MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio gigas DSM 1382 = ATCC 19364 genome

Total Repeats: 80559

< Previous12...150151152153154155156157158159160161162Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
80501	NC_022444	T	7	7	3691084	3691090	0 %	100 %	0 %	0 %	545643628
80502	NC_022444	GGC	2	6	3691111	3691116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643628
80503	NC_022444	AG	3	6	3691351	3691356	50 %	0 %	50 %	0 %	545643629
80504	NC_022444	CTG	2	6	3691398	3691403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643629
80505	NC_022444	CGG	2	6	3691457	3691462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643629
80506	NC_022444	GC	3	6	3691523	3691528	0 %	0 %	50 %	50 %	545643629
80507	NC_022444	GAT	2	6	3691542	3691547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643629
80508	NC_022444	CCA	2	6	3691577	3691582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643629
80509	NC_022444	TGGAGA	2	12	3691607	3691618	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	545643629
80510	NC_022444	CGG	2	6	3691631	3691636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643629
80511	NC_022444	GGA	2	6	3691659	3691664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545643629
80512	NC_022444	GTA	3	9	3691689	3691697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643629
80513	NC_022444	ACCG	2	8	3691739	3691746	25 %	0 %	25 %	50 %	545643629
80514	NC_022444	ACCAG	2	10	3691753	3691762	40 %	0 %	20 %	40 %	545643629
80515	NC_022444	CAT	2	6	3691766	3691771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643629
80516	NC_022444	GCTGGA	2	12	3691773	3691784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	545643629
80517	NC_022444	GAT	2	6	3691875	3691880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643629
80518	NC_022444	TCG	2	6	3691951	3691956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643629
80519	NC_022444	CG	3	6	3692043	3692048	0 %	0 %	50 %	50 %	545643629
80520	NC_022444	CGT	2	6	3692078	3692083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545643629
80521	NC_022444	GCA	2	6	3692086	3692091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643629
80522	NC_022444	AGAC	2	8	3692112	3692119	50 %	0 %	25 %	25 %	545643629
80523	NC_022444	CAT	2	6	3692181	3692186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545643629
80524	NC_022444	CAG	2	6	3692406	3692411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643630
80525	NC_022444	AGG	2	6	3692418	3692423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545643630
80526	NC_022444	GGA	2	6	3692460	3692465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545643630
80527	NC_022444	CCG	2	6	3692698	3692703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643631
80528	NC_022444	CCT	2	6	3692731	3692736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643631
80529	NC_022444	AAG	2	6	3692805	3692810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545643631
80530	NC_022444	TGG	2	6	3692839	3692844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643631
80531	NC_022444	GCCA	2	8	3692847	3692854	25 %	0 %	25 %	50 %	545643631
80532	NC_022444	CCG	2	6	3692893	3692898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545643631
80533	NC_022444	CTT	2	6	3692951	3692956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643631
80534	NC_022444	CCA	2	6	3693010	3693015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545643631
80535	NC_022444	CTT	2	6	3693032	3693037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545643631
80536	NC_022444	CGA	2	6	3693057	3693062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643631
80537	NC_022444	AGT	2	6	3693088	3693093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545643631
80538	NC_022444	GGT	2	6	3693122	3693127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643631
80539	NC_022444	CCAG	2	8	3693130	3693137	25 %	0 %	25 %	50 %	545643631
80540	NC_022444	CTC	2	6	3693167	3693172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643631
80541	NC_022444	CGG	2	6	3693204	3693209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643631
80542	NC_022444	TCCA	2	8	3693225	3693232	25 %	25 %	0 %	50 %	545643631
80543	NC_022444	CCT	2	6	3693247	3693252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545643631
80544	NC_022444	GC	3	6	3693266	3693271	0 %	0 %	50 %	50 %	545643631
80545	NC_022444	GCTGGC	2	12	3693275	3693286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	545643631
80546	NC_022444	AATG	2	8	3693393	3693400	50 %	25 %	25 %	0 %	545643632
80547	NC_022444	A	7	7	3693401	3693407	100 %	0 %	0 %	0 %	545643632
80548	NC_022444	CGA	2	6	3693459	3693464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545643632
80549	NC_022444	A	6	6	3693511	3693516	100 %	0 %	0 %	0 %	545643632
80550	NC_022444	A	7	7	3693529	3693535	100 %	0 %	0 %	0 %	545643632
80551	NC_022444	TC	3	6	3693569	3693574	0 %	50 %	0 %	50 %	545643632
80552	NC_022444	GA	3	6	3693603	3693608	50 %	0 %	50 %	0 %	545643632
80553	NC_022444	CT	3	6	3693611	3693616	0 %	50 %	0 %	50 %	545643632
80554	NC_022444	CGG	2	6	3693642	3693647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643632
80555	NC_022444	GCG	2	6	3693657	3693662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643632
80556	NC_022444	GGT	2	6	3693663	3693668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545643632
80557	NC_022444	GCG	2	6	3693708	3693713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545643632
80558	NC_022444	A	8	8	3693725	3693732	100 %	0 %	0 %	0 %	545643632
80559	NC_022444	A	6	6	3693745	3693750	100 %	0 %	0 %	0 %	545643632

< Previous12...150151152153154155156157158159160161162Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.