MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022579	ATCTC	2	10	356905	356914	20 %	40 %	0 %	40 %	551593977
6002	NC_022579	AG	3	6	357006	357011	50 %	0 %	50 %	0 %	551593978
6003	NC_022579	GCG	2	6	357064	357069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593978
6004	NC_022579	GCA	2	6	357188	357193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593978
6005	NC_022579	AAAC	2	8	357233	357240	75 %	0 %	0 %	25 %	551593978
6006	NC_022579	GTAAT	2	10	357304	357313	40 %	40 %	20 %	0 %	551593978
6007	NC_022579	GCCA	2	8	357319	357326	25 %	0 %	25 %	50 %	551593978
6008	NC_022579	GTA	2	6	357351	357356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593978
6009	NC_022579	ATA	2	6	357433	357438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593978
6010	NC_022579	TTC	2	6	357449	357454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593979
6011	NC_022579	AAT	2	6	357486	357491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593979
6012	NC_022579	TCA	2	6	357563	357568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593979
6013	NC_022579	TTCA	2	8	357625	357632	25 %	50 %	0 %	25 %	551593979
6014	NC_022579	CAA	2	6	357738	357743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593979
6015	NC_022579	GCAG	3	12	357793	357804	25 %	0 %	50 %	25 %	551593979
6016	NC_022579	AGC	2	6	357828	357833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593979
6017	NC_022579	AGAC	2	8	357956	357963	50 %	0 %	25 %	25 %	551593979
6018	NC_022579	TTC	2	6	357989	357994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593979
6019	NC_022579	GCC	2	6	358001	358006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593979
6020	NC_022579	GCG	2	6	358057	358062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593979
6021	NC_022579	TCA	2	6	358145	358150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593979
6022	NC_022579	CCTG	2	8	358155	358162	0 %	25 %	25 %	50 %	551593979
6023	NC_022579	CA	3	6	358264	358269	50 %	0 %	0 %	50 %	551593979
6024	NC_022579	TGC	2	6	358320	358325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593979
6025	NC_022579	A	6	6	358394	358399	100 %	0 %	0 %	0 %	551593979
6026	NC_022579	C	6	6	358842	358847	0 %	0 %	0 %	100 %	551593980
6027	NC_022579	AAC	2	6	358879	358884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593980
6028	NC_022579	CGC	2	6	358890	358895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593980
6029	NC_022579	A	7	7	359127	359133	100 %	0 %	0 %	0 %	551593981
6030	NC_022579	ACG	2	6	359149	359154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593981
6031	NC_022579	TCA	2	6	359176	359181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593981
6032	NC_022579	GCA	2	6	359352	359357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593981
6033	NC_022579	AGA	2	6	359414	359419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593981
6034	NC_022579	GAA	2	6	359451	359456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593981
6035	NC_022579	TCAT	2	8	359458	359465	25 %	50 %	0 %	25 %	551593981
6036	NC_022579	CAG	2	6	359530	359535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593981
6037	NC_022579	CAA	2	6	359579	359584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593981
6038	NC_022579	ATG	2	6	359724	359729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593981
6039	NC_022579	CCG	2	6	359757	359762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593981
6040	NC_022579	TGCA	2	8	359800	359807	25 %	25 %	25 %	25 %	551593981
6041	NC_022579	TCCACA	2	12	359826	359837	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	551593981
6042	NC_022579	ATC	2	6	359882	359887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593981
6043	NC_022579	CT	3	6	359899	359904	0 %	50 %	0 %	50 %	551593981
6044	NC_022579	GGA	2	6	359919	359924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593981
6045	NC_022579	A	6	6	359960	359965	100 %	0 %	0 %	0 %	551593981
6046	NC_022579	TGA	2	6	359981	359986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593981
6047	NC_022579	AGAA	2	8	360007	360014	75 %	0 %	25 %	0 %	551593981
6048	NC_022579	A	6	6	360078	360083	100 %	0 %	0 %	0 %	551593981
6049	NC_022579	GCT	2	6	360122	360127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593981
6050	NC_022579	GAA	2	6	360147	360152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593981
6051	NC_022579	ACT	2	6	360169	360174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593981
6052	NC_022579	GAA	2	6	360277	360282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593981
6053	NC_022579	CAGA	2	8	360347	360354	50 %	0 %	25 %	25 %	551593981
6054	NC_022579	TTAT	2	8	360864	360871	25 %	75 %	0 %	0 %	551593982
6055	NC_022579	TAG	2	6	360878	360883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593982
