MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense DCB-2 chromosome

Total Repeats: 15718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011830	T	6	6	43	48	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011830	TA	3	6	1491	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011830	TTA	2	6	1638	1643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011830	T	6	6	1677	1682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011830	GAG	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011830	GCT	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011830	ACC	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011830	AAG	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011830	CT	3	6	4193	4198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011830	GGGA	2	8	4312	4319	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011830	GGA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011830	AATAT	2	10	8765	8774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011830	AG	3	6	8813	8818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011830	GGA	2	6	9466	9471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011830	CGTCA	2	10	10834	10843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011830	T	6	6	10978	10983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011830	TCC	2	6	11078	11083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011830	CCA	2	6	11089	11094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011830	AGT	2	6	11583	11588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011830	GGA	2	6	11614	11619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011830	CCGT	2	8	11669	11676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011830	CCT	2	6	11691	11696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011830	GAACA	2	10	11778	11787	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011830	A	6	6	11830	11835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011830	GAGCG	2	10	11886	11895	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011830	AAT	2	6	11919	11924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011830	TAT	2	6	11956	11961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011830	ATA	2	6	11966	11971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011830	TTG	2	6	11981	11986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011830	TGA	2	6	12003	12008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011830	TG	3	6	12087	12092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011830	A	7	7	12118	12124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011830	ACA	2	6	12366	12371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011830	AGA	2	6	12396	12401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011830	TCG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011830	CAT	2	6	12483	12488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011830	AGC	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011830	GCA	2	6	12507	12512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011830	GAA	2	6	12528	12533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011830	A	6	6	12553	12558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011830	GA	3	6	12579	12584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011830	GATT	2	8	13559	13566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011830	AATC	2	8	13578	13585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011830	AT	3	6	13642	13647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011830	GCT	2	6	14291	14296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011830	AGG	2	6	14344	14349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011830	TCC	2	6	14372	14377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011830	TGA	2	6	15296	15301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011830	GTT	2	6	15352	15357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011830	AGG	2	6	15547	15552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011830	TAA	2	6	15809	15814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011830	TA	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011830	CAA	2	6	15913	15918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011830	TTCAG	2	10	15968	15977	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011830	A	7	7	16020	16026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011830	T	6	6	16089	16094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011830	ATA	2	6	16111	16116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011830	GGGGCT	2	12	17305	17316	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011830	CTC	2	6	18859	18864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011830	T	6	6	18868	18873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011830	A	6	6	18904	18909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011830	A	6	6	18956	18961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011830	ACAA	2	8	18963	18970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011830	CAA	3	9	18968	18976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011830	ACA	2	6	19037	19042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011830	A	6	6	19042	19047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011830	T	6	6	19074	19079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011830	ACGG	2	8	19098	19105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011830	ATT	2	6	19115	19120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011830	TTA	2	6	19150	19155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011830	A	6	6	19214	19219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011830	CAT	2	6	19286	19291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011830	AT	3	6	21364	21369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011830	AGT	2	6	21375	21380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011830	TGA	2	6	21391	21396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011830	AGT	2	6	21425	21430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011830	ATG	2	6	21455	21460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011830	CGG	3	9	21481	21489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011830	AG	3	6	21515	21520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011830	CAT	2	6	21872	21877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011830	AGT	2	6	21923	21928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011830	TAA	2	6	21959	21964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011830	ACA	2	6	21978	21983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011830	ATA	2	6	21986	21991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011830	AGG	2	6	22535	22540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011830	TTG	2	6	22990	22995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011830	ATTT	2	8	23098	23105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011830	ATAA	2	8	23139	23146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011830	CCTG	2	8	23164	23171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011830	TAA	2	6	23173	23178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011830	GGAGG	2	10	23197	23206	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011830	ATTT	2	8	23210	23217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011830	AGA	2	6	23237	23242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011830	A	7	7	23246	23252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011830	GAA	2	6	23292	23297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011830	GAA	2	6	23302	23307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011830	AAGA	2	8	24958	24965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011830	TA	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011830	GCA	2	6	27773	27778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011830	T	6	6	27833	27838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011830	T	7	7	28396	28402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011830	CCT	2	6	28433	28438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011830	AGG	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011830	AGTC	2	8	32445	32452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011830	AAC	2	6	32583	32588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011830	TAT	2	6	32629	32634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011830	T	7	7	32672	