MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome

Total Repeats: 14095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009253	TAT	2	6	172	177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009253	TAA	2	6	257	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009253	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009253	TTA	3	9	305	313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009253	T	7	7	319	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009253	AGT	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009253	AAC	2	6	1852	1857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009253	TTA	2	6	1860	1865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009253	CTA	3	9	1866	1874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009253	A	6	6	1879	1884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009253	A	6	6	1890	1895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009253	GA	3	6	3022	3027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009253	T	7	7	4652	4658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009253	A	6	6	4672	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009253	GA	3	6	6737	6742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009253	T	8	8	6754	6761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009253	A	6	6	6768	6773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009253	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009253	CTTAAA	2	12	6793	6804	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009253	A	6	6	6806	6811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009253	TAA	2	6	6901	6906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009253	A	6	6	6912	6917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009253	AT	3	6	6933	6938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009253	AAC	2	6	9510	9515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009253	GTT	2	6	9531	9536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009253	ACAT	2	8	9623	9630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009253	TATT	2	8	9656	9663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009253	TAT	2	6	9680	9685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009253	AAT	2	6	9704	9709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009253	A	6	6	9714	9719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009253	ACA	2	6	9765	9770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009253	TGAG	2	8	9801	9808	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009253	TAAAA	2	10	9817	9826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009253	AAAC	2	8	9854	9861	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009253	CAG	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009253	ATG	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009253	GTCAA	2	10	9902	9911	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009253	ATGA	2	8	9934	9941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009253	A	6	6	9946	9951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009253	TA	3	6	9968	9973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009253	GGC	2	6	10078	10083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009253	CCTG	2	8	10263	10270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009253	GCT	2	6	10297	10302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009253	TGG	2	6	10387	10392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009253	ACC	2	6	10401	10406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009253	CGA	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009253	GCA	2	6	10485	10490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009253	CGC	2	6	10532	10537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009253	GAA	2	6	10544	10549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009253	GAA	2	6	10581	10586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009253	CAG	2	6	10630	10635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009253	GAGC	2	8	10653	10660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009253	GGT	2	6	10695	10700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009253	TGG	2	6	10755	10760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009253	GGA	2	6	10821	10826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009253	GGC	2	6	10841	10846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009253	GAA	2	6	11085	11090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009253	GGT	2	6	11163	11168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009253	GTC	2	6	11177	11182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009253	TCGTG	2	10	11186	11195	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009253	GGA	2	6	11291	11296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009253	ATC	2	6	11315	11320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009253	AC	3	6	11342	11347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009253	TAC	2	6	11349	11354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009253	GAAGC	2	10	11372	11381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009253	AC	3	6	11511	11516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009253	CAC	2	6	11526	11531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009253	ACA	2	6	11540	11545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009253	AGG	2	6	11570	11575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009253	GAT	2	6	11596	11601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009253	CCT	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009253	GGTC	2	8	11693	11700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009253	TCA	3	9	11703	11711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009253	GA	3	6	11726	11731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009253	GGT	2	6	11787	11792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009253	AATA	2	8	11814	11821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009253	AT	3	6	11823	11828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009253	CCA	2	6	11902	11907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009253	AAAC	2	8	11956	11963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009253	AAGA	2	8	12070	12077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009253	GAA	2	6	12113	12118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009253	GAG	2	6	12145	12150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009253	CGG	2	6	12194	12199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009253	AGG	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009253	GGA	2	6	12277	12282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009253	AGAA	2	8	12285	12292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009253	GCG	2	6	12311	12316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009253	TTC	2	6	12345	12350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009253	TCA	2	6	12374	12379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009253	TGC	2	6	12417	12422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009253	G	6	6	12512	12517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009253	ACC	2	6	12518	12523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009253	C	6	6	12522	12527	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_009253	GGGAG	2	10	12593	12602	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009253	A	6	6	12709	12714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009253	AAAGCG	2	12	12846	12857	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_009253	AGG	2	6	12974	12979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009253	AGC	2	6	13290	13295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009253	AAG	2	6	13879	13884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009253	CCG	2	6	13931	13936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009253	ACC	2	6	14040	14045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009253	AGG	2	6	14073	14078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009253	AGGT	2	8	14261	14268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009253	GC	3	6	14286	14291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009253	GA	3	6	14292	14297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009253	CGG	2	6	14543	14548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009253	GACAG	2	10	