	5239245	5239250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16078	NC_012796	TTC	2	6	5239555	5239560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_012796	GCG	2	6	5239564	5239569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16080	NC_012796	CTTTT	2	10	5239686	5239695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16081	NC_012796	GAT	2	6	5239820	5239825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_012796	CGA	2	6	5239843	5239848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_012796	ACCCC	2	10	5239863	5239872	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16084	NC_012796	C	6	6	5239869	5239874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16085	NC_012796	TTC	2	6	5239885	5239890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_012796	G	6	6	5239895	5239900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_012796	GCC	2	6	5239922	5239927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16088	NC_012796	GGC	2	6	5240776	5240781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_012796	GCC	2	6	5244540	5244545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16090	NC_012796	TCT	2	6	5244553	5244558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16091	NC_012796	GC	3	6	5246246	5246251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16092	NC_012796	TGC	2	6	5246254	5246259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_012796	CGC	2	6	5246288	5246293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16094	NC_012796	GCC	2	6	5246297	5246302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16095	NC_012796	AAT	2	6	5246322	5246327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_012796	CG	3	6	5246329	5246334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16097	NC_012796	GCG	2	6	5246388	5246393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_012796	CGGC	2	8	5246411	5246418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_012796	CAGG	2	8	5246427	5246434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16100	NC_012796	CGGC	2	8	5246465	5246472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16101	NC_012796	CCGGT	2	10	5246659	5246668	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16102	NC_012796	GGAC	2	8	5246676	5246683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16103	NC_012796	AAT	2	6	5246688	5246693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_012796	CGC	2	6	5246722	5246727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16105	NC_012796	GGC	2	6	5246791	5246796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_012796	TCC	2	6	5247986	5247991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_012796	CGG	2	6	5248009	5248014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_012796	T	6	6	5248019	5248024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.