MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfococcus oleovorans Hxd3 chromosome

Total Repeats: 10120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009943	T	6	6	3894625	3894630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_009943	TGT	2	6	3894671	3894676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_009943	CGC	2	6	3894678	3894683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_009943	GA	4	8	3894706	3894713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_009943	ATGG	2	8	3894733	3894740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_009943	GCC	2	6	3894779	3894784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_009943	TCA	2	6	3894881	3894886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009943	TCCA	2	8	3894902	3894909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_009943	TGT	2	6	3894912	3894917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009943	CGC	2	6	3895010	3895015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_009943	GCCG	2	8	3895024	3895031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_009943	GA	4	8	3895038	3895045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009943	GATG	2	8	3895064	3895071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_009943	A	6	6	3895097	3895102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_009943	CTG	2	6	3895106	3895111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_009943	GCTC	2	8	3895182	3895189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_009943	A	6	6	3895223	3895228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009943	GCT	2	6	3895293	3895298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_009943	TCCA	2	8	3895341	3895348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_009943	ACT	2	6	3895357	3895362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_009943	A	7	7	3895373	3895379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_009943	T	6	6	3895398	3895403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009943	GTA	2	6	3895412	3895417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009943	TA	3	6	3895416	3895421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_009943	AAT	2	6	3896913	3896918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_009943	T	6	6	3896918	3896923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_009943	A	6	6	3896930	3896935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009943	ATGG	2	8	3896997	3897004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_009943	TAAA	2	8	3897014	3897021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_009943	TAAA	2	8	3897101	3897108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_009943	TG	3	6	3897158	3897163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_009943	ATA	2	6	3897170	3897175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_009943	AGG	2	6	3898240	3898245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10036	NC_009943	AAC	2	6	3899973	3899978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_009943	AG	3	6	3908178	3908183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009943	CT	5	10	3910621	3910630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_009943	CGTA	2	8	3910640	3910647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_009943	TTC	2	6	3910670	3910675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_009943	CT	3	6	3911768	3911773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_009943	TCT	2	6	3912632	3912637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_009943	CGC	2	6	3912667	3912672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_009943	TGT	2	6	3912676	3912681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_009943	TCC	2	6	3912707	3912712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_009943	CTT	2	6	3912730	3912735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_009943	GGCA	2	8	3912785	3912792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10048	NC_009943	TGCC	2	8	3912802	3912809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_009943	TCC	2	6	3914945	3914950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_009943	T	6	6	3914964	3914969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_009943	TAAAAA	2	12	3915044	3915055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_009943	A	7	7	3915082	3915088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_009943	ACTGGC	2	12	3915096	3915107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_009943	ATT	2	6	3915110	3915115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009943	G	6	6	3915169	3915174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_009943	A	6	6	3915191	3915196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_009943	G	9	9	3915229	3915237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009943	TTC	2	6	3915251	3915256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_009943	TTC	2	6	3915268	3915273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_009943	GGCC	2	8	3915310	3915317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_009943	A	7	7	3915356	3915362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009943	ATT	2	6	3915857	3915862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009943	T	6	6	3915881	3915886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009943	GTTT	2	8	3915896	3915903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009943	AGC	2	6	3917340	3917345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_009943	T	6	6	3917361	3917366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_009943	G	6	6	3917397	3917402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_009943	A	6	6	3917409	3917414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10072	NC_009943	G	6	6	3917583	3917588	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_009943	GAG	2	6	3917643	3917648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009943	CGC	2	6	3917667	3917672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10092	NC_009943	CAA	2	6	3940109	3940114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10099	NC_009943	ACC	2	6	3943134	3943139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10101	NC_009943	TGG	2	6	3943313	3943318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_009943	CT	3	6	3943343	3943348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_009943	AGGC	3	12	3943411	3943422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10108	NC_009943	A	6	6	3943532	3943537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_009943	TTG	2	6	3943601	3943606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10114	NC_009943	GAT	2	6	3943854	3943859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10117	NC_009943	T	7	7	3943987	3943993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_009943	GCCG	2	8	3944118	3944125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_009943	T	7	7	3944161	3944167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.