MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 1

Total Repeats: 1739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012527	AAT	2	6	176593	176598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012527	CCT	2	6	176602	176607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_012527	TG	3	6	176613	176618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012527	GTG	2	6	176630	176635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012527	TGA	2	6	176693	176698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012527	TCG	2	6	176735	176740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012527	GT	3	6	176803	176808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012527	CA	3	6	176813	176818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_012527	AGG	2	6	177392	177397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012527	GTG	2	6	177475	177480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012527	CTCC	2	8	178669	178676	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1012	NC_012527	GT	4	8	178695	178702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012527	AAT	2	6	178769	178774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012527	TGCAG	2	10	178813	178822	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_012527	GCG	2	6	178866	178871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012527	TCG	2	6	178875	178880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012527	C	6	6	178887	178892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1018	NC_012527	GC	3	6	178917	178922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_012527	AAT	2	6	179085	179090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012527	GAA	2	6	179139	179144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012527	T	6	6	179211	179216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012527	AGC	2	6	179254	179259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012527	CCT	2	6	179344	179349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_012527	GTGG	2	8	179363	179370	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012527	GGC	2	6	179922	179927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_012527	TCC	2	6	179961	179966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_012527	GGA	2	6	180014	180019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012527	GCG	2	6	180063	180068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_012527	GCC	2	6	180089	180094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_012527	GAAACC	2	12	180107	180118	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_012527	AAG	2	6	180120	180125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012527	CGG	2	6	180135	180140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012527	ACG	2	6	180903	180908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_012527	TTTA	2	8	180969	180976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012527	TCC	2	6	181015	181020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_012527	CT	3	6	181077	181082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_012527	CTT	2	6	181109	181114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_012527	TTG	2	6	181147	181152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012527	CG	3	6	181782	181787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_012527	TGC	2	6	181803	181808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012527	ACG	2	6	181818	181823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_012527	ACT	2	6	181832	181837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012527	GTG	2	6	181853	181858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012527	AATC	2	8	181890	181897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_012527	CTG	2	6	181960	181965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012527	GGA	2	6	181988	181993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012527	CGTT	2	8	182012	182019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_012527	GGA	2	6	182049	182054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012527	CTG	2	6	182066	182071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012527	CCT	2	6	182073	182078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_012527	GCA	2	6	182092	182097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_012527	CCGG	2	8	182139	182146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_012527	CTC	2	6	182211	182216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_012527	GCA	2	6	182252	182257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_012527	GAC	2	6	182294	182299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012527	CAA	2	6	182402	182407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_012527	GAAA	2	8	182422	182429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012527	AGGG	2	8	182461	182468	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012527	GAA	2	6	182508	182513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012527	AG	3	6	182526	182531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012527	GAA	2	6	182542	182547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012527	GAG	2	6	182565	182570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012527	CAA	2	6	182602	182607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_012527	TGC	2	6	182612	182617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_012527	CAAG	2	8	182631	182638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_012527	A	7	7	182663	182669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012527	A	6	6	182683	182688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012527	CCA	2	6	182705	182710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_012527	CAC	2	6	183078	183083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_012527	TCCCC	2	10	183091	183100	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1071	NC_012527	CCGA	2	8	183112	183119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_012527	AG	3	6	183183	183188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012527	GAT	2	6	183195	183200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012527	CAGC	2	8	183202	183209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_012527	TGT	2	6	183218	183223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012527	GC	3	6	183232	183237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_012527	GCAG	2	8	183261	183268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_012527	GCG	2	6	183367	183372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012527	GCA	2	6	183380	183385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_012527	GCG	2	6	183393	183398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_012527	CTG	2	6	183408	183413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_012527	CAG	2	6	183508	183513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_012527	CAC	2	6	183518	183523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_012527	TCTGG	2	10	183533	183542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_012527	CG	3	6	183593	183598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_012527	GCAG	2	8	183702	183709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_012527	GTG	2	6	183717	183722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012527	CG	3	6	183743	183748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_012527	GCC	2	6	183830	