MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_022579	CCA	2	6	2629240	2629245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596104
44503	NC_022579	TTC	2	6	2629249	2629254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596104
44504	NC_022579	CTT	2	6	2629293	2629298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596104
44505	NC_022579	T	6	6	2629510	2629515	0 %	100 %	0 %	0 %	551596104
44506	NC_022579	CAT	2	6	2629826	2629831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596105
44507	NC_022579	T	6	6	2629848	2629853	0 %	100 %	0 %	0 %	551596105
44508	NC_022579	AGC	2	6	2629887	2629892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596105
44509	NC_022579	TCG	2	6	2629897	2629902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596105
44510	NC_022579	ATC	2	6	2629944	2629949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596105
44511	NC_022579	CAG	2	6	2629970	2629975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596105
44512	NC_022579	AAG	2	6	2630038	2630043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596105
44513	NC_022579	GAA	2	6	2630067	2630072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596105
44514	NC_022579	AGAC	2	8	2630088	2630095	50 %	0 %	25 %	25 %	551596105
44515	NC_022579	CTG	2	6	2630115	2630120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596105
44516	NC_022579	ACC	2	6	2630154	2630159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596105
44517	NC_022579	AGT	2	6	2630162	2630167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596105
44518	NC_022579	TTG	2	6	2630188	2630193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596105
44519	NC_022579	CAG	2	6	2630256	2630261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596105
44520	NC_022579	AAG	2	6	2630408	2630413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596105
44521	NC_022579	CCA	2	6	2630421	2630426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596105
44522	NC_022579	TTG	2	6	2630440	2630445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596105
44523	NC_022579	AGC	2	6	2630565	2630570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596105
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44525	NC_022579	CAA	2	6	2630702	2630707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596105
44526	NC_022579	AGC	2	6	2630751	2630756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596105
44527	NC_022579	CAGG	2	8	2630759	2630766	25 %	0 %	50 %	25 %	551596105
44528	NC_022579	AGA	2	6	2630856	2630861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596105
44529	NC_022579	GGA	2	6	2630865	2630870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551596105
44530	NC_022579	GTCAGA	2	12	2630874	2630885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	551596105
44531	NC_022579	GAAAC	2	10	2630946	2630955	60 %	0 %	20 %	20 %	551596105
44532	NC_022579	GTT	2	6	2631003	2631008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596105
44533	NC_022579	CAGA	2	8	2631014	2631021	50 %	0 %	25 %	25 %	551596105
44534	NC_022579	TGT	2	6	2631029	2631034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596105
44535	NC_022579	CTGGAA	2	12	2631048	2631059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	551596105
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44537	NC_022579	GT	3	6	2631495	2631500	0 %	50 %	50 %	0 %	551596106
44538	NC_022579	TAT	2	6	2631526	2631531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596106
44539	NC_022579	AT	3	6	2631530	2631535	50 %	50 %	0 %	0 %	551596106
44540	NC_022579	AATT	2	8	2631628	2631635	50 %	50 %	0 %	0 %	551596106
44541	NC_022579	AAG	2	6	2631666	2631671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596106
44542	NC_022579	A	6	6	2631698	2631703	100 %	0 %	0 %	0 %	551596106
44543	NC_022579	ACA	2	6	2631717	2631722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596106
44544	NC_022579	GAT	2	6	2631734	2631739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596106
44545	NC_022579	T	6	6	2631851	2631856	0 %	100 %	0 %	0 %	551596106
44546	NC_022579	GC	3	6	2631857	2631862	0 %	0 %	50 %	50 %	551596106
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44549	NC_022579	TGAA	2	8	2632182	2632189	50 %	25 %	25 %	0 %	551596106
44550	NC_022579	CTT	2	6	2632247	2632252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596106
44551	NC_022579	A	8	8	2632280	2632287	100 %	0 %	0 %	0 %	551596106
44552	NC_022579	GAA	2	6	2632313	2632318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596106
44553	NC_022579	GCT	2	6	2632384	2632389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596106
44554	NC_022579	GAAGA	2	10	2632481	2632490	60 %	0 %	40 %	0 %	551596106
44555	NC_022579	A	6	6	2632510	2632515	100 %	0 %	0 %	0 %	551596106
44556	NC_022579	AGAAA	2	10	2632534	2632543	80 %	0 %	20 %	0 %	551596106
44557	NC_022579	ATA	2	6	2632548	2632553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596106
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44562	NC_022579	GATT	2	8	2632771	2632778	25 %	50 %	25 %	0 %	551596106
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44565	NC_022579	CGGA	2	8	2632954	2632961	25 %	0 %	50 %	25 %	551596106
44566	NC_022579	ATC	2	6	2632965	2632970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596106
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44589	NC_022579	GGA	2	6	2634170	2634175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551596108
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44598	NC_022579	T	7	7	2634655	2634661	0 %	100 %	0 %	0 %	551596108
44599	NC_022579	GAT	2	6	2634992	2634997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596109
44600	NC_022579	CTT	2	6	2634999	2635004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596109
