MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_022579	GGCATA	2	12	3603444	3603455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	551597046
61002	NC_022579	AGC	2	6	3603613	3603618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597047
61003	NC_022579	CCA	2	6	3603647	3603652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551597047
61004	NC_022579	GAAA	2	8	3603832	3603839	75 %	0 %	25 %	0 %	551597047
61005	NC_022579	A	6	6	3603847	3603852	100 %	0 %	0 %	0 %	551597047
61006	NC_022579	T	6	6	3603855	3603860	0 %	100 %	0 %	0 %	551597047
61007	NC_022579	AATAGC	2	12	3603921	3603932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	551597047
61008	NC_022579	GCAATA	2	12	3603937	3603948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	551597047
61009	NC_022579	GCC	2	6	3604024	3604029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551597047
61010	NC_022579	CTT	3	9	3604050	3604058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551597047
61011	NC_022579	GGAT	2	8	3604098	3604105	25 %	25 %	50 %	0 %	551597047
61012	NC_022579	CCG	2	6	3604222	3604227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551597047
61013	NC_022579	CTG	2	6	3604337	3604342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551597047
61014	NC_022579	GAAA	2	8	3604360	3604367	75 %	0 %	25 %	0 %	551597047
61015	NC_022579	A	7	7	3604389	3604395	100 %	0 %	0 %	0 %	551597047
61016	NC_022579	C	6	6	3604515	3604520	0 %	0 %	0 %	100 %	551597048
61017	NC_022579	GCA	2	6	3604706	3604711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597048
61018	NC_022579	A	6	6	3604748	3604753	100 %	0 %	0 %	0 %	551597048
61019	NC_022579	GCA	2	6	3604874	3604879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597048
61020	NC_022579	CGC	2	6	3605031	3605036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551597048
61021	NC_022579	AG	3	6	3605096	3605101	50 %	0 %	50 %	0 %	551597048
61022	NC_022579	C	6	6	3605132	3605137	0 %	0 %	0 %	100 %	551597048
61023	NC_022579	A	6	6	3605154	3605159	100 %	0 %	0 %	0 %	551597048
61024	NC_022579	ATA	2	6	3605162	3605167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551597048
61025	NC_022579	AGC	2	6	3605178	3605183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597048
61026	NC_022579	TGT	2	6	3605207	3605212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551597048
61027	NC_022579	CAA	2	6	3605246	3605251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551597048
61028	NC_022579	AAAAT	2	10	3605264	3605273	80 %	20 %	0 %	0 %	551597048
61029	NC_022579	AAT	2	6	3605316	3605321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551597049
61030	NC_022579	CCG	2	6	3605430	3605435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551597049
61031	NC_022579	GCA	2	6	3605464	3605469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597049
61032	NC_022579	TGT	2	6	3605636	3605641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551597049
61033	NC_022579	CT	3	6	3605648	3605653	0 %	50 %	0 %	50 %	551597049
61034	NC_022579	CAG	2	6	3605686	3605691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597049
61035	NC_022579	TCCAG	2	10	3605727	3605736	20 %	20 %	20 %	40 %	551597049
61036	NC_022579	C	6	6	3605971	3605976	0 %	0 %	0 %	100 %	551597049
61037	NC_022579	AAC	2	6	3606086	3606091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551597049
61038	NC_022579	AGAA	2	8	3606163	3606170	75 %	0 %	25 %	0 %	551597049
61039	NC_022579	AGC	2	6	3606207	3606212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597049
61040	NC_022579	GCAG	2	8	3606255	3606262	25 %	0 %	50 %	25 %	551597049
61041	NC_022579	GAAAA	2	10	3606362	3606371	80 %	0 %	20 %	0 %	551597049
61042	NC_022579	A	8	8	3606485	3606492	100 %	0 %	0 %	0 %	551597049
61043	NC_022579	GAA	2	6	3606517	3606522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551597049
61044	NC_022579	CAA	2	6	3606685	3606690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551597049
61045	NC_022579	TCA	2	6	3606694	3606699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551597049
61046	NC_022579	AACA	2	8	3606725	3606732	75 %	0 %	0 %	25 %	551597049
61047	NC_022579	ACA	2	6	3606736	3606741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551597049
61048	NC_022579	CTC	2	6	3606776	3606781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551597049
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61050	NC_022579	CCA	2	6	3606889	3606894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551597049
