MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_022579	CTGT	2	8	2839260	2839267	0 %	50 %	25 %	25 %	551596312
48003	NC_022579	CAA	2	6	2839378	2839383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596312
48004	NC_022579	CAG	2	6	2839507	2839512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596312
48005	NC_022579	GGCC	2	8	2839528	2839535	0 %	0 %	50 %	50 %	551596312
48006	NC_022579	GACG	2	8	2839565	2839572	25 %	0 %	50 %	25 %	551596312
48007	NC_022579	AGGC	2	8	2839631	2839638	25 %	0 %	50 %	25 %	551596312
48008	NC_022579	ACC	2	6	2839691	2839696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596312
48009	NC_022579	TCA	2	6	2839743	2839748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596312
48010	NC_022579	GCC	2	6	2839775	2839780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596312
48011	NC_022579	A	6	6	2839874	2839879	100 %	0 %	0 %	0 %	551596312
48012	NC_022579	TCAA	2	8	2839885	2839892	50 %	25 %	0 %	25 %	551596312
48013	NC_022579	TCA	2	6	2839896	2839901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596312
48014	NC_022579	GAT	2	6	2839922	2839927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596312
48015	NC_022579	A	6	6	2839952	2839957	100 %	0 %	0 %	0 %	551596312
48016	NC_022579	GCC	2	6	2840031	2840036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596312
48017	NC_022579	ACC	2	6	2840039	2840044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596312
48018	NC_022579	TCC	2	6	2840159	2840164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551596312
48019	NC_022579	TGATTC	2	12	2840241	2840252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	551596312
48020	NC_022579	GGCA	2	8	2840272	2840279	25 %	0 %	50 %	25 %	551596312
48021	NC_022579	TTA	2	6	2840284	2840289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596312
48022	NC_022579	ATC	2	6	2840306	2840311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596312
48023	NC_022579	CCA	2	6	2840316	2840321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596312
48024	NC_022579	AAC	2	6	2840418	2840423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596312
48025	NC_022579	AAAG	2	8	2840449	2840456	75 %	0 %	25 %	0 %	551596312
48026	NC_022579	GGAA	2	8	2840460	2840467	50 %	0 %	50 %	0 %	551596312
48027	NC_022579	T	6	6	2840574	2840579	0 %	100 %	0 %	0 %	551596312
48028	NC_022579	ATTC	2	8	2840590	2840597	25 %	50 %	0 %	25 %	551596312
48029	NC_022579	CTG	2	6	2840679	2840684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596312
48030	NC_022579	AGT	2	6	2840737	2840742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596312
48031	NC_022579	CTT	2	6	2840755	2840760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596312
48032	NC_022579	T	7	7	2840796	2840802	0 %	100 %	0 %	0 %	551596312
48033	NC_022579	CTG	2	6	2840825	2840830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596312
48034	NC_022579	CAA	2	6	2840831	2840836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596312
48035	NC_022579	CCTG	2	8	2840946	2840953	0 %	25 %	25 %	50 %	551596312
48036	NC_022579	TAT	2	6	2840977	2840982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596312
48037	NC_022579	CG	3	6	2841147	2841152	0 %	0 %	50 %	50 %	551596312
48038	NC_022579	GATG	2	8	2841153	2841160	25 %	25 %	50 %	0 %	551596312
48039	NC_022579	CGG	2	6	2841205	2841210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596312
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48041	NC_022579	TG	3	6	2841385	2841390	0 %	50 %	50 %	0 %	551596312
48042	NC_022579	A	6	6	2841428	2841433	100 %	0 %	0 %	0 %	551596312
48043	NC_022579	GCC	2	6	2841633	2841638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596312
48044	NC_022579	ATT	2	6	2841812	2841817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596312
48045	NC_022579	A	6	6	2841866	2841871	100 %	0 %	0 %	0 %	551596312
48046	NC_022579	TTAT	2	8	2842104	2842111	25 %	75 %	0 %	0 %	551596312
48047	NC_022579	GGC	2	6	2842241	2842246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596312
48048	NC_022579	CTG	2	6	2842250	2842255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596312
48049	NC_022579	T	6	6	2842293	2842298	0 %	100 %	0 %	0 %	551596312
48050	NC_022579	TCAG	2	8	2842323	2842330	25 %	25 %	25 %	25 %	551596312
48051	NC_022579	GCTC	2	8	2842414	2842421	0 %	25 %	25 %	50 %	551596312
