MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009455	AGG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009455	AG	3	6	45	50	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009455	CTTG	2	8	102	109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009455	GT	3	6	194	199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009455	GGGA	2	8	232	239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009455	GTT	3	9	1616	1624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009455	T	6	6	1623	1628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009455	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009455	A	6	6	1761	1766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009455	TTA	4	12	1807	1818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009455	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009455	ATTTC	2	10	5798	5807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009455	AT	3	6	5823	5828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009455	A	7	7	5870	5876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009455	TGGC	2	8	5983	5990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009455	TAA	2	6	8209	8214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009455	CAG	2	6	8235	8240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009455	TA	4	8	11357	11364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009455	CCT	2	6	11369	11374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009455	CTTT	2	8	12316	12323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009455	AGAT	2	8	12326	12333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009455	CCG	2	6	12340	12345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009455	GAA	2	6	12387	12392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009455	AGGG	2	8	12410	12417	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009455	TAAA	2	8	12443	12450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009455	AGC	3	9	13868	13876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009455	GGT	2	6	14805	14810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009455	GGA	2	6	14835	14840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009455	AATC	2	8	15556	15563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009455	AGG	2	6	15571	15576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009455	CAG	2	6	16402	16407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009455	CCT	2	6	18222	18227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009455	A	6	6	18291	18296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009455	CAA	2	6	18376	18381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009455	TC	4	8	18443	18450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009455	TAAAA	2	10	18486	18495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009455	TAG	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009455	AAT	2	6	18999	19004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009455	AT	4	8	19480	19487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009455	T	6	6	19487	19492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009455	AT	3	6	19504	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009455	TAATT	2	10	19569	19578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009455	ATC	2	6	19584	19589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009455	T	6	6	19601	19606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009455	TATATC	2	12	19728	19739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009455	A	6	6	19749	19754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009455	TTG	2	6	19799	19804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009455	AGT	2	6	19809	19814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009455	GCTT	2	8	20624	20631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009455	AT	3	6	20636	20641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009455	AGG	2	6	20693	20698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009455	ATA	2	6	21125	21130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009455	CGG	2	6	21356	21361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009455	TCC	2	6	24260	24265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009455	AT	4	8	24326	24333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009455	GA	3	6	24368	24373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009455	TAAA	2	8	24374	24381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009455	TC	3	6	28912	28917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009455	ATG	2	6	28933	28938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009455	TGA	2	6	28949	28954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009455	GA	3	6	28953	28958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009455	TCT	2	6	28973	28978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009455	AT	3	6	28997	29002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009455	GT	3	6	29037	29042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009455	GCT	2	6	29076	29081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009455	AAT	2	6	29086	29091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009455	ATG	2	6	29106	29111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009455	GTT	2	6	29112	29117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009455	TATC	2	8	29151	29158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009455	AAAT	2	8	29163	29170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009455	AT	3	6	29169	29174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009455	AT	4	8	29252	29259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009455	GAAA	2	8	29266	29273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009455	AAAT	2	8	29274	29281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009455	AGG	2	6	29298	29303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009455	AT	3	6	31865	31870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009455	CAG	2	6	32002	32007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009455	CTTT	2	8	34484	34491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009455	CCT	2	6	35122	35127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009455	ATT	2	6	35157	35162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009455	ATA	2	6	36014	36019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009455	TAT	2	6	36029	36034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009455	AAT	2	6	36534	36539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009455	GAA	2	6	36557	36562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009455	T	6	6	36569	36574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009455	CCT	2	6	36612	36617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009455	AT	4	8	36622	36629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009455	TCC	2	6	38468	38473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009455	TA	3	6	41278	41283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009455	AGA	2	6	41288	41293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009455	ATT	2	6	41304	41309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009455	TGA	2	6	41323	41328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009455	TATCT	2	10	41349	41358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009455	