6056	NC_022579	TAA	2	6	360974	360979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593982
6057	NC_022579	TGC	2	6	361026	361031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593982
6058	NC_022579	TGT	2	6	361041	361046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593982
6059	NC_022579	CAC	2	6	361124	361129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593982
6060	NC_022579	CAA	2	6	361310	361315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593982
6061	NC_022579	AGAT	2	8	361439	361446	50 %	25 %	25 %	0 %	551593982
6062	NC_022579	GTG	2	6	361492	361497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593982
6063	NC_022579	AAC	2	6	361550	361555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593982
6064	NC_022579	AAGC	2	8	361591	361598	50 %	0 %	25 %	25 %	551593982
6065	NC_022579	GCC	2	6	361612	361617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593982
6066	NC_022579	GCCA	2	8	361626	361633	25 %	0 %	25 %	50 %	551593982
6067	NC_022579	GTT	2	6	361678	361683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593982
6068	NC_022579	GAA	2	6	361696	361701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593982
6069	NC_022579	AAG	2	6	361746	361751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593982
6070	NC_022579	ACC	2	6	361830	361835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593982
6071	NC_022579	AGC	2	6	361849	361854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593982
6072	NC_022579	ACA	2	6	362095	362100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593982
6073	NC_022579	GTT	2	6	362101	362106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593982
6074	NC_022579	TGGT	2	8	362113	362120	0 %	50 %	50 %	0 %	551593982
6075	NC_022579	CTA	2	6	362177	362182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593982
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6078	NC_022579	CTT	2	6	362346	362351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593982
6079	NC_022579	GCA	3	9	362548	362556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593983
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6081	NC_022579	GAA	2	6	362642	362647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593983
6082	NC_022579	CTGA	2	8	362672	362679	25 %	25 %	25 %	25 %	551593983
6083	NC_022579	ATTC	2	8	362680	362687	25 %	50 %	0 %	25 %	551593983
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6085	NC_022579	ACC	2	6	362867	362872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593983
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6087	NC_022579	GC	3	6	362962	362967	0 %	0 %	50 %	50 %	551593983
6088	NC_022579	CCCCA	2	10	363012	363021	20 %	0 %	0 %	80 %	551593983
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6090	NC_022579	CAA	2	6	363079	363084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593983
6091	NC_022579	ACA	2	6	363282	363287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593984
6092	NC_022579	A	6	6	363361	363366	100 %	0 %	0 %	0 %	551593984
6093	NC_022579	GCC	2	6	363408	363413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593985
6094	NC_022579	CGG	2	6	363427	363432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593985
6095	NC_022579	ACT	2	6	363456	363461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593985
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6099	NC_022579	TA	3	6	363585	363590	50 %	50 %	0 %	0 %	551593986
6100	NC_022579	CAG	2	6	363667	363672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593986
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6102	NC_022579	CATG	2	8	363883	363890	25 %	25 %	25 %	25 %	551593986
6103	NC_022579	GCC	2	6	363965	363970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593986
6104	NC_022579	CAG	2	6	364043	364048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593986
6105	NC_022579	TGC	2	6	364108	364113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593986
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6107	NC_022579	TCT	2	6	364218	364223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593986
6108	NC_022579	AC	3	6	364244	364249	50 %	0 %	0 %	50 %	551593986
6109	NC_022579	GTT	2	6	364269	364274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593986
6110	NC_022579	ACA	2	6	364278	364283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593986
6111	NC_022579	CAT	2	6	364321	364326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593986
6112	NC_022579	ATA	2	6	364341	364346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593986
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6114	NC_022579	CAT	2	6	364444	364449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593986
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