48052	NC_022579	AGC	2	6	2842495	2842500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596312
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48054	NC_022579	A	7	7	2842679	2842685	100 %	0 %	0 %	0 %	551596312
48055	NC_022579	CAA	2	6	2842796	2842801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596313
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48058	NC_022579	T	6	6	2843003	2843008	0 %	100 %	0 %	0 %	551596313
48059	NC_022579	GGAA	2	8	2843056	2843063	50 %	0 %	50 %	0 %	551596313
48060	NC_022579	CTG	2	6	2843076	2843081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596313
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48064	NC_022579	TGG	2	6	2843214	2843219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596313
48065	NC_022579	CTGCT	2	10	2843232	2843241	0 %	40 %	20 %	40 %	551596313
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48067	NC_022579	CAG	2	6	2843273	2843278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596313
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48071	NC_022579	T	6	6	2843385	2843390	0 %	100 %	0 %	0 %	551596313
48072	NC_022579	ATTT	2	8	2843538	2843545	25 %	75 %	0 %	0 %	551596313
48073	NC_022579	GCTTT	2	10	2843563	2843572	0 %	60 %	20 %	20 %	551596313
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48086	NC_022579	CCG	2	6	2844022	2844027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596313
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48102	NC_022579	T	6	6	2844822	2844827	0 %	100 %	0 %	0 %	551596314
48103	NC_022579	T	6	6	2844833	2844838	0 %	100 %	0 %	0 %	551596314
48104	NC_022579	CTG	2	6	2844951	2844956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596315
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48113	NC_022579	GAAC	2	8	2845320	2845327	50 %	0 %	25 %	25 %	551596315
48114	NC_022579	T	6	6	2845328	2845333	0 %	100 %	0 %	0 %	551596315
48115	NC_022579	GC	3	6	2845474	2845479	0 %	0 %	50 %	50 %	551596315
48116	NC_022579	TCT	2	6	2845540	2845545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596315
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48118	NC_022579	GCCG	2	8	2845595	2845602	0 %	0 %	50 %	50 %	551596315
48119	NC_022579	A	6	6	2845675	2845680	100 %	0 %	0 %	0 %	551596315
48120	NC_022579	TTC	2	6	2845681	2845686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596315
48121	NC_022579	TTC	2	6	2845725	2845730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596315
48122	NC_022579	TGC	2	6	2845741	2845746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596315
48123	NC_022579	CGG	2	6	2845763	2845768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596315
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48132	NC_022579	CG	3	6	2846174	2846179	0 %	0 %	50 %	50 %	551596315
48133	NC_022579	TTC	2	6	2846253	2846258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596315
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48150	NC_022579	A	6	6	2847328	2847333	100 %	0 %	0 %	0 %	551596317
48151	NC_022579	A	6	6	2847340	2847345	100 %	0 %	0 %	0 %	551596317
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48162	NC_022579	A	6	6	2847799	2847804	100 %	0 %	0 %	0 %	551596317
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48217	NC_022579	AGT	2	6	2851308	2851313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596321
48218	NC_022579	ATCC	2	8	2851411	2851418	25 %	25 %	0 %	50 %	551596321
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48220	NC_022579	ATT	2	6	2851480	2851485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596322
48221	NC_022579	TA	3	6	2851526	2851531	50 %	50 %	0 %	0 %	551596322
48222	NC_022579	CTTT	2	8	2851539	2851546	0 %	75 %	0 %	25 %	551596322
48223	NC_022579	CAG	3	9	2851550	2851558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596322
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48225	NC_022579	TAT	2	6	2851703	2851708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596322
48226	NC_022579	TGCC	2	8	2851763	2851770	0 %	25 %	25 %	50 %	551596322
48227	NC_022579	GCT	2	6	2852138	2852143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596323
48228	NC_022579	TCT	2	6	2852236	2852241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596323
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48230	NC_022579	CTT	3	9	2852285	2852293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596323