14689	14698	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009253	ACC	2	6	14814	14819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009253	CTAA	2	8	14837	14844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009253	GGAA	2	8	14945	14952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009253	CAA	2	6	14999	15004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009253	CGG	2	6	15038	15043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009253	CGT	2	6	15234	15239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009253	CGCAGG	2	12	15263	15274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009253	GGAC	2	8	15316	15323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009253	CCT	2	6	15410	15415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009253	GTT	2	6	15490	15495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009253	AGC	2	6	15609	15614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009253	AT	3	6	15707	15712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009253	GA	3	6	15742	15747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009253	TGG	2	6	15847	15852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009253	CAG	2	6	15891	15896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009253	GTC	2	6	15949	15954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009253	GTT	2	6	15996	16001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009253	T	7	7	16000	16006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009253	T	6	6	16051	16056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009253	TG	3	6	16071	16076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009253	A	6	6	16098	16103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009253	TTATA	2	10	16107	16116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009253	ATT	3	9	16138	16146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009253	TA	4	8	16165	16172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009253	TA	4	8	16177	16184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009253	A	6	6	16200	16205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009253	AAT	2	6	17498	17503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009253	GAT	2	6	17506	17511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009253	TAA	3	9	17524	17532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009253	CAT	2	6	17537	17542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009253	ATTG	2	8	17554	17561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009253	ATA	2	6	17562	17567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009253	ATA	2	6	17592	17597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009253	ATATT	2	10	17636	17645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009253	TAT	2	6	17646	17651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009253	TA	3	6	17661	17666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009253	ATA	2	6	17687	17692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009253	AT	3	6	17703	17708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009253	TTA	2	6	17710	17715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009253	ATA	2	6	17746	17751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009253	GTA	2	6	17771	17776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009253	CAAA	2	8	17780	17787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009253	T	6	6	19289	19294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009253	TCTA	2	8	19297	19304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009253	TAA	2	6	19356	19361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009253	GTA	2	6	19400	19405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009253	TAAA	2	8	19430	19437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009253	GTA	2	6	19438	19443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009253	A	6	6	19443	19448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009253	ATTT	2	8	19472	19479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009253	AT	3	6	19492	19497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009253	GGC	2	6	19541	19546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_009253	A	7	7	19887	19893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009253	TAT	2	6	19894	19899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009253	ACAA	2	8	19911	19918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_009253	CATAA	2	10	19937	19946	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_009253	AG	3	6	20001	20006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009253	GGT	2	6	20009	20014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009253	TCC	2	6	20046	20051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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170	NC_009253	CAA	2	6	20164	20169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_009253	ATC	2	6	20213	20218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_009253	T	6	6	20235	20240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009253	C	7	7	20247	20253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
174	NC_009253	T	6	6	20269	20274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009253	A	6	6	23035	23040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009253	TA	3	6	23057	23062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009253	CTAACC	2	12	23066	23077	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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180	NC_009253	GGA	2	6	24581	24586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_009253	AGAT	2	8	24696	24703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009253	A	7	7	24806	24812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009253	AAAT	2	8	25566	25573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009253	AATT	2	8	25586	25593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009253	CTA	2	6	25609	25614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_009253	TA	3	6	25620	25625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009253	TAAG	2	8	25653	25660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009253	AT	3	6	25674	25679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009253	ATC	2	6	25689	25694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_009253	AGG	2	6	25873	25878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
195	NC_009253	GTT	2	6	25913	25918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_009253	TCC	2	6	26020	26025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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271	NC_009253	T	6	6	37610	37615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_009253	ATTATG	2	12	37642	37653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_009253	A	6	6	37673	37678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009253	TGA	2	6	37800	37805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_009253	AT	4	8	37843	37850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_009253	TGT	2	6	37890	37895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_009253	AATTTA	2	12	37904	37915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_009253	CGA	2	6	37920	37925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_009253	T	7	7	37964	37970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_009253	ATT	2	6	37988	37993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009253	ATA	2	6	38018	38023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009253	GGT	2	6	38470	38475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_009253	CAT	2	6	39517	39522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_009253	TAA	2	6	39855	39860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009253	AAT	2	6	39861	39866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009253	T	6	6	40167	40172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009253	GTG	2	6	40244	40249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009253	GAA	2	6	40283	40288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009253	A	6	6	40297	40302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009253	CCTC	2	8	40303	40310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
291	NC_009253	ACTC	2	8	40336	40343	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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