MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009455	A	6	6	365479	365484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009455	TTA	2	6	365998	366003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009455	TAT	2	6	366015	366020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009455	TAGT	2	8	366773	366780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009455	A	6	6	366782	366787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009455	ATG	2	6	366809	366814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009455	AT	3	6	366898	366903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009455	CTA	2	6	371515	371520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_009455	ATT	2	6	371554	371559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009455	TAA	2	6	371575	371580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_009455	GGA	2	6	371639	371644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_009455	AGC	2	6	372146	372151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_009455	CCG	2	6	372163	372168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_009455	CATT	2	8	372198	372205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_009455	TGA	2	6	372208	372213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009455	TAA	2	6	373026	373031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009455	A	6	6	373030	373035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009455	AGTCA	2	10	374269	374278	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_009455	TAT	2	6	374297	374302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009455	TTTG	2	8	374347	374354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_009455	TAT	2	6	374407	374412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009455	TGGG	2	8	374420	374427	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009455	AAT	2	6	374472	374477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009455	AGG	2	6	377227	377232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_009455	CGGG	2	8	378337	378344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_009455	CAAA	2	8	378375	378382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_009455	A	6	6	378380	378385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_009455	TAA	2	6	380265	380270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009455	A	6	6	381179	381184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009455	CAG	2	6	381185	381190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_009455	GGA	2	6	381254	381259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009455	T	6	6	384913	384918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009455	A	6	6	385093	385098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009455	TAAA	2	8	385157	385164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009455	AT	4	8	389349	389356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009455	CTT	2	6	389367	389372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_009455	TGTTT	2	10	389380	389389	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_009455	AGG	2	6	391978	391983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009455	TCT	2	6	392495	392500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009455	T	6	6	392821	392826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009455	TA	3	6	392842	392847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_009455	TCTG	2	8	394972	394979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_009455	AT	3	6	397842	397847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009455	ATT	2	6	399374	399379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009455	ATTT	2	8	399415	399422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009455	A	6	6	399435	399440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009455	CTA	2	6	399456	399461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_009455	AGCT	2	8	399481	399488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_009455	T	6	6	399864	399869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009455	TAT	2	6	399930	399935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009455	AG	3	6	401539	401544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009455	TCC	2	6	402357	402362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_009455	TTA	2	6	402368	402373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009455	T	7	7	402456	402462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009455	AAT	2	6	402479	402484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009455	ACC	2	6	402514	402519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_009455	AT	3	6	402529	402534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_009455	TAT	3	9	402532	402540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009455	TCC	2	6	403402	403407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_009455	CCT	2	6	403480	403485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_009455	TGGT	2	8	403504	403511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009455	A	6	6	403564	403569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009455	GCAG	2	8	403642	403649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_009455	AAAT	2	8	403687	403694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009455	ATT	2	6	403711	403716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009455	TAA	2	6	403717	403722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009455	TGA	2	6	403723	403728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009455	GAT	2	6	403791	403796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009455	T	7	7	403796	403802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009455	ATAAA	2	10	403810	403819	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009455	TGG	2	6	403848	403853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009455	GTT	2	6	404104	404109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009455	AGC	2	6	404130	404135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_009455	CTTAGC	2	12	407107	407118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_009455	TA	3	6	409475	409480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009455	GCA	2	6	409505	409510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_009455	TA	3	6	410781	410786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_009455	GTT	2	6	410804	410809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_009455	TAT	2	6	415274	415279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_009455	AT	3	6	415298	415303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_009455	A	7	7	421159	421165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009455	TTGAC	2	10	421207	421216	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1083	NC_009455	ATAA	2	8	421262	421269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009455	ATT	2	6	426059	426064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009455	GGGCA	2	10	428230	428239	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1086	NC_009455	TGT	2	6	430096	430101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_009455	GCT	2	6	430119	430124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_009455	ATT	2	6	430184	430189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009455	TAT	2	6	430579	430584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009455	CAAA	2	8	431137	431144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_009455	AT	3	6	431193	431198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009455	TACAA	2	10	431235	431244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_009455	GGA	2	6	431302	431307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009455	GAA	2	6	435805	435810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009455	TAAA	2	8	440760	440767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009455	AAC	2	6	440782	440787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_009455	TA	3	6	441175	441180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_009455	TA	4	8	448611	448618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009455	C	6	6	449720	449725	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1100	NC_009455	GGA	2	6	449734	449739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009455	TGG	2	6	449756	449761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009455	T	6	6	449769	449774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009455	AGT	2	6	449813	449818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009455	ATAGC	2	10	449862	449871	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_009455	TAT	2	6	449905	449910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009455	T	6	6	449919	449924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_009455	ATTG	2	8	450139	450146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009455	ATT	2	6	450158	450163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009455	GGT	2	6	455152	455157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009455	GGGTA	2	10	456291	456300	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009455	GA	3	6	458420	458425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009455	TAA	2	6	459869	459874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009455	AGG	2	6	465889	465894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009455	AGG	2	6	466934	466939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009455	TAT	2	6	468337	468342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009455	TA	4	8	469951	469958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009455	AATT	2	8	470228	470235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009455	TTA	2	6	470302	470307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009455	TTA	2	6	470381	470386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009455	TA	3	6	470518	470523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_009455	GCT	2	6	470576	470581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009455	CTG	2	6	470595	470600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009455	AAT	2	6	473082	473087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009455	GCCA	2	8	473093	473100	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_009455	GTA	2	6	473335	473340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009455	TAC	2	6	475834	475839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009455	CCT	2	6	479515	479520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_009455	ATT	2	6	479571	479576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_009455	AAT	2	6	482647	482652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_009455	T	7	7	482679	482685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_009455	TAT	2	6	482703	482708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_009455	TC	3	6	485892	485897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_009455	GGT	2	6	488578	488583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009455	TTG	2	6	488642	488647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009455	GGCA	2	8	488669	488676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_009455	ATG	2	6	488684	488689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_009455	CAG	2	6	499252	499257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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