48231	NC_022579	CAT	2	6	2852319	2852324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596323
48232	NC_022579	TCTG	2	8	2852329	2852336	0 %	50 %	25 %	25 %	551596323
48233	NC_022579	CTG	2	6	2852361	2852366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596323
48234	NC_022579	CAGCA	2	10	2852379	2852388	40 %	0 %	20 %	40 %	551596323
48235	NC_022579	TCAT	2	8	2852410	2852417	25 %	50 %	0 %	25 %	551596323
48236	NC_022579	CTC	2	6	2852478	2852483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551596323
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48243	NC_022579	TTGCC	2	10	2852674	2852683	0 %	40 %	20 %	40 %	551596323
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48265	NC_022579	CATGA	2	10	2853520	2853529	40 %	20 %	20 %	20 %	551596324
48266	NC_022579	AT	3	6	2853533	2853538	50 %	50 %	0 %	0 %	551596324
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48336	NC_022579	ATG	2	6	2858101	2858106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596330
48337	NC_022579	ATA	2	6	2858139	2858144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596330
48338	NC_022579	TG	3	6	2858199	2858204	0 %	50 %	50 %	0 %	551596330
48339	NC_022579	TA	3	6	2858291	2858296	50 %	50 %	0 %	0 %	551596330
48340	NC_022579	T	7	7	2858314	2858320	0 %	100 %	0 %	0 %	551596330
48341	NC_022579	TGG	2	6	2858435	2858440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596330
48342	NC_022579	TCA	2	6	2858500	2858505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596330
48343	NC_022579	AAC	2	6	2858613	2858618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596330
48344	NC_022579	T	6	6	2858640	2858645	0 %	100 %	0 %	0 %	551596330
48345	NC_022579	T	6	6	2858661	2858666	0 %	100 %	0 %	0 %	551596330
48346	NC_022579	ATC	2	6	2858673	2858678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596330
48347	NC_022579	AGC	3	9	2858703	2858711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596330
48348	NC_022579	TGGCA	2	10	2858717	2858726	20 %	20 %	40 %	20 %	551596330
48349	NC_022579	A	6	6	2858760	2858765	100 %	0 %	0 %	0 %	551596330
48350	NC_022579	AAGG	2	8	2858849	2858856	50 %	0 %	50 %	0 %	551596330
48351	NC_022579	AAC	2	6	2858940	2858945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596330
48352	NC_022579	TGA	2	6	2858963	2858968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596330
48353	NC_022579	TTC	2	6	2859001	2859006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596330
48354	NC_022579	TTTA	2	8	2859009	2859016	25 %	75 %	0 %	0 %	551596330
48355	NC_022579	TCC	2	6	2859030	2859035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551596330
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48364	NC_022579	TCA	2	6	2859554	2859559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596330
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48372	NC_022579	ACA	2	6	2860401	2860406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596332
48373	NC_022579	TG	3	6	2860412	2860417	0 %	50 %	50 %	0 %	551596332
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48379	NC_022579	A	6	6	2860793	2860798	100 %	0 %	0 %	0 %	551596332
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48463	NC_022579	AAG	2	6	2866049	2866054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596338
48464	NC_022579	GACA	2	8	2866172	2866179	50 %	0 %	25 %	25 %	551596338
48465	NC_022579	A	6	6	2866192	2866197	100 %	0 %	0 %	0 %	551596338
48466	NC_022579	GGC	2	6	2866213	2866218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596338
48467	NC_022579	GCA	3	9	2866241	2866249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596338
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48469	NC_022579	GAA	2	6	2866315	2866320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596338
48470	NC_022579	TCA	2	6	2866379	2866384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596338
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48491	NC_022579	TTCT	2	8	2867509	2867516	0 %	75 %	0 %	25 %	551596339
48492	NC_022579	TGC	2	6	2867551	2867556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596339
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48499	NC_022579	A	7	7	2868242	2868248	100 %	0 %	0 %	0 %	551596340
48500	NC_022579	GAA	2	6	2868258	2868263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596340

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