32678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011830	GAA	2	6	32712	32717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011830	GAAA	2	8	32733	32740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011830	T	7	7	32758	32764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011830	ACTT	2	8	32782	32789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011830	GGA	2	6	32809	32814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011830	CTC	2	6	39977	39982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011830	TAA	2	6	40080	40085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011830	AATGCG	2	12	40086	40097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011830	A	6	6	40112	40117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011830	AGG	2	6	40132	40137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011830	TAAT	2	8	42720	42727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011830	A	6	6	42738	42743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011830	TAGA	2	8	43245	43252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011830	A	6	6	43252	43257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011830	AGG	2	6	43262	43267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011830	TTA	2	6	46783	46788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011830	TAA	2	6	47075	47080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011830	CT	4	8	47200	47207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011830	TGA	2	6	47391	47396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011830	AGC	2	6	47449	47454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011830	TG	3	6	47471	47476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011830	GGT	2	6	47572	47577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011830	T	7	7	47589	47595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011830	TGGAC	2	10	47619	47628	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011830	A	6	6	50310	50315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011830	AAT	2	6	50324	50329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011830	TTC	2	6	50331	50336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011830	TAG	2	6	50364	50369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011830	AGG	2	6	50376	50381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011830	T	7	7	50695	50701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011830	T	7	7	50714	50720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011830	ATT	2	6	50726	50731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011830	TACTGA	2	12	50779	50790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_011830	T	6	6	50900	50905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011830	A	6	6	50963	50968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011830	T	6	6	50976	50981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011830	TTA	2	6	50989	50994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011830	AGG	2	6	51006	51011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011830	AG	3	6	54573	54578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011830	GCAG	2	8	54621	54628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011830	TAA	2	6	54662	54667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011830	TA	3	6	54670	54675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011830	TG	3	6	56111	56116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011830	A	6	6	56118	56123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011830	GAAG	2	8	56136	56143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_011830	T	6	6	69215	69220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_011830	ATATA	2	10	105542	105551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_011830	ATA	2	6	107486	107491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011830	TTA	2	6	113502	113507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011830	GAT	2	6	113584	113589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011830	GGGA	2	8	115795	115802	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011830	TCA	2	6	120799	120804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_011830	ATT	2	6	120816	120821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011830	GTTG	2	8	120832	120839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
297	NC_011830	CTT	2	6	120853	120858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_011830	CGT	2	6	120909	120914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_011830	AAG	2	6	120936	120941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011830	T	6	6	123111	123116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_011830	AAG	2	6	123140	123145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011830	TCCTT	2	10	124013	124022	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
303	NC_011830	ACA	2	6	124067	124072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_011830	CCTG	2	8	124077	124084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
305	NC_011830	TTAAAT	2	12	124124	124135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_011830	ATC	2	6	125160	125165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_011830	GGAGT	2	10	125200	125209	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
308	NC_011830	AGA	2	6	125776	125781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_011830	GAA	2	6	126520	126525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
312	NC_011830	ATT	2	6	126556	126561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_011830	GTAT	2	8	126564	126571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
314	NC_011830	ACC	2	6	126573	126578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
315	NC_011830	TGCC	2	8	126608	126615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
316	NC_011830	GAA	2	6	127680	127685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
317	NC_011830	ATG	2	6	127687	127692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_011830	ATT	2	6	129707	129712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_011830	AAT	2	6	129719	129724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_011830	ATTA	2	8	129839	129846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_011830	ATA	2	6	129889	129894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_011830	AGA	2	6	129923	129928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
328	NC_011830	AGTT	2	8	129933	129940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
329	NC_011830	T	7	7	129945	129951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_011830	TAT	2	6	130010	130015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_011830	ATT	2	6	132196	132201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_011830	ATAACT	2	12	132202	132213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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342	NC_011830	AAAG	2	8	132293	132300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_011830	TC	3	6	145322	145327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
385	NC_011830	CCG	2	6	145341	145346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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417	NC_011830	ATC	2	6	148416	148421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_011830	GAAG	2	8	148929	148936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
421	NC_011830	T	6	6	148939	148944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_011830	GTA	2	6	148948	148953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_011830	TAT	2	6	149076	149081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011830	AGG	2	6	151200	151205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011830	GAAG	2	8	152663	152670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_011830	ATG	2	6	152735	152740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_011830	T	7	7	152746	152752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_011830	AGA	2	6	152755	152760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011830	GGA	2	6	152763	152768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_011830	AG	3	6	155215	155220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_011830	A	6	6	156746	156751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_011830	TAA	2	6	169854	169859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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