MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 14095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009253	AT	3	6	3581020	3581025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_009253	TCA	2	6	3581037	3581042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_009253	CAA	2	6	3581048	3581053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_009253	TG	3	6	3581088	3581093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_009253	TTG	2	6	3581099	3581104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_009253	AAC	2	6	3581147	3581152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_009253	AAT	2	6	3581158	3581163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_009253	CCT	2	6	3582490	3582495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_009253	TTA	2	6	3582507	3582512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_009253	T	6	6	3582579	3582584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_009253	TCT	2	6	3582694	3582699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_009253	T	6	6	3582718	3582723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_009253	TTC	2	6	3582745	3582750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_009253	AAATAA	2	12	3582757	3582768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_009253	GTACT	2	10	3582832	3582841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14016	NC_009253	A	7	7	3582843	3582849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_009253	GCC	2	6	3584351	3584356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14018	NC_009253	TAATT	2	10	3584416	3584425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_009253	TGTCC	2	10	3586399	3586408	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14020	NC_009253	CTT	2	6	3587877	3587882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_009253	ATT	2	6	3587909	3587914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_009253	AT	3	6	3587931	3587936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_009253	AAC	2	6	3588003	3588008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_009253	TAA	2	6	3588094	3588099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_009253	T	6	6	3588130	3588135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_009253	AGT	2	6	3588148	3588153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_009253	ACC	2	6	3588175	3588180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14028	NC_009253	TAAA	2	8	3588190	3588197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_009253	A	6	6	3588195	3588200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_009253	ACC	2	6	3588207	3588212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_009253	ATT	2	6	3588671	3588676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_009253	ATA	2	6	3588736	3588741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_009253	AAT	2	6	3588746	3588751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_009253	TAG	2	6	3588802	3588807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_009253	TTC	2	6	3588831	3588836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_009253	T	6	6	3588915	3588920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_009253	CCT	2	6	3589168	3589173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_009253	CCT	2	6	3589960	3589965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_009253	AT	4	8	3590047	3590054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_009253	CT	3	6	3591158	3591163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14041	NC_009253	AT	3	6	3591197	3591202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_009253	TAT	2	6	3592636	3592641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_009253	ATA	2	6	3592657	3592662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_009253	TAAAA	2	10	3593404	3593413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_009253	AATT	2	8	3593433	3593440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_009253	TGT	2	6	3593498	3593503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_009253	C	6	6	3594589	3594594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14048	NC_009253	ATT	2	6	3594608	3594613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_009253	TAAT	2	8	3594717	3594724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_009253	AATA	2	8	3594750	3594757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_009253	AAAT	2	8	3594771	3594778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009253	TAG	2	6	3594780	3594785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_009253	TGA	2	6	3594805	3594810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_009253	TAA	2	6	3595467	3595472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_009253	CTC	2	6	3596116	3596121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14056	NC_009253	T	6	6	3596136	3596141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009253	TACC	2	8	3596662	3596669	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14058	NC_009253	TGA	2	6	3596723	3596728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009253	TAT	2	6	3596754	3596759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_009253	T	7	7	3596766	3596772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_009253	ATA	2	6	3597989	3597994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_009253	ATT	2	6	3597996	3598001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_009253	AGG	2	6	3598041	3598046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_009253	ACC	2	6	3598953	3598958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14065	NC_009253	ATG	2	6	3598996	3599001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_009253	ATC	2	6	3599007	3599012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_009253	TCA	2	6	3599060	3599065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_009253	TAA	2	6	3599069	3599074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_009253	ATCTG	2	10	3599084	3599093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14070	NC_009253	TCC	2	6	3599802	3599807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14071	NC_009253	TAAT	2	8	3599842	3599849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_009253	CAA	2	6	3601576	3601581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_009253	TAAA	2	8	3601601	3601608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_009253	A	6	6	3601654	3601659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_009253	A	6	6	3601707	3601712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_009253	TCTT	2	8	3601714	3601721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14077	NC_009253	TA	3	6	3601727	3601732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_009253	A	6	6	3601735	3601740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_009253	T	6	6	3601778	3601783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_009253	A	6	6	3601785	3601790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_009253	TA	3	6	3601804	3601809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_009253	GTA	2	6	3601844	3601849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_009253	A	7	7	3601857	3601863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_009253	CCT	2	6	3605925	3605930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_009253	CAG	2	6	3605962	3605967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_009253	TAT	2	6	3605987	3605992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_009253	CCT	2	6	3607289	3607294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14088	NC_009253	TAATG	2	10	3607311	3607320	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_009253	AAAT	2	8	3607471	3607478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_009253	A	6	6	3607486	3607491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_009253	TAA	2	6	3607504	3607509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_009253	TTC	2	6	3607864	3607869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_009253	TAA	2	6	3607871	3607876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_009253	T	6	6	3607881	3607886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_009253	CCT	2	6	3608095	3608100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.