MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

< Previous12...8384858687888990919293...125126Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_022579	TCT	2	6	2570891	2570896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596053
43502	NC_022579	CAT	2	6	2570904	2570909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596053
43503	NC_022579	CATTTT	2	12	2570970	2570981	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	551596053
43504	NC_022579	T	7	7	2570996	2571002	0 %	100 %	0 %	0 %	551596053
43505	NC_022579	AAATAT	2	12	2571006	2571017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596053
43506	NC_022579	GCC	2	6	2571048	2571053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596053
43507	NC_022579	AGTCGT	2	12	2571111	2571122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	551596053
43508	NC_022579	CCG	2	6	2571144	2571149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596053
43509	NC_022579	AAT	2	6	2571157	2571162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596053
43510	NC_022579	TTC	2	6	2571173	2571178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596053
43511	NC_022579	GTC	2	6	2571261	2571266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596053
43512	NC_022579	CGGAC	2	10	2571276	2571285	20 %	0 %	40 %	40 %	551596053
43513	NC_022579	CAG	2	6	2571286	2571291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596053
43514	NC_022579	AAC	2	6	2571309	2571314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596053
43515	NC_022579	GTG	2	6	2571445	2571450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596053
43516	NC_022579	ATTC	2	8	2571510	2571517	25 %	50 %	0 %	25 %	551596053
43517	NC_022579	TAG	2	6	2571564	2571569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596053
43518	NC_022579	T	7	7	2571576	2571582	0 %	100 %	0 %	0 %	551596053
43519	NC_022579	TCC	2	6	2571623	2571628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551596053
43520	NC_022579	TCA	2	6	2571662	2571667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596053
43521	NC_022579	T	7	7	2571725	2571731	0 %	100 %	0 %	0 %	551596053
43522	NC_022579	GGC	2	6	2571773	2571778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596053
43523	NC_022579	TGG	2	6	2571780	2571785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596053
43524	NC_022579	TGCC	2	8	2571816	2571823	0 %	25 %	25 %	50 %	551596053
43525	NC_022579	GTC	2	6	2571868	2571873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596053
43526	NC_022579	GATCA	2	10	2571886	2571895	40 %	20 %	20 %	20 %	551596053
43527	NC_022579	T	6	6	2572004	2572009	0 %	100 %	0 %	0 %	551596053
43528	NC_022579	ATT	2	6	2572018	2572023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596053
43529	NC_022579	ACCA	2	8	2572029	2572036	50 %	0 %	0 %	50 %	551596053
43530	NC_022579	TAT	2	6	2572080	2572085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596053
43531	NC_022579	GTT	2	6	2572147	2572152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596053
43532	NC_022579	CGC	2	6	2572182	2572187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596053
43533	NC_022579	TTC	2	6	2572207	2572212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596053
43534	NC_022579	GTAA	2	8	2572282	2572289	50 %	25 %	25 %	0 %	551596053
43535	NC_022579	GC	3	6	2572302	2572307	0 %	0 %	50 %	50 %	551596053
43536	NC_022579	A	6	6	2572382	2572387	100 %	0 %	0 %	0 %	551596053
43537	NC_022579	GAC	2	6	2572488	2572493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596053
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43539	NC_022579	AAT	3	9	2572683	2572691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596053
43540	NC_022579	TAT	2	6	2572737	2572742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596053
43541	NC_022579	ATT	2	6	2572852	2572857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596053
43542	NC_022579	TCA	2	6	2572871	2572876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596053
43543	NC_022579	GTA	2	6	2572955	2572960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596053
43544	NC_022579	TGA	2	6	2572976	2572981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596053
43545	NC_022579	GGCT	2	8	2573115	2573122	0 %	25 %	50 %	25 %	551596053
43546	NC_022579	CTT	2	6	2573143	2573148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596053
43547	NC_022579	T	6	6	2573216	2573221	0 %	100 %	0 %	0 %	551596053
43548	NC_022579	ATTT	2	8	2573223	2573230	25 %	75 %	0 %	0 %	551596053
43549	NC_022579	CAT	2	6	2573256	2573261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596053
43550	NC_022579	GCA	2	6	2573270	2573275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596053
43551	NC_022579	GAG	2	6	2573284	2573289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551596053
43552	NC_022579	TAT	3	9	2573340	2573348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596053
43553	NC_022579	TTG	2	6	2573358	2573363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596053
43554	NC_022579	CAA	2	6	2573400	2573405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596053
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43556	NC_022579	ATT	2	6	2573567	2573572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596053
43557	NC_022579	T	6	6	2573594	2573599	0 %	100 %	0 %	0 %	551596053
43558	NC_022579	CGA	2	6	2573731	2573736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596054
43559	NC_022579	C	6	6	2573817	2573822	0 %	0 %	0 %	100 %	551596054
43560	NC_022579	CGA	2	6	2573824	2573829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596054
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43565	NC_022579	AAT	2	6	2574139	2574144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596054
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43567	NC_022579	AG	3	6	2574233	2574238	50 %	0 %	50 %	0 %	551596054
43568	NC_022579	AT	3	6	2574253	2574258	50 %	50 %	0 %	0 %	551596054
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43573	NC_022579	GATT	2	8	2574564	2574571	25 %	50 %	25 %	0 %	551596054
43574	NC_022579	TAATT	2	10	2574610	2574619	40 %	60 %	0 %	0 %	551596054
43575	NC_022579	T	8	8	2574623	2574630	0 %	100 %	0 %	0 %	551596054
43576	NC_022579	TCAT	2	8	2574635	2574642	25 %	50 %	0 %	25 %	551596054
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43585	NC_022579	T	7	7	2576800	2576806	0 %	100 %	0 %	0 %	551596056
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43590	NC_022579	TATG	2	8	2576977	2576984	25 %	50 %	25 %	0 %	551596056
43591	NC_022579	T	7	7	2577313	2577319	0 %	100 %	0 %	0 %	551596057
43592	NC_022579	TTA	2	6	2577322	2577327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596057
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43597	NC_022579	TGC	2	6	2577559	2577564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596057
43598	NC_022579	GTC	2	6	2577599	2577604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596057
43599	NC_022579	ATT	2	6	2577621	2577626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596057
43600	NC_022579	A	6	6	2577715	2577720	100 %	0 %	0 %	0 %	551596057
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43602	NC_022579	CTT	2	6	2577783	2577788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596057
43603	NC_022579	A	7	7	2577816	2577822	100 %	0 %	0 %	0 %	551596057
43604	NC_022579	GAAA	2	8	2577848	2577855	75 %	0 %	25 %	0 %	551596057
43605	NC_022579	ATA	2	6	2577880	2577885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596057
43606	NC_022579	TC	3	6	2577886	2577891	0 %	50 %	0 %	50 %	551596057
43607	NC_022579	T	6	6	2577952	2577957	0 %	100 %	0 %	0 %	551596057
43608	NC_022579	T	7	7	2578008	2578014	0 %	100 %	0 %	0 %	551596057
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43612	NC_022579	TGA	2	6	2578111	2578116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596057
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43614	NC_022579	TTTTA	2	10	2578161	2578170	20 %	80 %	0 %	0 %	551596057
43615	NC_022579	TAT	2	6	2578232	2578237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596057
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43617	NC_022579	ATT	2	6	2578379	2578384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596057
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43736	NC_022579	GGA	2	6	2584354	2584359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551596063
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