GGC	2	6	45669	45674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009455	TCT	2	6	45723	45728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009455	ATG	2	6	45732	45737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009455	A	6	6	46912	46917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009455	ATA	2	6	46979	46984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009455	AG	3	6	47006	47011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009455	TAC	2	6	47121	47126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009455	TGG	2	6	47171	47176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009455	ATT	2	6	47373	47378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009455	TAG	2	6	47383	47388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009455	GCGA	2	8	47391	47398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009455	AAG	2	6	47462	47467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009455	TTCT	2	8	47585	47592	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009455	CCG	2	6	47628	47633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_009455	TGA	2	6	47661	47666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009455	GAA	2	6	47789	47794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009455	CGA	2	6	47800	47805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009455	AAGCGA	2	12	47848	47859	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_009455	GTGAA	2	10	47925	47934	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009455	GTT	2	6	47976	47981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009455	GA	3	6	48107	48112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009455	AGC	2	6	48290	48295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009455	GTG	2	6	48332	48337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009455	AAC	2	6	48443	48448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009455	CAG	2	6	48599	48604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009455	TTA	2	6	48606	48611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009455	CAC	2	6	48618	48623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009455	G	6	6	48639	48644	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009455	AGG	2	6	48649	48654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009455	TGG	2	6	48745	48750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009455	GA	3	6	48759	48764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009455	GAG	2	6	49061	49066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009455	CGG	2	6	49105	49110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009455	AAC	2	6	49180	49185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009455	TGG	2	6	49355	49360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009455	TGG	2	6	49430	49435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009455	CCT	2	6	49457	49462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009455	TGGA	2	8	49499	49506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009455	TCG	2	6	49708	49713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009455	CGT	2	6	49788	49793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009455	GGTC	2	8	49800	49807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009455	CGT	2	6	49814	49819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009455	GT	3	6	49884	49889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009455	GTT	2	6	49892	49897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009455	GT	3	6	50042	50047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009455	TGG	2	6	50203	50208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009455	ACC	2	6	50224	50229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009455	TCCCG	2	10	50233	50242	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_009455	AGG	2	6	50280	50285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009455	GCTTT	2	10	50321	50330	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_009455	TTCA	2	8	50331	50338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009455	TTAA	2	8	50372	50379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009455	T	7	7	50401	50407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009455	CTTT	2	8	50442	50449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009455	TAA	2	6	50462	50467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_009455	GTT	2	6	88690	88695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_009455	A	6	6	154684	154689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_009455	AAT	2	6	154691	154696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_009455	G	6	6	154728	154733	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
438	NC_009455	TATT	2	8	155168	155175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_009455	GAT	2	6	155180	155185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_009455	AAT	2	6	155274	155279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009455	ACC	2	6	157130	157135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_009455	TAT	2	6	157158	157163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_009455	AT	3	6	157162	157167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_009455	GCC	2	6	157231	157236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_009455	CCG	2	6	161155	161160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_009455	CTT	2	6	161531	161536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_009455	CCT	2	6	161549	161554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_009455	TAAT	2	8	161561	161568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_009455	A	6	6	162617	162622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_009455	GATA	2	8	162675	162682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
456	NC_009455	TGT	2	6	162750	162755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_009455	GTT	2	6	162899	162904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_009455	CAT	2	6	171219	171224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_009455	CAA	2	6	171563	171568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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479	NC_009455	GGT	2	6	172989	172994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
480	NC_009455	TAT	2	6	172995	173000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_009455	CTT	2	6	173012	173017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_009455	T	6	6	173338	173343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_009455	GC	3	6	174809	174814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_009455	ATAAA	2	10	174971	174980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_009455	AAT	2	6	178211	178216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_009455	AT	3	6	178579	178584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_009455	TAAAA	2	10	178592	178601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_009455	AAG	2	6	178801	178806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
498	NC_009455	TA	3	6	178881	178886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_009455	AAC	2	6	178905	178910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_009455	AAT	2	6	178915	178920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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