61051	NC_022579	ACC	2	6	3606921	3606926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551597049
61052	NC_022579	AAAG	2	8	3606963	3606970	75 %	0 %	25 %	0 %	551597049
61053	NC_022579	AGC	2	6	3607110	3607115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597049
61054	NC_022579	CCG	2	6	3607173	3607178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551597049
61055	NC_022579	CGA	2	6	3607189	3607194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597049
61056	NC_022579	AAT	2	6	3607205	3607210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551597049
61057	NC_022579	AT	3	6	3607209	3607214	50 %	50 %	0 %	0 %	551597049
61058	NC_022579	AGA	2	6	3607221	3607226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551597049
61059	NC_022579	GCA	2	6	3607234	3607239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597049
61060	NC_022579	A	6	6	3607247	3607252	100 %	0 %	0 %	0 %	551597049
61061	NC_022579	AAAC	2	8	3607306	3607313	75 %	0 %	0 %	25 %	551597049
61062	NC_022579	T	6	6	3607330	3607335	0 %	100 %	0 %	0 %	551597050
61063	NC_022579	CTC	2	6	3607409	3607414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551597050
61064	NC_022579	GCA	2	6	3607554	3607559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597050
61065	NC_022579	CTT	2	6	3607648	3607653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551597050
61066	NC_022579	ATC	2	6	3607661	3607666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551597050
61067	NC_022579	AG	3	6	3607925	3607930	50 %	0 %	50 %	0 %	551597051
61068	NC_022579	CTG	2	6	3607934	3607939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551597051
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61070	NC_022579	TGC	2	6	3607982	3607987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551597051
61071	NC_022579	CCTGA	2	10	3608008	3608017	20 %	20 %	20 %	40 %	551597051
61072	NC_022579	TGC	2	6	3608119	3608124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551597051
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61075	NC_022579	TGGTC	2	10	3608295	3608304	0 %	40 %	40 %	20 %	551597051
61076	NC_022579	GCT	2	6	3608361	3608366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551597051
61077	NC_022579	ATC	2	6	3608383	3608388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551597051
61078	NC_022579	CGAA	2	8	3608395	3608402	50 %	0 %	25 %	25 %	551597051
61079	NC_022579	CTG	2	6	3608425	3608430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551597051
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61082	NC_022579	GATTG	2	10	3608586	3608595	20 %	40 %	40 %	0 %	551597051
61083	NC_022579	AGC	2	6	3608662	3608667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551597051
61084	NC_022579	ATT	2	6	3608680	3608685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551597051
61085	NC_022579	CCAT	2	8	3608762	3608769	25 %	25 %	0 %	50 %	551597051
61086	NC_022579	GCTT	3	12	3608840	3608851	0 %	50 %	25 %	25 %	551597051
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61089	NC_022579	GCACG	2	10	3609019	3609028	20 %	0 %	40 %	40 %	551597051
61090	NC_022579	CTC	2	6	3609076	3609081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551597051
61091	NC_022579	CAA	2	6	3609274	3609279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551597051
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61098	NC_022579	T	6	6	3609475	3609480	0 %	100 %	0 %	0 %	551597051
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61102	NC_022579	CAA	2	6	3609795	3609800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551597051
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61108	NC_022579	CCAC	2	8	3610053	3610060	25 %	0 %	0 %	75 %	551597051
61109	NC_022579	AAT	2	6	3610102	3610107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551597051
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61114	NC_022579	TGA	2	6	3610679	3610684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551597052
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61349	NC_022579	TCA	2	6	3622961	3622966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551597063
61350	NC_022579	GTAG	2	8	3623053	3623060	25 %	25 %	50 %	0 %	551597064
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61459	NC_022579	AAAAT	2	10	3630334	3630343	80 %	20 %	0 %	0 %	551597072
61460	NC_022579	A	6	6	3630381	3630386	100 %	0 %	0 %	0 %	551597072
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