44601	NC_022579	GGC	3	9	2635005	2635013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596109
44602	NC_022579	TTG	2	6	2635066	2635071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596109
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44604	NC_022579	ACC	2	6	2635269	2635274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596109
44605	NC_022579	AGA	2	6	2635364	2635369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596109
44606	NC_022579	TGC	2	6	2635376	2635381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596109
44607	NC_022579	TGA	2	6	2635420	2635425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596109
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44609	NC_022579	ATT	2	6	2635474	2635479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596109
44610	NC_022579	CGG	2	6	2635499	2635504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596109
44611	NC_022579	TTG	2	6	2635540	2635545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596109
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44614	NC_022579	TGAC	2	8	2635666	2635673	25 %	25 %	25 %	25 %	551596109
44615	NC_022579	GGCG	2	8	2635725	2635732	0 %	0 %	75 %	25 %	551596109
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44735	NC_022579	TGC	2	6	2643997	2644002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596118
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44844	NC_022579	AG	3	6	2649569	2649574	50 %	0 %	50 %	0 %	551596126
44845	NC_022579	T	6	6	2649645	2649650	0 %	100 %	0 %	0 %	551596126
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44851	NC_022579	GAT	2	6	2649886	2649891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596126
44852	NC_022579	CAT	2	6	2649990	2649995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596126
44853	NC_022579	T	6	6	2650015	2650020	0 %	100 %	0 %	0 %	551596126
44854	NC_022579	TTC	2	6	2650033	2650038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596126
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44886	NC_022579	A	6	6	2652456	2652461	100 %	0 %	0 %	0 %	551596128
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44953	NC_022579	TCT	2	6	2656487	2656492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596131
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44955	NC_022579	CAC	2	6	2656520	2656525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596131
44956	NC_022579	TGT	2	6	2656610	2656615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596131
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44962	NC_022579	TGA	2	6	2657065	2657070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596132
44963	NC_022579	CTG	2	6	2657131	2657136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596132
44964	NC_022579	AGC	2	6	2657274	2657279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596132
44965	NC_022579	CAG	2	6	2657300	2657305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596132
44966	NC_022579	GCACT	2	10	2657341	2657350	20 %	20 %	20 %	40 %	551596132
44967	NC_022579	CGC	2	6	2657359	2657364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596132
44968	NC_022579	CGA	2	6	2657389	2657394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596132
44969	NC_022579	GAT	2	6	2657516	2657521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596132
44970	NC_022579	CCG	2	6	2657599	2657604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596132
44971	NC_022579	CCG	2	6	2657721	2657726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596132
44972	NC_022579	CAGG	2	8	2657777	2657784	25 %	0 %	50 %	25 %	551596132
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44974	NC_022579	TGA	2	6	2657884	2657889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596132
44975	NC_022579	GC	3	6	2657920	2657925	0 %	0 %	50 %	50 %	551596132
44976	NC_022579	TCT	2	6	2658006	2658011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596132
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44978	NC_022579	GTG	2	6	2658234	2658239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596132
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44981	NC_022579	TAATTT	2	12	2658363	2658374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596133
44982	NC_022579	ATC	2	6	2658386	2658391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596133
44983	NC_022579	GATGTT	2	12	2658394	2658405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	551596133
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44985	NC_022579	CTT	2	6	2658507	2658512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596133
44986	NC_022579	TCA	2	6	2658689	2658694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596133
44987	NC_022579	AGT	2	6	2658752	2658757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596133
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44990	NC_022579	CAG	2	6	2659014	2659019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596133
44991	NC_022579	CGG	2	6	2659032	2659037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596133
44992	NC_022579	TCC	2	6	2659048	2659053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551596133
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44995	NC_022579	AGC	2	6	2659250	2659255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596133
44996	NC_022579	GAGT	2	8	2659297	2659304	25 %	25 %	50 %	0 %	551596133
44997	NC_022579	CATT	2	8	2659334	2659341	25 %	50 %	0 %	25 %	551596133
44998	NC_022579	AGAA	2	8	2659381	2659388	75 %	0 %	25 %	0 %	551596133
44999	NC_022579	GAGG	2	8	2659581	2659588	25 %	0 %	75 %	0 %	551596134
45000	NC_022579	TCAAT	2	10	2659607	2659616	40 %	40 %	0 %	20 %	551596134

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