MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 80559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_022444	AAG	2	6	581672	581677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640865
12503	NC_022444	AGC	2	6	581691	581696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640865
12504	NC_022444	CGG	2	6	581744	581749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640866
12505	NC_022444	GCA	2	6	581766	581771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640866
12506	NC_022444	GGC	2	6	581780	581785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640866
12507	NC_022444	G	6	6	581813	581818	0 %	0 %	100 %	0 %	545640866
12508	NC_022444	GCG	2	6	581821	581826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640866
12509	NC_022444	TC	3	6	581846	581851	0 %	50 %	0 %	50 %	545640866
12510	NC_022444	TCGGGC	2	12	581895	581906	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545640866
12511	NC_022444	ACC	2	6	581910	581915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640866
12512	NC_022444	GTG	2	6	581964	581969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640866
12513	NC_022444	TC	3	6	581981	581986	0 %	50 %	0 %	50 %	545640866
12514	NC_022444	CGC	2	6	582086	582091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640866
12515	NC_022444	GGCCGC	2	12	582134	582145	0 %	0 %	50 %	50 %	545640866
12516	NC_022444	CGG	2	6	582200	582205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640866
12517	NC_022444	AAC	3	9	582208	582216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545640866
12518	NC_022444	GCCCCG	2	12	582242	582253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640866
12519	NC_022444	GCT	3	9	582254	582262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640866
12520	NC_022444	CGC	2	6	582290	582295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640866
12521	NC_022444	CTG	2	6	582354	582359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640866
12522	NC_022444	TCA	2	6	582361	582366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640866
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12525	NC_022444	ACG	2	6	582415	582420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640866
12526	NC_022444	CTG	2	6	582426	582431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640866
12527	NC_022444	C	6	6	582451	582456	0 %	0 %	0 %	100 %	545640866
12528	NC_022444	GCA	2	6	582472	582477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640867
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12531	NC_022444	TGGGCG	2	12	582561	582572	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	545640867
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12544	NC_022444	CGT	2	6	583138	583143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640867
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12551	NC_022444	CTG	2	6	583325	583330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640867
12552	NC_022444	GGC	2	6	583334	583339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640867
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12555	NC_022444	TGC	2	6	583446	583451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640867
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12563	NC_022444	TCCT	2	8	583708	583715	0 %	50 %	0 %	50 %	545640867
12564	NC_022444	GGCC	2	8	583716	583723	0 %	0 %	50 %	50 %	545640867
12565	NC_022444	GCCTG	2	10	583734	583743	0 %	20 %	40 %	40 %	545640867
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12573	NC_022444	CATC	2	8	583895	583902	25 %	25 %	0 %	50 %	545640867
12574	NC_022444	CCGGC	2	10	583939	583948	0 %	0 %	40 %	60 %	545640867
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12602	NC_022444	CCTGG	2	10	584881	584890	0 %	20 %	40 %	40 %	545640867
12603	NC_022444	TGC	3	9	584925	584933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640867
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12608	NC_022444	AATG	2	8	585041	585048	50 %	25 %	25 %	0 %	545640867
12609	NC_022444	CGT	2	6	585227	585232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640868
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12614	NC_022444	CTT	2	6	585395	585400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640868
12615	NC_022444	CCGTG	2	10	585413	585422	0 %	20 %	40 %	40 %	545640868
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12618	NC_022444	GGCCA	2	10	585549	585558	20 %	0 %	40 %	40 %	545640868
12619	NC_022444	AG	3	6	585567	585572	50 %	0 %	50 %	0 %	545640868
12620	NC_022444	TCA	2	6	585637	585642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640868
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12623	NC_022444	GTT	2	6	585695	585700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545640869
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12626	NC_022444	CGC	2	6	585811	585816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640869
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12629	NC_022444	CGG	2	6	585921	585926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640869
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12631	NC_022444	CAGG	2	8	585958	585965	25 %	0 %	50 %	25 %	545640869
12632	NC_022444	GC	3	6	585995	586000	0 %	0 %	50 %	50 %	545640869
12633	NC_022444	CGC	2	6	586037	586042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640869
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12650	NC_022444	CCCT	2	8	586774	586781	0 %	25 %	0 %	75 %	545640871
12651	NC_022444	GGT	2	6	586813	586818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640871
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12732	NC_022444	CAG	2	6	589681	589686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640873
