MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 3443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009446	TTTC	2	8	57	64	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009446	GATCA	2	10	117	126	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009446	CTACGA	2	12	1636	1647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009446	TGC	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009446	ATT	3	9	7897	7905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009446	TATT	2	8	7909	7916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009446	GTT	2	6	7926	7931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009446	A	6	6	7951	7956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009446	AATG	2	8	7958	7965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009446	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009446	CGAA	2	8	9459	9466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009446	GC	3	6	9467	9472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009446	CCG	2	6	9514	9519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009446	CGG	2	6	11436	11441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009446	AAG	2	6	11474	11479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009446	GAG	2	6	11508	11513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009446	ATA	2	6	11514	11519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009446	TGTTA	2	10	11979	11988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009446	TGA	2	6	12019	12024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009446	CGG	2	6	12033	12038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009446	TGT	2	6	12069	12074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009446	A	6	6	12135	12140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009446	GAT	2	6	13184	13189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009446	T	6	6	13212	13217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009446	TGA	2	6	13233	13238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009446	TTA	2	6	14740	14745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009446	ATTTTT	2	12	14818	14829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009446	CGAT	2	8	14831	14838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009446	T	7	7	14877	14883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009446	A	6	6	14922	14927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009446	TAG	2	6	14930	14935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009446	TAAAAT	2	12	14993	15004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009446	TA	3	6	18641	18646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009446	T	6	6	18673	18678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009446	TGTC	2	8	18729	18736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009446	A	7	7	18815	18821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009446	GCCC	2	8	18824	18831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_009446	AAG	2	6	18900	18905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009446	AAG	2	6	18921	18926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009446	A	6	6	18973	18978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009446	CTT	2	6	19036	19041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009446	TGT	2	6	24888	24893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009446	T	8	8	29614	29621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009446	GTA	2	6	29655	29660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009446	GT	3	6	29674	29679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009446	ATG	2	6	29724	29729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009446	ATT	2	6	31207	31212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009446	AAAAG	2	10	31221	31230	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009446	TCC	2	6	38219	38224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009446	AG	3	6	38225	38230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009446	CAA	2	6	38235	38240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009446	A	6	6	38239	38244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009446	CGA	2	6	38326	38331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009446	TAT	2	6	38371	38376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009446	A	7	7	38407	38413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009446	TTG	2	6	38433	38438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009446	AAT	2	6	38478	38483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009446	ATT	2	6	38488	38493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009446	GTTTT	2	10	38515	38524	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009446	A	6	6	38541	38546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009446	A	6	6	38604	38609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009446	ATA	2	6	38611	38616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009446	A	6	6	38629	38634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009446	GCA	2	6	38641	38646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009446	A	6	6	38681	38686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009446	ATTT	2	8	38704	38711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009446	AAT	2	6	38719	38724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009446	TATT	2	8	38750	38757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009446	ATTG	2	8	38769	38776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009446	ATT	2	6	38778	38783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009446	TAA	2	6	38786	38791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009446	ATA	2	6	38795	38800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009446	ATTT	2	8	38808	38815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009446	CGC	2	6	38842	38847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009446	T	8	8	38864	38871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009446	TC	3	6	38880	38885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009446	ACT	2	6	38915	38920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009446	TAAA	2	8	38941	38948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009446	A	6	6	38953	38958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009446	TTG	2	6	39776	39781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009446	TCT	2	6	39794	39799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009446	A	6	6	39823	39828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009446	T	6	6	39836	39841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009446	ATT	2	6	39842	39847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009446	TTA	2	6	40635	40640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009446	TTC	2	6	40647	40652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009446	AAT	2	6	40664	40669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009446	GAATTA	2	12	40677	40688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009446	T	6	6	40689	40694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009446	T	8	8	40715	40722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009446	TA	3	6	40724	40729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009446	A	6	6	40729	40734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009446	ATA	2	6	40746	40751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009446	TCA	2	6	40762	40767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009446	T	6	6	40784	40789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009446	A	6	6	40814	40819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009446	ATG	2	6	40829	40834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009446	TAAA	2	8	40856	40863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009446	GC	3	6	41570	41575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009446	AAT	2	6	41591	41596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009446	A	6	6	41622	41627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009446	ATT	2	6	41630	41635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009446	CCGCG	2	10	42469	42478	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_009446	T	6	6	42502	42507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009446	TAA	2	6	42512	42517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009446	GTA	2	6	43400	43405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009446	CAG	2	6	43461	43466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009446	TGCG	2	8	43485	43492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009446	A	6	6	43498	43503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009446	ATG	3	9	43524	43532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009446	A	6	6	46346	46351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009446	TAA	2	6	46818	46823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009446	AAT	2	6	46827	46832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009446	A	6	6	46872	46877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009446	GAT	2	6	46880	46885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009446	AAGA	2	8	46893	46900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009446	ATG	2	6	46938	46943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009446	CAG	2	6	49642	49647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009446	ACC	2	6	49657	49662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009446	T	7	7	50425	50431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009446	AATC	2	8	50436	50443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009446	ACG	2	6	54469	54474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009446	AAT	2	6	54476	54481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009446	GAA	2	6	54497	54502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009446	T	7	7	54512	54518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009446	AAC	2	6	54528	54533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009446	AAC	2	6	54540	54545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009446	A	7	7	56193	56199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009446	AGA	2	6	56221	56226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009446	CTG	2	6	57001	57006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009446	TAT	2	6	57009	57014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009446	TTG	2	6	57020	57025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009446	CAA	2	6	57033	57038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009446	AAT	2	6	57060	57065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009446	CG	3	6	57178	57183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009446	TTTGG	2	10	59818	59827	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009446	T	6	6	59869	59874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009446	TGG	2	6	59991	59996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009446	CAT	2	6	60056	60061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009446	TC	3	6	60075	60080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009446	T	7	7	60082	60088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009446	T	9	9	60105	60113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009446	A	6	6	60170	60175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009446	GC	3	6	60184	60189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009446	AAGA	2	8	60209	60216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009446	TGA	2	6	60217	60222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009446	GAAA	2	8	60402	60409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009446	AAATG	2	10	60484	60493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_009446	GC	3	6	143257	143262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
441	NC_009446	ATA	2	6	143276	143281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_009446	TGA	2	6	145240	145245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_009446	ATA	2	6	146909	146914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_009446	ATA	2	6	147003	147008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_009446	CTTT	2	8	147011	147018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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464	NC_009446	AAT	2	6	154285	154290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_009446	TA	3	6	155530	155535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_009446	AAT	2	6	161255	161260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_009446	ATT	2	6	167183	167188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_009446	T	9	9	173539	173547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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