183835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_012527	CAT	2	6	184004	184009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012527	CAC	2	6	184028	184033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_012527	CGG	2	6	184065	184070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_012527	GGCC	2	8	184516	184523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_012527	TCA	2	6	184538	184543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_012527	AGG	2	6	184671	184676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012527	AGC	2	6	184696	184701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_012527	GT	3	6	184734	184739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012527	CAT	2	6	184771	184776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_012527	CAA	2	6	184783	184788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012527	CGA	2	6	184836	184841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_012527	TGG	2	6	184881	184886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012527	GGC	2	6	184950	184955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012527	ATG	2	6	184962	184967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012527	CCG	2	6	184981	184986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_012527	GCC	2	6	184996	185001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_012527	ACC	2	6	185005	185010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_012527	GGC	2	6	186339	186344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_012527	CA	3	6	186370	186375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_012527	CTC	2	6	186393	186398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_012527	GGC	2	6	186417	186422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_012527	TCA	2	6	186529	186534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012527	AAT	2	6	186580	186585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012527	GCT	2	6	186646	186651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_012527	TGT	2	6	186708	186713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012527	TCC	2	6	186800	186805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_012527	ACG	2	6	186980	186985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_012527	GCCTG	2	10	187013	187022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_012527	TC	3	6	187898	187903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_012527	ACA	2	6	187960	187965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_012527	GCCA	2	8	187977	187984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_012527	AGTG	2	8	188984	188991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012527	CGTTT	2	10	189068	189077	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_012527	GAC	2	6	190184	190189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_012527	TC	3	6	190259	190264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_012527	TCTG	2	8	190271	190278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_012527	GTC	2	6	190279	190284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_012527	TCC	2	6	190354	190359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_012527	ATC	2	6	190371	190376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1130	NC_012527	CAA	2	6	190532	190537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_012527	AAT	2	6	190543	190548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012527	ACT	2	6	190563	190568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_012527	GAG	2	6	190574	190579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_012527	TTC	2	6	190658	190663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_012527	CTG	2	6	190926	190931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_012527	GCA	2	6	249012	249017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_012527	G	6	6	249020	249025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1404	NC_012527	C	6	6	249040	249045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1405	NC_012527	TCT	2	6	249140	249145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_012527	AGC	2	6	249200	249205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_012527	ACG	2	6	250550	250555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_012527	ATG	2	6	250579	250584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_012527	AGGG	2	8	250634	250641	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_012527	GGC	2	6	250682	250687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_012527	GCC	2	6	250713	250718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_012527	ACC	2	6	250782	250787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_012527	GCA	2	6	251635	251640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_012527	GCA	2	6	251711	251716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_012527	CAA	2	6	254055	254060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1422	NC_012527	TTC	2	6	255893	255898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1423	NC_012527	ATC	2	6	258548	258553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1425	NC_012527	CAT	2	6	259611	259616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_012527	GCGT	2	8	259657	259664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1427	NC_012527	GCT	2	6	259690	259695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1430	NC_012527	CAC	2	6	259939	259944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1431	NC_012527	CCG	2	6	259950	259955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1432	NC_012527	GAC	2	6	260532	260537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_012527	GGAG	2	8	260552	260559	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_012527	CAG	2	6	260724	260729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_012527	CTG	2	6	260790	260795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_012527	AGG	2	6	260821	260826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_012527	TGA	2	6	260837	260842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_012527	ACC	2	6	260923	260928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_012527	GA	3	6	260936	260941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_012527	GAA	2	6	260944	260949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_012527	CGAGAA	2	12	260955	260966	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1446	NC_012527	GGC	2	6	260991	260996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_012527	CGC	2	6	261117	261122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1452	NC_012527	CATC	2	8	261312	261319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1453	NC_012527	AAG	2	6	262946	262951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_012527	GTCAG	2	10	263271	263280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1483	NC_012527	A	6	6	266067	266072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_012527	AG	3	6	266154	266159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1488	NC_012527	GGGC	2	8	266175	266182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1492	NC_012527	CCAGAG	2	12	267225	267236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1499	NC_012527	GAA	2	6	268240	268245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_012527	ATT	2	6	268336	268341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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