MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54003	NC_022579	TGC	2	6	3192828	3192833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596648
54004	NC_022579	GGC	2	6	3192946	3192951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551596648
54005	NC_022579	AGG	2	6	3193017	3193022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551596648
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54008	NC_022579	TGA	2	6	3193131	3193136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596648
54009	NC_022579	T	6	6	3193175	3193180	0 %	100 %	0 %	0 %	551596648
54010	NC_022579	TTC	2	6	3193223	3193228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596648
54011	NC_022579	TTGC	2	8	3193271	3193278	0 %	50 %	25 %	25 %	551596648
54012	NC_022579	GGT	2	6	3193319	3193324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596648
54013	NC_022579	GTA	2	6	3193364	3193369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596648
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54015	NC_022579	GTG	2	6	3193430	3193435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596648
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54019	NC_022579	GTA	2	6	3194207	3194212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596648
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54116	NC_022579	TAA	2	6	3200411	3200416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551596653
54117	NC_022579	GCTG	2	8	3200426	3200433	0 %	25 %	50 %	25 %	551596653
54118	NC_022579	AAGC	2	8	3200444	3200451	50 %	0 %	25 %	25 %	551596653
54119	NC_022579	ATC	2	6	3200463	3200468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596653
54120	NC_022579	GA	3	6	3200572	3200577	50 %	0 %	50 %	0 %	551596653
54121	NC_022579	AC	3	6	3200597	3200602	50 %	0 %	0 %	50 %	551596653
54122	NC_022579	AAC	2	6	3200610	3200615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596653
54123	NC_022579	GCA	2	6	3200627	3200632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596653
54124	NC_022579	GAAG	2	8	3200665	3200672	50 %	0 %	50 %	0 %	551596653
54125	NC_022579	AGCC	2	8	3200703	3200710	25 %	0 %	25 %	50 %	551596653
54126	NC_022579	GAA	3	9	3200840	3200848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596653
54127	NC_022579	ATC	2	6	3200907	3200912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596653
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54129	NC_022579	A	6	6	3200960	3200965	100 %	0 %	0 %	0 %	551596653
54130	NC_022579	TCTGG	2	10	3201042	3201051	0 %	40 %	40 %	20 %	551596653
54131	NC_022579	TGT	2	6	3201083	3201088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551596653
54132	NC_022579	TGG	2	6	3201092	3201097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551596653
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54135	NC_022579	GAA	2	6	3201306	3201311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596653
54136	NC_022579	TGA	2	6	3201371	3201376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551596653
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54140	NC_022579	CAGC	2	8	3201495	3201502	25 %	0 %	25 %	50 %	551596654
54141	NC_022579	ACAA	2	8	3201509	3201516	75 %	0 %	0 %	25 %	551596654
54142	NC_022579	CAA	2	6	3201567	3201572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596654
54143	NC_022579	AG	3	6	3201574	3201579	50 %	0 %	50 %	0 %	551596654
54144	NC_022579	CAG	2	6	3201664	3201669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596654
54145	NC_022579	C	6	6	3201717	3201722	0 %	0 %	0 %	100 %	551596655
54146	NC_022579	AAGC	2	8	3201743	3201750	50 %	0 %	25 %	25 %	551596655
54147	NC_022579	AGCAC	2	10	3201751	3201760	40 %	0 %	20 %	40 %	551596655
54148	NC_022579	TGC	2	6	3201768	3201773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551596655
54149	NC_022579	CAG	2	6	3201774	3201779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596655
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54152	NC_022579	CAG	2	6	3201836	3201841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596655
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54154	NC_022579	CAGAG	2	10	3201930	3201939	40 %	0 %	40 %	20 %	551596655
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54158	NC_022579	ACAG	2	8	3202026	3202033	50 %	0 %	25 %	25 %	551596655
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54189	NC_022579	A	6	6	3203235	3203240	100 %	0 %	0 %	0 %	551596657
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54197	NC_022579	AGC	2	6	3203557	3203562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596657
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54219	NC_022579	TGAAC	2	10	3204775	3204784	40 %	20 %	20 %	20 %	551596658
54220	NC_022579	T	6	6	3204805	3204810	0 %	100 %	0 %	0 %	551596658
54221	NC_022579	CATG	2	8	3204811	3204818	25 %	25 %	25 %	25 %	551596658
54222	NC_022579	TCT	2	6	3204942	3204947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596658
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54230	NC_022579	TAAT	2	8	3205605	3205612	50 %	50 %	0 %	0 %	551596659
54231	NC_022579	CCA	2	6	3205723	3205728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596660
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54233	NC_022579	GGA	2	6	3205790	3205795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551596660
54234	NC_022579	CAA	2	6	3205842	3205847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551596660
54235	NC_022579	CCT	2	6	3205877	3205882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551596660
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54258	NC_022579	A	8	8	3207163	3207170	100 %	0 %	0 %	0 %	551596663
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54334	NC_022579	GACCG	2	10	3212566	3212575	20 %	0 %	40 %	40 %	551596671
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54343	NC_022579	GCA	2	6	3212967	3212972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596671
54344	NC_022579	TGGAC	2	10	3213051	3213060	20 %	20 %	40 %	20 %	551596671
54345	NC_022579	GCC	2	6	3213152	3213157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551596671
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54467	NC_022579	A	6	6	3220120	3220125	100 %	0 %	0 %	0 %	551596675
54468	NC_022579	GTCAAA	2	12	3220168	3220179	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	551596675
54469	NC_022579	A	7	7	3220177	3220183	100 %	0 %	0 %	0 %	551596675
54470	NC_022579	CAT	2	6	3220187	3220192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596675
54471	NC_022579	AGAGA	2	10	3220195	3220204	60 %	0 %	40 %	0 %	551596675
54472	NC_022579	A	6	6	3220207	3220212	100 %	0 %	0 %	0 %	551596675
54473	NC_022579	AT	4	8	3220519	3220526	50 %	50 %	0 %	0 %	551596676
54474	NC_022579	A	6	6	3220534	3220539	100 %	0 %	0 %	0 %	551596676
54475	NC_022579	TTA	2	6	3220564	3220569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551596676
54476	NC_022579	GCA	2	6	3220594	3220599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596676
54477	NC_022579	CCA	2	6	3220630	3220635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551596676
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54479	NC_022579	AGC	2	6	3220683	3220688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551596676
54480	NC_022579	A	7	7	3220699	3220705	100 %	0 %	0 %	0 %	551596676
54481	NC_022579	TTC	2	6	3220730	3220735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551596676
54482	NC_022579	GCTG	2	8	3220755	3220762	0 %	25 %	50 %	25 %	551596676
54483	NC_022579	ATC	2	6	3220764	3220769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551596676
54484	NC_022579	GCTG	2	8	3220817	3220824	0 %	25 %	50 %	25 %	551596676
54485	NC_022579	GAA	2	6	3220834	3220839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551596676
54486	NC_022579	AATG	2	8	3220845	3220852	50 %	25 %	25 %	0 %	551596676
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54492	NC_022579	A	6	6	3221087	3221092	100 %	0 %	0 %	0 %	551596676
54493	NC_022579	ATGT	2	8	3221146	3221153	25 %	50 %	25 %	0 %	551596676
54494	NC_022579	A	6	6	3221180	3221185	100 %	0 %	0 %	0 %	551596676
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