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12735	NC_022444	CGGCC	2	10	589810	589819	0 %	0 %	40 %	60 %	545640873
12736	NC_022444	GCA	2	6	589860	589865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640873
12737	NC_022444	TAA	2	6	589902	589907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545640873
12738	NC_022444	GCG	2	6	589923	589928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640873
12739	NC_022444	TGCA	2	8	589940	589947	25 %	25 %	25 %	25 %	545640873
12740	NC_022444	CAC	2	6	589960	589965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640873
12741	NC_022444	TTC	2	6	590014	590019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640873
12742	NC_022444	CGG	2	6	590045	590050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640873
12743	NC_022444	CATC	2	8	590055	590062	25 %	25 %	0 %	50 %	545640873
12744	NC_022444	ACC	3	9	590063	590071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640873
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12746	NC_022444	G	7	7	590139	590145	0 %	0 %	100 %	0 %	545640873
12747	NC_022444	TGCGG	2	10	590159	590168	0 %	20 %	60 %	20 %	545640873
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12751	NC_022444	AGGC	2	8	590351	590358	25 %	0 %	50 %	25 %	545640874
12752	NC_022444	CGA	2	6	590375	590380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640874
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12755	NC_022444	AGGT	2	8	590482	590489	25 %	25 %	50 %	0 %	545640874
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12767	NC_022444	CAG	3	9	591039	591047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640875
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12774	NC_022444	GCG	2	6	591333	591338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640875
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12781	NC_022444	CACC	2	8	591525	591532	25 %	0 %	0 %	75 %	545640875
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12789	NC_022444	TTC	2	6	592325	592330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545640876
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12844	NC_022444	C	6	6	594821	594826	0 %	0 %	0 %	100 %	545640877
12845	NC_022444	AGC	3	9	594842	594850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640877
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12847	NC_022444	GCGACA	2	12	594864	594875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640877
12848	NC_022444	CTG	2	6	594925	594930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640877
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12851	NC_022444	GCT	2	6	595082	595087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640877
12852	NC_022444	CCA	3	9	595089	595097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640877
12853	NC_022444	CGT	2	6	595104	595109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640877
12854	NC_022444	CCA	2	6	595110	595115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640877
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12974	NC_022444	GGC	2	6	600170	600175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640879
12975	NC_022444	C	6	6	600205	600210	0 %	0 %	0 %	100 %	545640879
12976	NC_022444	GAA	2	6	600249	600254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545640879
12977	NC_022444	GGA	2	6	600275	600280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545640879
12978	NC_022444	CGGCCG	2	12	600394	600405	0 %	0 %	50 %	50 %	545640879
12979	NC_022444	GGGC	2	8	600434	600441	0 %	0 %	75 %	25 %	545640879
12980	NC_022444	ATG	2	6	600451	600456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545640879
12981	NC_022444	TGG	2	6	600457	600462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640879
12982	NC_022444	AGC	2	6	600517	600522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640879
12983	NC_022444	GCC	2	6	600576	600581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640879
12984	NC_022444	TGCC	2	8	600589	600596	0 %	25 %	25 %	50 %	545640879
12985	NC_022444	TGC	2	6	600607	600612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640879
12986	NC_022444	AGG	2	6	600652	600657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545640879
12987	NC_022444	TGG	2	6	600658	600663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545640879
12988	NC_022444	TCA	2	6	600714	600719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545640880
12989	NC_022444	GTC	2	6	600736	600741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640880
12990	NC_022444	GGC	4	12	600793	600804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640880
12991	NC_022444	GCC	2	6	600842	600847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640880
12992	NC_022444	CAG	2	6	600931	600936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545640880
12993	NC_022444	CAC	3	9	600943	600951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545640880
12994	NC_022444	CCT	2	6	601029	601034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545640880
12995	NC_022444	CGC	2	6	601039	601044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640880
12996	NC_022444	CGC	2	6	601093	601098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545640880
12997	NC_022444	ATGCGC	2	12	601187	601198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545640880
12998	NC_022444	GCT	2	6	601248	601253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545640880
12999	NC_022444	GGC	2	6	601264	601269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545640880
13000	NC_022444	GCGG	2	8	601279	601286	0 %	0 %	75 %	25 %	545640880

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