MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. BAV1 chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009455	ATA	2	6	178937	178942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009455	CAT	2	6	179659	179664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009455	T	6	6	179671	179676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009455	CAA	2	6	179682	179687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_009455	TGG	2	6	179689	179694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009455	GGAG	2	8	179797	179804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009455	GT	3	6	179805	179810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009455	GAG	2	6	179874	179879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009455	TGG	2	6	181705	181710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009455	CCT	2	6	182538	182543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_009455	GTT	2	6	182572	182577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009455	TCCT	2	8	182583	182590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_009455	CAT	2	6	191230	191235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009455	CCCCT	2	10	191243	191252	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
515	NC_009455	TGCC	2	8	191280	191287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009455	CTT	2	6	191323	191328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009455	GGC	2	6	191344	191349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009455	TAG	2	6	191395	191400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009455	TG	3	6	191494	191499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009455	ATT	2	6	191509	191514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009455	GTT	2	6	191519	191524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009455	A	7	7	191555	191561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009455	CCT	2	6	192095	192100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_009455	TTA	2	6	193051	193056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009455	CT	3	6	193097	193102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_009455	GATGG	2	10	193118	193127	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009455	CTA	2	6	193287	193292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_009455	TTGA	2	8	193321	193328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009455	CTT	2	6	193483	193488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009455	GAC	2	6	193490	193495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_009455	CTT	2	6	193529	193534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_009455	CTT	2	6	193564	193569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009455	CAAT	2	8	193593	193600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_009455	TCC	2	6	193655	193660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_009455	AATA	2	8	193678	193685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009455	CT	3	6	193700	193705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_009455	CCG	2	6	193760	193765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_009455	TCTGCC	2	12	193804	193815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
539	NC_009455	A	7	7	193850	193856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009455	A	6	6	193897	193902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009455	A	6	6	193905	193910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009455	TAG	2	6	195293	195298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009455	TA	4	8	195346	195353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009455	TGT	2	6	196033	196038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009455	CAA	2	6	196079	196084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009455	TA	3	6	196116	196121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009455	GGCGC	2	10	196206	196215	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
548	NC_009455	TAT	2	6	196290	196295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009455	TAA	2	6	196318	196323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009455	TTA	2	6	196333	196338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009455	TTC	2	6	199541	199546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009455	AGTG	2	8	199557	199564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009455	ATTT	2	8	203240	203247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009455	GCC	2	6	203300	203305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_009455	TCT	2	6	203359	203364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009455	T	6	6	203373	203378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009455	TGG	2	6	203446	203451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009455	TTC	2	6	203489	203494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_009455	CCT	2	6	204683	204688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_009455	CGA	2	6	204740	204745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009455	AT	3	6	204801	204806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009455	CACC	2	8	204917	204924	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
563	NC_009455	CTC	2	6	205094	205099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_009455	GT	3	6	205106	205111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009455	T	6	6	205117	205122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009455	TA	3	6	205164	205169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009455	CCT	2	6	205269	205274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_009455	ATTA	2	8	205333	205340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009455	TCA	2	6	205352	205357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_009455	GCCAG	2	10	205498	205507	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
571	NC_009455	CAC	2	6	205530	205535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_009455	T	6	6	205568	205573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009455	CCG	2	6	206023	206028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_009455	CCA	2	6	206126	206131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_009455	GT	3	6	211591	211596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009455	CCT	2	6	212764	212769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_009455	TTA	2	6	212787	212792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009455	TCA	2	6	212816	212821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009455	CAT	2	6	212826	212831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009455	CAT	3	9	212838	212846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_009455	ATC	2	6	212848	212853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009455	CAT	2	6	212865	212870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009455	GGT	2	6	212895	212900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009455	GTA	2	6	212910	212915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009455	GTATTG	2	12	212931	212942	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009455	CTG	2	6	212970	212975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_009455	CCT	2	6	212998	213003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_009455	ATG	2	6	213074	213079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009455	CAT	2	6	213085	213090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009455	ATC	2	6	213092	213097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009455	CAT	2	6	213109	213114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_009455	TAG	2	6	213158	213163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009455	TGC	2	6	213224	213229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_009455	TCC	2	6	213245	213250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_009455	TAA	2	6	213255	213260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009455	CCT	2	6	213589	213594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_009455	TCGT	2	8	213598	213605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_009455	TAA	2	6	213724	213729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009455	CCT	2	6	213791	213796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_009455	TA	3	6	213824	213829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009455	ATA	2	6	213860	213865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009455	GGT	2	6	213912	213917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009455	CCA	2	6	213984	213989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_009455	GCTC	2	8	214344	214351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_009455	TCA	2	6	214455	214460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_009455	CCT	2	6	215337	215342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_009455	ACC	2	6	215348	215353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_009455	ACC	2	6	215415	215420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_009455	CTTT	2	8	216442	216449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_009455	CGG	2	6	216509	216514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009455	GATT	2	8	216628	216635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009455	TTC	2	6	216660	216665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_009455	CAT	2	6	216717	216722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_009455	CTG	2	6	216725	216730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_009455	ACC	2	6	216783	216788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_009455	CCA	2	6	216835	216840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_009455	GAT	2	6	216886	216891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009455	TAC	2	6	216905	216910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009455	AGCC	2	8	216924	216931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_009455	GGT	2	6	216951	216956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009455	GCA	2	6	217079	217084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009455	CGTG	2	8	217104	217111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_009455	CTTTT	2	10	217133	217142	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
624	NC_009455	GAT	2	6	219368	219373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009455	GTC	2	6	220370	220375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_009455	TAT	2	6	220474	220479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009455	TGC	2	6	220508	220513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009455	ATG	2	6	220612	220617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009455	TCT	2	6	220646	220651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_009455	GTA	2	6	220761	220766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009455	TAT	2	6	220860	220865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009455	AGG	2	6	220874	220879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009455	GAG	2	6	220881	220886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009455	AG	3	6	222229	222234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009455	T	6	6	224430	224435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009455	CGG	2	6	224458	224463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_009455	TAT	2	6	225577	225582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009455	ATCC	2	8	225584	225591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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